seq1 = pF1KB9887.tfa, 2259 bp
seq2 = pF1KB9887/gi568815580r_46933006.tfa (gi568815580r:46933006_47135264), 202259 bp

>pF1KB9887 2259
>gi568815580r:46933006_47135264 (Chr18)

(complement)

1-2259  (100001-102259)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCAGGGTCCACTACGCTGCACGCAGTGGAGAAGCTGCAGGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCAGGGTCCACTACGCTGCACGCAGTGGAGAAGCTGCAGGTGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTGGCCACTAAGACGGAGCCGAAAAAGCTAGAGAAATATTTGCAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTGGCCACTAAGACGGAGCCGAAAAAGCTAGAGAAATATTTGCAGAAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTCCGCCTTGCCCATGACGGCAGACATCCTGGCGGAGACTGGAATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTCCGCCTTGCCCATGACGGCAGACATCCTGGCGGAGACTGGAATCAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGACGGTGAAGCGCCTGCGGAAGCACCAGCACGTGGGCGACTTTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGACGGTGAAGCGCCTGCGGAAGCACCAGCACGTGGGCGACTTTGCCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGACTTAGCGGCCCGGTGGAAGAAGCTGGTGCTCGTGGACCGAAACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGACTTAGCGGCCCGGTGGAAGAAGCTGGTGCTCGTGGACCGAAACACCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCCTGGCCCACAGGACCCTGAGGAGAGCGCTTCCCGACAGCGCTTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGCCTGGCCCACAGGACCCTGAGGAGAGCGCTTCCCGACAGCGCTTCGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGGCTCTTCAGGACCAGGAAAAGGCCTGGGGCTTCCCAGAAAACGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGGCTCTTCAGGACCAGGAAAAGGCCTGGGGCTTCCCAGAAAACGCGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCCCCCAGGAGCCCATCTCACAGCCCTGAGCACAGACGGACAGCACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCCCCCAGGAGCCCATCTCACAGCCCTGAGCACAGACGGACAGCACGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GAACACCTCCGGGGCAACAGAGACCTCACCCGAGGTCTCACAGTCGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GAACACCTCCGGGGCAACAGAGACCTCACCCGAGGTCTCACAGTCGCGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCCAGAGCTGAGAGAAAGTGCCCCAGAATAGCCCCAGCTGATTCCGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCCAGAGCTGAGAGAAAGTGCCCCAGAATAGCCCCAGCTGATTCCGGCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTATCGGGCCTCTCCAACGCGCACAGCTCCCCTCCGGATGCCCGAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTATCGGGCCTCTCCAACGCGCACAGCTCCCCTCCGGATGCCCGAGGGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGAGCCCGCTGCGCCCGGGAAGCAACCCGGAAGAGGCCACACTCACGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTGAGCCCGCTGCGCCCGGGAAGCAACCCGGAAGAGGCCACACTCACGCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCTCAGGGCGGGCCTCTGCTGTGTCCAGGCTGCCAGGGCCAACCCCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCTCAGGGCGGGCCTCTGCTGTGTCCAGGCTGCCAGGGCCAACCCCAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GAAAGCCGTTGTGAGCCACAGCAAGGGGCACAAATCGTCTCGCCAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GAAAGCCGTTGTGAGCCACAGCAAGGGGCACAAATCGTCTCGCCAGGAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AACGCCCCTTGTGTGCCCAGGGAGATTGGCACTCCCCTACTTTGATCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AACGCCCCTTGTGTGCCCAGGGAGATTGGCACTCCCCTACTTTGATCAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GAGAAATCATGCGGGGCCTGCTTAAGAGAGGAAACCCCAAGGATGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAGAAATCATGCGGGGCCTGCTTAAGAGAGGAAACCCCAAGGATGCCCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTGGGCAAGTGCCAGGGACAGGCAGCCTTCGGACTTCAAGACAGACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTGGGCAAGTGCCAGGGACAGGCAGCCTTCGGACTTCAAGACAGACAAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AAGGGGGGCAAGCTGGCAGCGGCCAGCGTGTCCCTGCCTTGGAGGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AAGGGGGGCAAGCTGGCAGCGGCCAGCGTGTCCCTGCCTTGGAGGAGGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCAGACAGTCACCAGAAGAGGCCTCAGCACAGTCACTCGAACAAGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCAGACAGTCACCAGAAGAGGCCTCAGCACAGTCACTCGAACAAGAAGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCCCAGTCTAGACGGCCGGGACCCAGGAAATGGGACACACGGCCTGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCCCAGTCTAGACGGCCGGGACCCAGGAAATGGGACACACGGCCTGTCGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCGAGGAGAAAGAGCAGCTTTCCAACGACCGGGAGACTCAAGAGGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 101001 