seq1 = pF1KB9925.tfa, 1038 bp
seq2 = pF1KB9925/gi568815588r_100052134.tfa (gi568815588r:100052134_100285620), 233487 bp

>pF1KB9925 1038
>gi568815588r:100052134_100285620 (Chr10)

(complement)

1-107  (100001-100107)   100% ->
108-189  (101784-101865)   100% ->
190-236  (106374-106420)   100% ->
237-298  (107427-107488)   100% ->
299-424  (109551-109676)   100% ->
425-498  (111340-111413)   100% ->
499-557  (118215-118273)   100% ->
558-649  (121526-121617)   100% ->
650-739  (129387-129476)   100% ->
740-819  (130682-130761)   100% ->
820-1038  (133269-133487)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTCAAGCCCGGGTTCTGGTGGCTGCAGTGGTGGGGTTGGTGGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTCAAGCCCGGGTTCTGGTGGCTGCAGTGGTGGGGTTGGTGGCTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCTCTACGCCTCCATCCACAAGATTGAGGAGGGCCATCTGGCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGCTCTACGCCTCCATCCACAAGATTGAGGAGGGCCATCTGGCTGTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTACAG         GGGAGGAGCTTTACTAACTAGCCCCAGTGGACCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTACAGGTG...CAGGGGAGGAGCTTTACTAACTAGCCCCAGTGGACCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCTATCATATCATGTTGCCTTTCATTACTACGTTCAGATCTGTGCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 101818 GGCTATCATATCATGTTGCCTTTCATTACTACGTTCAGATCTGTGCAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    190        ACAACACTACAAACTGATGAAGTTAAAAATGTGCCTTGTGGAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101868 G...TAGACAACACTACAAACTGATGAAGTTAAAAATGTGCCTTGTGGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAAG         TGGTGGGGTCATGATCTATATTGACCGAATAGAAGTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106417 CAAGGTA...TAGTGGTGGGGTCATGATCTATATTGACCGAATAGAAGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GTTAATATGTTGGCTCCTTATGCAG         TGTTTGATATCGTGAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 107464 GTTAATATGTTGGCTCCTTATGCAGGTA...CAGTGTTTGATATCGTGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GAACTATACTGCAGATTATGACAAGACCTTAATCTTCAATAAAATCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109567 GAACTATACTGCAGATTATGACAAGACCTTAATCTTCAATAAAATCCACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATGAGCTGAACCAGTTCTGCAGTGCCCACACACTTCAGGAAGTTTACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109617 ATGAGCTGAACCAGTTCTGCAGTGCCCACACACTTCAGGAAGTTTACATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GAATTGTTTG         ATCAAATAGATGAAAACCTGAAGCAAGCTCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 109667 GAATTGTTTGGTA...CAGATCAAATAGATGAAAACCTGAAGCAAGCTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GCAGAAAGACTTAAACCTCATGGCCCCAGGTCTCACTATACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 111371 GCAGAAAGACTTAAACCTCATGGCCCCAGGTCTCACTATACAGGTA...T

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    499   GCTGTGCGTGTTACAAAACCCAAAATCCCAGAAGCCATAAGAAGAAAT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118213 AGGCTGTGCGTGTTACAAAACCCAAAATCCCAGAAGCCATAAGAAGAAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 TTTGAGTTAAT         GGAGGCTGAGAAGACAAAACTCCTTATAGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 118263 TTTGAGTTAATGTG...CAGGGAGGCTGAGAAGACAAAACTCCTTATAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 TGCACAGAAACAAAAGGTTGTGGAAAAAGAAGCTGAGACAGAGAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121556 TGCACAGAAACAAAAGGTTGTGGAAAAAGAAGCTGAGACAGAGAGGAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 AGGCAGTTATAG         AAGCAGAGAAGATTGCACAAGTGGCAAAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 121606 AGGCAGTTATAGGTA...TAGAAGCAGAGAAGATTGCACAAGTGGCAAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 ATTCGGTTTCAGCAGAAAGTGATGGAAAAAGAAACTGAAAAGCGCATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129416 ATTCGGTTTCAGCAGAAAGTGATGGAAAAAGAAACTGAAAAGCGCATTTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 TGAAATCGAAG         ATGCTGCATTCCTGGCCCGAGAGAAAGCGA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 129466 TGAAATCGAAGGTA...TAGATGCTGCATTCCTGGCCCGAGAGAAAGCGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 AAGCAGATGCTGAATATTATGCTGCACACAAATATGCCACCTCAAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130712 AAGCAGATGCTGAATATTATGCTGCACACAAATATGCCACCTCAAACAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820          CACAAGTTGACCCCGGAATATCTGGAGCTCAAAAAGTACCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130762 GTG...CAGCACAAGTTGACCCCGGAATATCTGGAGCTCAAAAAGTACCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 GGCCATTGCTTCTAACAGTAAGATCTATTTTGGCAGCAACATCCCTAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133310 GGCCATTGCTTCTAACAGTAAGATCTATTTTGGCAGCAACATCCCTAACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 TGTTCGTGGACTCCTCATGTGCTTTGAAATATTCAGATATTAGGACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133360 TGTTCGTGGACTCCTCATGTGCTTTGAAATATTCAGATATTAGGACTGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 AGAGAAAGCTCACTCCCCTCTAAGGAGGCTCTTGAACCCTCTGGAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133410 AGAGAAAGCTCACTCCCCTCTAAGGAGGCTCTTGAACCCTCTGGAGAGAA

   1100     .    :    .    :    .
   1011 CGTCATCCAAAACAAAGAGAGCACAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||
 133460 CGTCATCCAAAACAAAGAGAGCACAGGT