seq1 = pF1KB9886.tfa, 2175 bp
seq2 = pF1KB9886/gi568815597r_231235571.tfa (gi568815597r:231235571_231437745), 202175 bp

>pF1KB9886 2175
>gi568815597r:231235571_231437745 (Chr1)

(complement)

1-2175  (100001-102175)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGATGGCGATGTCGGACAGTGGGGCGAGCCGCCTGCGTCGGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGATGGCGATGTCGGACAGTGGGGCGAGCCGCCTGCGTCGGCAGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGTCAGGGGGTTTTGAGGCGCGGCTGTACGTGAAGCAGCTCTCGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGTCAGGGGGTTTTGAGGCGCGGCTGTACGTGAAGCAGCTCTCGCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTCGGATGGGGACCGGGACCTCCAGGAGCACCGGCAGCGCATCCAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTCGGATGGGGACCGGGACCTCCAGGAGCACCGGCAGCGCATCCAGGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGCGGAGGAGACGGCGCAGAACCTGAAGCGCAACGTCTACCAGAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGCGGAGGAGACGGCGCAGAACCTGAAGCGCAACGTCTACCAGAACTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGGCAGTTCATAGAGACGGCCCGCGAGATCTCCTACCTGGAGAGCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGGCAGTTCATAGAGACGGCCCGCGAGATCTCCTACCTGGAGAGCGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGTACCAGCTCAGCCATTTGCTGACCGAGCAGAAAAGCAGCCTGGAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGTACCAGCTCAGCCATTTGCTGACCGAGCAGAAAAGCAGCCTGGAGAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATCCCGCTTACGTTGCTGCCTGCCGCTGCTGCCGCCGGAGCCGCCGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATCCCGCTTACGTTGCTGCCTGCCGCTGCTGCCGCCGGAGCCGCCGCCGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTCTGGAGGGGAGGAGGGAGTCGGTGGGGCGGGGGGCCGAGACCACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTCTGGAGGGGAGGAGGGAGTCGGTGGGGCGGGGGGCCGAGACCACCTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GAGGCCAGGCCGGCTTTTTCTCCACCCCCGGGGGTGCCTCCCGCGACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GAGGCCAGGCCGGCTTTTTCTCCACCCCCGGGGGTGCCTCCCGCGACGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCCGGTCCAGGCGAGGAAGGAAAGCAGCGCACTCTCACCACCCTGCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCCGGTCCAGGCGAGGAAGGAAAGCAGCGCACTCTCACCACCCTGCTTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAAGGTGGAAGGCTGCAGGCATCTGCTGGAGACGCCGGGACAGTACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAAGGTGGAAGGCTGCAGGCATCTGCTGGAGACGCCGGGACAGTACTTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGTACAATGGGGACCTAGTGGAATACGATGCGGACCACATGGCCCAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGTACAATGGGGACCTAGTGGAATACGATGCGGACCACATGGCCCAACTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CAGCGGGTGCACGGCTTTCTCATGAACGATTGCTTGTTGGTGGCTACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CAGCGGGTGCACGGCTTTCTCATGAACGATTGCTTGTTGGTGGCTACCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCTGCCTCAGCGGCGTGGGATGTATCGCTACAACGCTCTCTATTCCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCTGCCTCAGCGGCGTGGGATGTATCGCTACAACGCTCTCTATTCCCTAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATGGTTTGGCCGTAGTCAATGTCAAGGACAACCCGCCCATGAAGGACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATGGTTTGGCCGTAGTCAATGTCAAGGACAACCCGCCCATGAAGGACATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCAAGCTGCTTATGTTCCCCGAGAGCCGTATTTTCCAGGCCGAAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCAAGCTGCTTATGTTCCCCGAGAGCCGTATTTTCCAGGCCGAAAATGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TAAAATCAAACGAGAGTGGCTGGAAGTGCTGGAGGACACCAAGAGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TAAAATCAAACGAGAGTGGCTGGAAGTGCTGGAGGACACCAAGAGGGCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCAGTGAGAAAAGGCGAAGGGAGCAGGAGGAGGCAGCGGCCCCTCGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCAGTGAGAAAAGGCGAAGGGAGCAGGAGGAGGCAGCGGCCCCTCGAGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCACCCCAAGTGACTTCCAAGGCCACTAACCCATTTGAGGATGACGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCACCCCAAGTGACTTCCAAGGCCACTAACCCATTTGAGGATGACGAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AGAAGAACCAGCTGTTCCTGAGGTAGAGGAAGAGAAGGTGGACCTCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AGAAGAACCAGCTGTTCCTGAGGTAGAGGAAGAGAAGGTGGACCTCTCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGGAATGGATCCAGGAGTTACCTGAAGACCTGGATGTCTGCATTGCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGGAATGGATCCAGGAGTTACCTGAAGACCTGGATGTCTGCATTGCGCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AGAGACTTTGAAGGGGCGGTTGACCTGCTGGATAAATTGAACCATTