seq1 = pF1KB9948.tfa, 2019 bp
seq2 = pF1KB9948/gi568815582f_23736176.tfa (gi568815582f:23736176_24314813), 578638 bp

>pF1KB9948 2019
>gi568815582f:23736176_24314813 (Chr16)

1-173  (100001-100173)   99% ->
174-205  (101200-101231)   100% ==
289-400  (295961-296072)   100% ->
401-529  (299244-299372)   100% ->
530-686  (356616-356772)   100% ->
687-821  (357988-358122)   100% ->
822-918  (376798-376894)   100% ->
919-1065  (387660-387806)   100% ->
1066-1239  (418509-418682)   100% ->
1240-1331  (436095-436186)   100% ->
1332-1394  (438343-438405)   100% ->
1395-1533  (444615-444753)   100% ->
1534-1614  (448936-449016)   100% ->
1615-1722  (449285-449392)   100% ->
1723-1863  (454915-455055)   100% ->
1864-2019  (478483-478638)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGACCCGGCTGCGGGGCCGCCGCCGAGCGAGGGCGAGGAGAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGACCCGGCTGCGGGGCCGCCGCCGAGCGAGGGCGAGGAGAGCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGTGCGCTTCGCCCGCAAAGGCGCCCTCAGGCAGAAGAACGTGCATGAGG
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 100051 CGTGCGCTTCGCCCGCAAAGGCGCCCTCCGGCAGAAGAACGTGCATGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAAGAACCACAAATTCACCGCCCGCTTCTTCAAGCAGCCCACCTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCAAGAACCACAAATTCACCGCCCGCTTCTTCAAGCAGCCCACCTTCTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCCACTGCACCGACTTCATCTG         GGGCTTCGGGAAGCAGGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100151 AGCCACTGCACCGACTTCATCTGGTG...CAGGGGCTTCGGGAAGCAGGG