CCGAGGAGAAAGAGCAGCTTTCCAACGACCGAGAGACTCAAGAGGGGAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CCACCGACTGCTCATTTGGACAGAACGTCCGTGAGCTCCCTCTCTGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CCACCGACTGCTCATTTGGACAGAACGTCCGTGAGCTCCCTCTCTGAGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGAGGAGGTAGATATGGCTGAGGAATTCGAGCAGCCCACTCTGTCATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGAGGAGGTAGATATGGCTGAGGAATTCGAGCAGCCCACTCTGTCATGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AAAAATACCTCACCTACGATCAGTTGCGGAAGCAAAAGAAAAAGACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AAAAATACCTCACCTACGATCAGTTGCGGAAGCAAAAGAAAAAGACTGGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AAATCTGCCACCACTGCACTTGGAGATAAACAAAGGAAAGCAAACGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AAATCTGCCACCACTGCACTTGGAGATAAACAAAGGAAAGCAAACGAATC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CAAGGGCACTCGTGAGTCCTGGGATTCGGCTAAGAAATTGCCTCCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CAAGGGCACTCGTGAGTCCTGGGATTCGGCTAAGAAATTGCCTCCTGTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AGGAAAGCCAGTCAGAGAGGCTGCAGGCGGCCGGCGCTGATTCCGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AGGAAAGCCAGTCAGAGAGGCTGCAGGCGGCCGGCGCTGATTCCGCCGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CCGAAAACGGTGCCCAGCCATGTCTTCTCAGAGCTCTGGGACCTCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CCGAAAACGGTGCCCAGCCATGTCTTCTCAGAGCTCTGGGACCTCTCAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GGCCTGGATGCAGGCCAACTACGATCCGCTTTCGGATTCTGACTCCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GGCCTGGATGCAGGCCAACTACGATCCGCTTTCGGATTCTGACTCCATGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CCTCCCAGGCAAAGCCAGAAGCACTCTCTTCACCAAAGTTCCGGGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CCTCCCAGGCAAAGCCAGAAGCACTCTCTTCACCAAAGTTCCGGGAGGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 GCTGCTTTCCCTGGACGCAGAGTGAATGCTAAGATGCCGGTGTACTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 GCTGCTTTCCCTGGACGCAGAGTGAATGCTAAGATGCCGGTGTACTCGGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CTCCAGGCCTGCCTGCCAGCTCCAGGTGCCGACGCTGCGCCAGCAGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 CTCCAGGCCTGCCTGCCAGCTCCAGGTGCCGACGCTGCGCCAGCAGTGTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 CCCAGGTGCTTAGAAACAATCCGGACGCCCTCAGCGACGTGGGAGAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 CCCAGGTGCTTAGAAACAATCCGGACGCCCTCAGCGACGTGGGAGAGGTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 CCCTACTGGGTTCTTGAACCTGTTCTGGAAGGGTGGAGGCCCGATCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 CCCTACTGGGTTCTTGAACCTGTTCTGGAAGGGTGGAGGCCCGATCAGCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 GTATCGCAGAAAGAAAGACAATCACGCACTCGTTAGAGAGACAGACGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 GTATCGCAGAAAGAAAGACAATCACGCACTCGTTAGAGAGACAGACGAAT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 TACGGAGGAATCATTGTTTCCAGGACTTCAAGGAAGAAAAGCCACAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 TACGGAGGAATCATTGTTTCCAGGACTTCAAGGAAGAAAAGCCACAGGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 AACAAAACTTGGAGGGAGCAGTACCTGCGGCTTCCGGACGCCCCAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 AACAAAACTTGGAGGGAGCAGTACCTGCGGCTTCCGGACGCCCCAGAGCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 GCGGCTGAGAGTAATGACAACGAATATCCGATCTGCACGTGGAAACAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 GCGGCTGAGAGTAATGACAACGAATATCCGATCTGCACGTGGAAACAACC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 CCAACGGCAGAGAGGCAAAGATGATCTGTTTCAAATCTGTGGCCAAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 CCAACGGCAGAGAGGCAAAGATGATCTGTTTCAAATCTGTGGCCAAGACG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 CCTTATGATACTTCAAGGAGGCAAGAGAAGTCTGCAGGAGACGCTGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 CCTTATGATACTTCAAGGAGGCAAGAGAAGTCTGCAGGAGACGCTGACCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 CGAAAATGGGGAGATCAAGCCAGCCTCCAAGCCCGCGGGAAGCAGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 CGAAAATGGGGAGATCAAGCCAGCCTCCAAGCCCGCGGGAAGCAGCCACA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 CTCCCTCCAGCCAGAGCAGCAGCGGCGGTGGCAGAGACAGCAGCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 CTCCCTCCAGCCAGAGCAGCAGCGGCGGTGGCAGAGACAGCAGCAGCAGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 ATCCTTCGCTGGCTCCCTGAGAAGCGGGCCAACCCCTGCCTGAGCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 ATCCTTCGCTGGCTCCCTGAGAAGCGGGCCAACCCCTGCCTGAGCAGCAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 CAATGAGCACGCGGCGCCCGCGGCCAAAACCCGGAAACAGGCTGCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 CAATGAGCACGCGGCGCCCGCGGCCAAAACCCGGAAACAGGCTGCCAAGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 AAGTGGCCCCGCTGATGGCCAAGGCAATTCGAGACTACAAGAGAAGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 AAGTGGCCCCGCTGATGGCCAAGGCAATTCGAGACTACAAGAGAAGATTC

   2250     .
   2251 TCCCGACGA
        |||||||||
 102251 TCCCGACGA