seq1 = pF1KB9947.tfa, 1593 bp
seq2 = pF1KB9947/gi568815583r_72099653.tfa (gi568815583r:72099653_72319097), 219445 bp

>pF1KB9947 1593
>gi568815583r:72099653_72319097 (Chr15)

(complement)

1-154  (100001-100154)   100% ->
155-246  (101598-101689)   100% ->
247-378  (108620-108751)   100% ->
379-565  (109239-109425)   100% ->
566-836  (110207-110477)   100% ->
837-987  (111821-111971)   100% ->
988-1140  (112218-112370)   100% ->
1141-1307  (116478-116644)   100% ->
1308-1489  (118443-118624)   100% ->
1490-1593  (119342-119445)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGAAGCCCCATAGTGAAGCCGGGACTGCCTTCATTCAGACCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGAAGCCCCATAGTGAAGCCGGGACTGCCTTCATTCAGACCCAGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCACGCAGCCATGGCTGACACATTCCTGGAGCACATGTGCCGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGCACGCAGCCATGGCTGACACATTCCTGGAGCACATGTGCCGCCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACATTGATTCACCACCCATCACAGCCCGGAACACTGGCATCATCTGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACATTGATTCACCACCCATCACAGCCCGGAACACTGGCATCATCTGTACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTG         GCCCAGCTTCCCGATCAGTGGAGACGTTGAAGGAGAT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATTGGTG...TAGGCCCAGCTTCCCGATCAGTGGAGACGTTGAAGGAGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GATTAAGTCTGGAATGAATGTGGCTCGTCTGAACTTCTCTCATGGAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101635 GATTAAGTCTGGAATGAATGTGGCTCGTCTGAACTTCTCTCATGGAACTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATGAG         TACCATGCGGAGACCATCAAGAATGTGCGCACAGCC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101685 ATGAGGTG...CAGTACCATGCGGAGACCATCAAGAATGTGCGCACAGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACGGAAAGCTTTGCTTCTGACCCCATCCTCTACCGGCCCGTTGCTGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108656 ACGGAAAGCTTTGCTTCTGACCCCATCCTCTACCGGCCCGTTGCTGTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCTAGACACTAAAGGACCTGAGATCCGAACTGGGCTCATCAAGGGC    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 108706 TCTAGACACTAAAGGACCTGAGATCCGAACTGGGCTCATCAAGGGCGTG.

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    379      AGCGGCACTGCAGAGGTGGAGCTGAAGAAGGGAGCCACTCTCAAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108756 ..TAGAGCGGCACTGCAGAGGTGGAGCTGAAGAAGGGAGCCACTCTCAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAACATCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109284 ATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAACATCCTGTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCTGGACTACAAGAACATCTGCAAGGTGGTGGAAGTGGGCAGCAAGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109334 GCTGGACTACAAGAACATCTGCAAGGTGGTGGAAGTGGGCAGCAAGATCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACGTGGATGATGGGCTTATTTCTCTCCAGGTGAAGCAGAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 109384 ACGTGGATGATGGGCTTATTTCTCTCCAGGTGAAGCAGAAAGGTA...CA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    566  GTGCCGACTTCCTGGTGACGGAGGTGGAAAATGGTGGCTCCTTGGGCAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110206 GGTGCCGACTTCCTGGTGACGGAGGTGGAAAATGGTGGCTCCTTGGGCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CAAGAAGGGTGTGAACCTTCCTGGGGCTGCTGTGGACTTGCCTGCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110256 CAAGAAGGGTGTGAACCTTCCTGGGGCTGCTGTGGACTTGCCTGCTGTGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CGGAGAAGGACATCCAGGATCTGAAGTTTGGGGTCGAGCAGGATGTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110306 CGGAGAAGGACATCCAGGATCTGAAGTTTGGGGTCGAGCAGGATGTTGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ATGGTGTTTGCGTCATTCATCCGCAAGGCATCTGATGTCCATGAAGTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110356 ATGGTGTTTGCGTCATTCATCCGCAAGGCATCTGATGTCCATGAAGTTAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GAAGGTCCTGGGAGAGAAGGGAAAGAACATCAAGATTATCAGCAAAATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110406 GAAGGTCCTGGGAGAGAAGGGAAAGAACATCAAGATTATCAGCAAAATCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGAATCATGAGGGGGTTCGGAG         GTTTGATGAAATCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 110456 AGAATCATGAGGGGGTTCGGAGGCA...CAGGTTTGATGAAATCCTGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GCCAGTGATGGGATCATGGTGGCTCGTGGTGATCTAGGCATTGAGATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111840 GCCAGTGATGGGATCATGGTGGCTCGTGGTGATCTAGGCATTGAGATTCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TGCAGAGAAGGTCTTCCTTGCTCAGAAGATGATGATTGGACGGTGCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111890 TGCAGAGAAGGTCTTCCTTGCTCAGAAGATGATGATTGGACGGTGCAACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GAGCTGGGAAGCCTGTCATCTGTGCTACTCAG         ATGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 111940 GAGCTGGGAAGCCTGTCATCTGTGCTACTCAGGCA...CAGATGCTGGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AGCATGATCAAGAAGCCCCGCCCCACTCGGGCTGAAGGCAGTGATGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112227 AGCATGATCAAGAAGCCCCGCCCCACTCGGGCTGAAGGCAGTGATGTGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CAATGCAGTCCTGGATGGAGCCGACTGCATCATGCTGTCTGGAGAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112277 CAATGCAGTCCTGGATGGAGCCGACTGCATCATGCTGTCTGGAGAAACAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CCAAAGGGGACTATCCTCTGGAGGCTGTGCGCATGCAGCACCTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 112327 CCAAAGGGGACTATCCTCTGGAGGCTGTGCGCATGCAGCACCTGGTG...

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1141    ATTGCCCGTGAGGCAGAGGCTGCCATCTACCACTTGCAATTATTTGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116475 TAGATTGCCCGTGAGGCAGAGGCTGCCATCTACCACTTGCAATTATTTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GGAACTCCGCCGCCTGGCGCCCATTACCAGCGACCCCACAGAAGCCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116525 GGAACTCCGCCGCCTGGCGCCCATTACCAGCGACCCCACAGAAGCCACCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CCGTGGGTGCCGTGGAGGCCTCCTTCAAGTGCTGCAGTGGGGCCATAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116575 CCGTGGGTGCCGTGGAGGCCTCCTTCAAGTGCTGCAGTGGGGCCATAATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GTCCTCACCAAGTCTGGCAG         GTCTGCTCACCAGGTGGCCAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 116625 GTCCTCACCAAGTCTGGCAGGTA...CAGGTCTGCTCACCAGGTGGCCAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 ATACCGCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118464 ATACCGCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CTCGTCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118514 CTCGTCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTGGACCTCCGGGTGAACTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118564 CCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTGGACCTCCGGGTGAACTTTGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 CATGAATGTTG         GCAAGGCCCGAGGCTTCTTCAAGAAGGGAG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 118614 CATGAATGTTGGTA...CAGGCAAGGCCCGAGGCTTCTTCAAGAAGGGAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 ATGTGGTCATTGTGCTGACCGGATGGCGCCCTGGCTCCGGCTTCACCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119372 ATGTGGTCATTGTGCTGACCGGATGGCGCCCTGGCTCCGGCTTCACCAAC

   1650     .    :    .    :
   1570 ACCATGCGTGTTGTTCCTGTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||
 119422 ACCATGCGTGTTGTTCCTGTGCCG