seq1 = pF1KB9891.tfa, 1401 bp
seq2 = pF1KB9891/gi568815580r_47741830.tfa (gi568815580r:47741830_47996756), 254927 bp

>pF1KB9891 1401
>gi568815580r:47741830_47996756 (Chr18)

(complement)

1-236  (100001-100236)   100% ->
237-326  (126193-126282)   100% ->
327-520  (127321-127514)   100% ->
521-655  (128300-128434)   100% ->
656-730  (131624-131698)   100% ->
731-784  (145430-145483)   100% ->
785-997  (148070-148282)   100% ->
998-1135  (150957-151094)   100% ->
1136-1280  (151273-151417)   100% ->
1281-1401  (154807-154927)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGTCCATCTTGCCATTCACGCCGCCAGTTGTGAAGAGACTGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGTCCATCTTGCCATTCACGCCGCCAGTTGTGAAGAGACTGCTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATGGAAGAAGTCAGCTGGTGGGTCTGGAGGAGCAGGCGGAGGAGAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATGGAAGAAGTCAGCTGGTGGGTCTGGAGGAGCAGGCGGAGGAGAGCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGGGCAGGAAGAAAAGTGGTGTGAGAAAGCAGTGAAAAGTCTGGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGGGCAGGAAGAAAAGTGGTGTGAGAAAGCAGTGAAAAGTCTGGTGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGCTAAAGAAAACAGGACGATTAGATGAGCTTGAGAAAGCCATCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGCTAAAGAAAACAGGACGATTAGATGAGCTTGAGAAAGCCATCACCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCAAAACTGTAATACTAAATGTGTTACCATACCAAG         CACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100201 TCAAAACTGTAATACTAAATGTGTTACCATACCAAGGTA...CAGCACTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCTCTGAAATTTGGGGACTGAGTACACCAAATACGATAGATCAGTGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126198 GCTCTGAAATTTGGGGACTGAGTACACCAAATACGATAGATCAGTGGGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACAACAGGCCTTTACAGCTTCTCTGAACAAACCAG         GTCTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 126248 ACAACAGGCCTTTACAGCTTCTCTGAACAAACCAGGTG...CAGGTCTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGATGGTCGTCTCCAGGTATCCCATCGAAAAGGATTGCCACATGTTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127327 TGATGGTCGTCTCCAGGTATCCCATCGAAAAGGATTGCCACATGTTATAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATTGCCGATTATGGCGCTGGCCTGATCTTCACAGTCATCATGAACTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127377 ATTGCCGATTATGGCGCTGGCCTGATCTTCACAGTCATCATGAACTCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCAATTGAAAACTGCGAATATGCTTTTAATCTTAAAAAGGATGAAGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127427 GCAATTGAAAACTGCGAATATGCTTTTAATCTTAAAAAGGATGAAGTATG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGTAAACCCTTACCACTATCAGAGAGTTGAGACACCAG         TTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 127477 TGTAAACCCTTACCACTATCAGAGAGTTGAGACACCAGGTA...CAGTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGCCTCCAGTATTAGTGCCCCGACACACCGAGATCCTAACAGAACTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128303 TGCCTCCAGTATTAGTGCCCCGACACACCGAGATCCTAACAGAACTTCCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CCTCTGGATGACTATACTCACTCCATTCCAGAAAACACTAACTTCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128353 CCTCTGGATGACTATACTCACTCCATTCCAGAAAACACTAACTTCCCAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AGGAATTGAGCCACAGAGTAATTATATTCCAG         AAACGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 128403 AGGAATTGAGCCACAGAGTAATTATATTCCAGGTA...TAGAAACGCCAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CTCCTGGATATATCAGTGAAGATGGAGAAACAAGTGACCAACAGTTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131633 CTCCTGGATATATCAGTGAAGATGGAGAAACAAGTGACCAACAGTTGAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CAAAGTATGGACACAG         GCTCTCCAGCAGAACTATCTCCTAC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 131683 CAAAGTATGGACACAGGTA...TAGGCTCTCCAGCAGAACTATCTCCTAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TACTCTTTCCCCTGTTAATCATAGCTTGG         ATTTACAGCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 145455 TACTCTTTCCCCTGTTAATCATAGCTTGGGTA...CAGATTTACAGCCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TTACTTACTCAGAACCTGCATTTTGGTGTTCGATAGCATATTATGAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148082 TTACTTACTCAGAACCTGCATTTTGGTGTTCGATAGCATATTATGAATTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AATCAGAGGGTTGGAGAAACCTTCCATGCATCACAGCCCTCACTCACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148132 AATCAGAGGGTTGGAGAAACCTTCCATGCATCACAGCCCTCACTCACTGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AGATGGCTTTACAGACCCATCAAATTCAGAGAGGTTCTGCTTAGGTTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148182 AGATGGCTTTACAGACCCATCAAATTCAGAGAGGTTCTGCTTAGGTTTAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TCTCCAATGTTAACCGAAATGCCACGGTAGAAATGACAAGAAGGCATATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148232 TCTCCAATGTTAACCGAAATGCCACGGTAGAAATGACAAGAAGGCATATA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 G         GAAGAGGAGTGCGCTTATACTACATAGGTGGGGAAGTTTT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148282 GGTA...CAGGAAGAGGAGTGCGCTTATACTACATAGGTGGGGAAGTTTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TGCTGAGTGCCTAAGTGATAGTGCAATCTTTGTGCAGAGCCCCAATTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150997 TGCTGAGTGCCTAAGTGATAGTGCAATCTTTGTGCAGAGCCCCAATTGTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ATCAGAGATATGGCTGGCACCCTGCAACAGTGTGTAAAATTCCACCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 151047 ATCAGAGATATGGCTGGCACCCTGCAACAGTGTGTAAAATTCCACCAGGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1136        GCTGTAATCTGAAGATCTTCAACAACCAGGAATTTGCTGCTCT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151097 A...TAGGCTGTAATCTGAAGATCTTCAACAACCAGGAATTTGCTGCTCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TCTGGCTCAGTCTGTTAATCAGGGTTTTGAAGCCGTCTATCAGCTAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151316 TCTGGCTCAGTCTGTTAATCAGGGTTTTGAAGCCGTCTATCAGCTAACTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GAATGTGCACCATAAGAATGAGTTTTGTGAAAGGGTGGGGAGCAGAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151366 GAATGTGCACCATAAGAATGAGTTTTGTGAAAGGGTGGGGAGCAGAATAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CG         AAGGCAGACGGTAACAAGTACTCCTTGCTGGATTGAACT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151416 CGGTA...CAGAAGGCAGACGGTAACAAGTACTCCTTGCTGGATTGAACT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TCATCTGAATGGACCTCTACAGTGGTTGGACAAAGTATTAACTCAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154846 TCATCTGAATGGACCTCTACAGTGGTTGGACAAAGTATTAACTCAGATGG

   1450     .    :    .    :    .    :
   1370 GATCCCCTTCAGTGCGTTGCTCAAGCATGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 154896 GATCCCCTTCAGTGCGTTGCTCAAGCATGTCA