    200     .    :
    192 ATTCCAGTGCCAAG
        ||||||||||||||
 101218 ATTCCAGTGCCAAG

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    289 GACCCCCGCAGCAAACACAAGTTTAAGATCCACACGTACTCCAGCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 295961 GACCCCCGCAGCAAACACAAGTTTAAGATCCACACGTACTCCAGCCCCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    339 GTTTTGTGACCACTGTGGGTCACTGCTGTATGGACTCATCCACCAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 296011 GTTTTGTGACCACTGTGGGTCACTGCTGTATGGACTCATCCACCAGGGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    389 TGAAATGTGACA         CCTGCATGATGAATGTGCACAAGCGCTGC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 296061 TGAAATGTGACAGTA...CAGCCTGCATGATGAATGTGCACAAGCGCTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    430 GTGATGAATGTTCCCAGCCTGTGTGGCACGGACCACACGGAGCGCCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 299273 GTGATGAATGTTCCCAGCCTGTGTGGCACGGACCACACGGAGCGCCGCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    480 CCGCATCTACATCCAGGCCCACATCGACAGGGACGTCCTCATTGTCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 299323 CCGCATCTACATCCAGGCCCACATCGACAGGGACGTCCTCATTGTCCTCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    530          TAAGAGATGCTAAAAACCTTGTACCTATGGACCCCAATGGC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 299373 GTA...CAGTAAGAGATGCTAAAAACCTTGTACCTATGGACCCCAATGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    571 CTGTCAGATCCCTACGTAAAACTGAAACTGATTCCCGATCCCAAAAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 356657 CTGTCAGATCCCTACGTAAAACTGAAACTGATTCCCGATCCCAAAAGTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    621 GAGCAAACAGAAGACCAAAACCATCAAATGCTCCCTCAACCCTGAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 356707 GAGCAAACAGAAGACCAAAACCATCAAATGCTCCCTCAACCCTGAGTGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    671 ATGAGACATTTAGATT         TCAGCTGAAAGAATCGGACAAAGAC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 356757 ATGAGACATTTAGATTGTA...CAGTCAGCTGAAAGAATCGGACAAAGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    712 AGAAGACTGTCAGTAGAGATTTGGGATTGGGATTTGACCAGCAGGAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 358013 AGAAGACTGTCAGTAGAGATTTGGGATTGGGATTTGACCAGCAGGAATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    762 CTTCATGGGATCTTTGTCCTTTGGGATTTCTGAACTTCAGAAAGCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 358063 CTTCATGGGATCTTTGTCCTTTGGGATTTCTGAACTTCAGAAAGCCAGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    812 TTGATGGCTG         GTTTAAGTTACTGAGCCAGGAGGAAGGCGAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 358113 TTGATGGCTGGTA...CAGGTTTAAGTTACTGAGCCAGGAGGAAGGCGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    853 TACTTCAATGTGCCTGTGCCACCAGAAGGAAGTGAGGCCAATGAAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 376829 TACTTCAATGTGCCTGTGCCACCAGAAGGAAGTGAGGCCAATGAAGAACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    903 GCGGCAGAAATTTGAG         AGGGCCAAGATCAGTCAGGGAACCA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 376879 GCGGCAGAAATTTGAGGTG...CAGAGGGCCAAGATCAGTCAGGGAACCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    944 AGGTCCCGGAAGAAAAGACGACCAACACTGTCTCCAAATTTGACAACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 387685 AGGTCCCGGAAGAAAAGACGACCAACACTGTCTCCAAATTTGACAACAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    994 GGCAACAGAGACCGGATGAAACTGACCGATTTTAACTTCCTAATGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 387735 GGCAACAGAGACCGGATGAAACTGACCGATTTTAACTTCCTAATGGTGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1044 GGGGAAAGGCAGCTTTGGCAAG         GTCATGCTTTCAGAACGAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 387785 GGGGAAAGGCAGCTTTGGCAAGGTA...CAGGTCATGCTTTCAGAACGAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1085 AAGGCACAGATGAGCTCTATGCTGTGAAGATCCTGAAGAAGGACGTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 418528 AAGGCACAGATGAGCTCTATGCTGTGAAGATCCTGAAGAAGGACGTTGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1135 ATCCAAGATGATGACGTGGAGTGCACTATGGTGGAGAAGCGGGTGTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 418578 ATCCAAGATGATGACGTGGAGTGCACTATGGTGGAGAAGCGGGTGTTGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1185 CCTGCCTGGGAAGCCGCCCTTCCTGACCCAGCTCCACTCCTGCTTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 418628 CCTGCCTGGGAAGCCGCCCTTCCTGACCCAGCTCCACTCCTGCTTCCAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1235 CCATG         GACCGCCTGTACTTTGTGATGGAGTACGTGAATGGG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 418678 CCATGGTA...CAGGACCGCCTGTACTTTGTGATGGAGTACGTGAATGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1276 GGCGACCTCATGTATCACATCCAGCAAGTCGGCCGGTTCAAGGAGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 436131 GGCGACCTCATGTATCACATCCAGCAAGTCGGCCGGTTCAAGGAGCCCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1326 TGCTGT         ATTTTACGCTGCAGAAATTGCCATCGGTCTGTTCT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 436181 TGCTGTGTA...CAGATTTTACGCTGCAGAAATTGCCATCGGTCTGTTCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1367 TCTTACAGAGTAAGGGCATCATTTACCG         TGACCTAAAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 438378 TCTTACAGAGTAAGGGCATCATTTACCGGTA...TAGTGACCTAAAACTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1408 GACAACGTGATGCTCGATTCTGAGGGACACATCAAGATTGCCGATTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 444628 GACAACGTGATGCTCGATTCTGAGGGACACATCAAGATTGCCGATTTTGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1458 CATGTGTAAGGAAAACATCTGGGATGGGGTGACAACCAAGACATTCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 444678 CATGTGTAAGGAAAACATCTGGGATGGGGTGACAACCAAGACATTCTGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1508 GCACTCCAGACTACATCGCCCCCGAG         ATAATTGCTTATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 444728 GCACTCCAGACTACATCGCCCCCGAGGTG...TAGATAATTGCTTATCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1549 CCCTATGGGAAGTCCGTGGATTGGTGGGCATTTGGAGTCCTGCTGTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 448951 CCCTATGGGAAGTCCGTGGATTGGTGGGCATTTGGAGTCCTGCTGTATGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1599 AATGTTGGCTGGGCAG         GCACCCTTTGAAGGGGAGGATGAAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 449001 AATGTTGGCTGGGCAGGTA...CAGGCACCCTTTGAAGGGGAGGATGAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1640 ATGAACTCTTCCAATCCATCATGGAACACAACGTAGCCTATCCCAAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 449310 ATGAACTCTTCCAATCCATCATGGAACACAACGTAGCCTATCCCAAGTCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1690 ATGTCCAAGGAAGCTGTGGCCATCTGCAAAGGG         CTGATGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 449360 ATGTCCAAGGAAGCTGTGGCCATCTGCAAAGGGGTA...AAGCTGATGAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1731 CAAACACCCAGGCAAACGTCTGGGTTGTGGACCTGAAGGCGAACGTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 454923 CAAACACCCAGGCAAACGTCTGGGTTGTGGACCTGAAGGCGAACGTGATA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1781 TCAAAGAGCATGCATTTTTCCGGTATATTGATTGGGAGAAACTTGAACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 454973 TCAAAGAGCATGCATTTTTCCGGTATATTGATTGGGAGAAACTTGAACGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1831 AAAGAGATCCAGCCCCCTTATAAGCCAAAAGCT         TGTGGGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 455023 AAAGAGATCCAGCCCCCTTATAAGCCAAAAGCTGTA...TAGTGTGGGCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1872 AAATGCTGAAAACTTCGACCGATTTTTCACCCGCCATCCACCAGTCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 478491 AAATGCTGAAAACTTCGACCGATTTTTCACCCGCCATCCACCAGTCCTAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1922 CACCTCCCGACCAGGAAGTCATCAGGAATATTGACCAATCAGAATTCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 478541 CACCTCCCGACCAGGAAGTCATCAGGAATATTGACCAATCAGAATTCGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1972 GGATTTTCCTTTGTTAACTCTGAATTTTTAAAACCCGAAGTCAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 478591 GGATTTTCCTTTGTTAACTCTGAATTTTTAAAACCCGAAGTCAAGAGC