seq1 = pF1KB9913.tfa, 855 bp
seq2 = pF1KB9913/gi568815584r_34416313.tfa (gi568815584r:34416313_34639628), 223316 bp

>pF1KB9913 855
>gi568815584r:34416313_34639628 (Chr14)

(complement)

1-74  (100001-100074)   100% ->
75-256  (103354-103535)   100% ->
257-352  (106090-106185)   100% ->
353-470  (110154-110271)   100% ->
471-581  (114822-114932)   100% ->
582-855  (123043-123316)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCGGCTTCCGGATGACTACGACCCCTACGCGGTTGAAGAGCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACCGGCTTCCGGATGACTACGACCCCTACGCGGTTGAAGAGCCTAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACGAGGAGCCGGCTTTGAGCAG         CTCTGAGGATGAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100051 CGACGAGGAGCCGGCTTTGAGCAGGTG...TAGCTCTGAGGATGAAGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGTGCTTTTACATGGAACTCCTGACCAAAAACGAAAACTCATCAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103371 ATGTGCTTTTACATGGAACTCCTGACCAAAAACGAAAACTCATCAGAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGTCTTACCGGAGAAAGTGAATCATCTAGTGAAGATGAATTTGAAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103421 TGTCTTACCGGAGAAAGTGAATCATCTAGTGAAGATGAATTTGAAAAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GATGGAAGCTGAATTAAATTCTACCATGAAAACAATGGAGGACAAGTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103471 GATGGAAGCTGAATTAAATTCTACCATGAAAACAATGGAGGACAAGTTAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCTCTCTGGGAACTG         GATCTTCCTCAGGAAATGGAAAAGTT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 103521 CCTCTCTGGGAACTGGTA...TAGGATCTTCCTCAGGAAATGGAAAAGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCAACAGCTCCGACAAGGTACTACGATGATATATATTTTGATTCTGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106116 GCAACAGCTCCGACAAGGTACTACGATGATATATATTTTGATTCTGATTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGAGGATGAAGACAGAGCAG         TACAGGTGACCAAGAAAAAAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 106166 CGAGGATGAAGACAGAGCAGGTA...TAGTACAGGTGACCAAGAAAAAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGAAGAAACAACACAAGATTCCAACAAATGACGAATTACTGTATGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110175 AGAAGAAACAACACAAGATTCCAACAAATGACGAATTACTGTATGATCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAAAAGATAACAGAGATCAGGCCTGGGTTGATGCACAGAGAAGGGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 110225 GAAAAAGATAACAGAGATCAGGCCTGGGTTGATGCACAGAGAAGGGGGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    471       TTACCATGGTTTGGGACCACAGAGATCACGTCAACAACAGCCTG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110275 ...TAGTTACCATGGTTTGGGACCACAGAGATCACGTCAACAACAGCCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTCCAAATAGTGATGCTGTCTTGAATTGTCCTGCCTGCATGACCACACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114866 TTCCAAATAGTGATGCTGTCTTGAATTGTCCTGCCTGCATGACCACACTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TGCCTTGATTGCCAAAG         GCATGAATCATACAAAACTCAATA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 114916 TGCCTTGATTGCCAAAGGTA...TAGGCATGAATCATACAAAACTCAATA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TAGAGCAATGTTTGTAATGAATTGTTCTATTAACAAAGAGGAGGTTCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123067 TAGAGCAATGTTTGTAATGAATTGTTCTATTAACAAAGAGGAGGTTCTAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GATATAAAGCCTCAGAGAACAGGAAGAAAAGGCGGGTCCATAAGAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123117 GATATAAAGCCTCAGAGAACAGGAAGAAAAGGCGGGTCCATAAGAAGATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AGGTCTAACCGGGAAGATGCTGCTGAGAAGGCAGAGACAGATGTGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 123167 AGGTCTAACCGGGAAGATGCTGCCGAGAAGGCAGAGACAGATGTGGAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AATCTATCACCCAGTCATGTGCACTGAATGTTCCACTGAAGTGGCAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123217 AATCTATCACCCAGTCATGTGCACTGAATGTTCCACTGAAGTGGCAGTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACGACAAGGATGAAGTCTTTCATTTTTTCAATGTTTTAGCAAGCCATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123267 ACGACAAGGATGAAGTCTTTCATTTTTTCAATGTTTTAGCAAGCCATTCC