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AGAGACTTTGAAGGGGCGGTTGACCTGCTGGATAAATTGAACCATTACCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGAAGATAAACCTAGCCCACCTCCTGTAAAAGAACTAAGGGCCAAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGAAGATAAACCTAGCCCACCTCCTGTAAAAGAACTAAGGGCCAAAGTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGGAGCGAGTTCGACAGCTCACTGAGGTGCTAGTTTTCGAACTCTCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGGAGCGAGTTCGACAGCTCACTGAGGTGCTAGTTTTCGAACTCTCCCCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GATCGTTCCCTGAGAGGTGGTCCGAAGGCTACTCGCAGAGCAGTTTCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GATCGTTCCCTGAGAGGTGGTCCGAAGGCTACTCGCAGAGCAGTTTCGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 ACTGATCCGGCTGGGCCAGTGCACGAAGGCCTGTGAGCTATTTTTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 ACTGATCCGGCTGGGCCAGTGCACGAAGGCCTGTGAGCTATTTTTGAGAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ACAGGGCAGCCGCTGTTCATACTGCAATTCGTCAGCTTCGCATCGAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ACAGGGCAGCCGCTGTTCATACTGCAATTCGTCAGCTTCGCATCGAAGGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GCCACTTTACTCTATATTCATAAGCTGTGCCATGTCTTCTTTACCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GCCACTTTACTCTATATTCATAAGCTGTGCCATGTCTTCTTTACCAGCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TCTCGAGACTGCAAGAGAATTTGAGATCGATTTTGCAGGCACTGACAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 TCTCGAGACTGCAAGAGAATTTGAGATCGATTTTGCAGGCACTGACAGCG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 GCTGCTACTCTGCCTTTGTGGTCTGGGCAAGATCAGCCATGGGCATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 GCTGCTACTCTGCCTTTGTGGTCTGGGCAAGATCAGCCATGGGCATGTTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 GTGGATGCTTTTAGCAAGCAGGTGTTTGATAGTAAGGAGAGCCTCTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 GTGGATGCTTTTAGCAAGCAGGTGTTTGATAGTAAGGAGAGCCTCTCTAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 AGCAGCTGAGTGTGTAAAAGTGGCTAAGGAGCATTGCCAGCAACTGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 AGCAGCTGAGTGTGTAAAAGTGGCTAAGGAGCATTGCCAGCAACTGGGTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 ATATCGGACTGGATCTCACCTTCATCATCCATGCCCTTCTGGTGAAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 ATATCGGACTGGATCTCACCTTCATCATCCATGCCCTTCTGGTGAAAGAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 ATCCAAGGGGCCTTGCACAGTTACAAAGAAATCATCATTGAAGCCACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 ATCCAAGGGGCCTTGCACAGTTACAAAGAAATCATCATTGAAGCCACTAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 ACATCGCAACTCTGAAGAGATGTGGAGGAGGATGAACTTGATGACGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 ACATCGCAACTCTGAAGAGATGTGGAGGAGGATGAACTTGATGACGCCAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 AAGCCCTGGGTAAGCTCAAAGAAGAGATGAAAAGTTGTGGGGTAAGTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 AAGCCCTGGGTAAGCTCAAAGAAGAGATGAAAAGTTGTGGGGTAAGTAAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 TTTGAGCAGTACACAGGGGATGACTGCTGGGTGAACCTAAGTTACACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 TTTGAGCAGTACACAGGGGATGACTGCTGGGTGAACCTAAGTTACACAGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 GGTTGCTTTCACCAAACAGACCATGGGCTTCTTGGAAGAGGCCCTGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 GGTTGCTTTCACCAAACAGACCATGGGCTTCTTGGAAGAGGCCCTGAAGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 TGTATTTCCCAGAGCTGCACATGGTACTTTTGGAGAGCCTGGTGGAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 TGTATTTCCCAGAGCTGCACATGGTACTTTTGGAGAGCCTGGTGGAAATC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 ATTTTGGTTGCTGTTCAGCATGTGGATTATAGTCTTCGATGTGAGCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 ATTTTGGTTGCTGTTCAGCATGTGGATTATAGTCTTCGATGTGAGCAGGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 TCCAGAGAAGAAAGCTTTTATCAGACAGAATGCATCCTTTTTATATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 TCCAGAGAAGAAAGCTTTTATCAGACAGAATGCATCCTTTTTATATGAAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 CAGTCCTCCCTGTGGTGGAGAAAAGGTTTGAAGAAGGTGTGGGGAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 CAGTCCTCCCTGTGGTGGAGAAAAGGTTTGAAGAAGGTGTGGGGAAACCT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 GCCAAGCAACTCCAAGATCTGAGGAATGCATCTAGACTTATTCGTGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 GCCAAGCAACTCCAAGATCTGAGGAATGCATCTAGACTTATTCGTGTGAA

   2150     .    :    .    :    .
   2151 TCCTGAAAGTACAACATCAGTGGTC
        |||||||||||||||||||||||||
 102151 TCCTGAAAGTACAACATCAGTGGTC