seq1 = pF1KB9877.tfa, 1638 bp
seq2 = pF1KB9877/gi568815580r_47023928.tfa (gi568815580r:47023928_47129842), 105915 bp

>pF1KB9877 1638
>gi568815580r:47023928_47129842 (Chr18)

(complement)

1-1638  (100001-101638)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCAGGGTCCACTACGCTGCGCGCAGTGGGGAAGCTGCAGGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCAGGGTCCACTACGCTGCGCGCAGTGGGGAAGCTGCAGGTGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTGGCCACTAAGACGGAGCCGAAAAAGCTAGAGAAATATTTGCAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTGGCCACTAAGACGGAGCCGAAAAAGCTAGAGAAATATTTGCAGAAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTCCGCCTTGCCCATGACCGCAGACATCCTGGCGGAGACTGGAATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTCCGCCTTGCCCATGACCGCAGACATCCTGGCGGAGACTGGAATCAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGACGGTGAAGCGCCTGCGGAAGCACCAGCACGTGGGCGACTTTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGACGGTGAAGCGCCTGCGGAAGCACCAGCACGTGGGCGACTTTGCCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGACTTAGCGGCCCGGTGGAAGAAGCTGGTGCTCGTGGACCGAAACACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGACTTAGCGGCCCGGTGGAAGAAGCTGGTGCTCGTGGACCGAAACACCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCCTGACCCGCAGGACCCTGAGGAGAGCGCTTCCCGACAGCGCTTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGCCTGACCCGCAGGACCCTGAGGAGAGCGCTTCCCGACAGCGCTTCGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGGCTCTTCAGGAGCGGGAAAAGGCCTGGGGCTTCCCAGAAAACGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGGCTCTTCAGGAGCGGGAAAAGGCCTGGGGCTTCCCAGAAAACGCGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCCCCCAGGAGCCCATCTCACAGCCCTGAGCACAGACGGACAGCACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCCCCCAGGAGCCCATCTCACAGCCCTGAGCACAGACGGACAGCACGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GAACACCTCCGGGGCAACAGAGACCTCACCCGAGGTCTCCCAGTCGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GAACACCTCCGGGGCAACAGAGACCTCACCCGAGGTCTCCCAGTCGCGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCCAGAGCCGAGAGAAAGCGCCCCAGAATGGCCCCAGCTGATTCCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCCAGAGCCGAGAGAAAGCGCCCCAGAATGGCCCCAGCTGATTCCGGCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCATCGGGACCCTCCAACGCGCACCGCTCCCCTCCCGATGCCCGAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCATCGGGACCCTCCAACGCGCACCGCTCCCCTCCCGATGCCCGAGGGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGAGCCCGCTGTGCCCGGGGAGCAACCCGGAAGAGGCCACGCTCACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTGAGCCCGCTGTGCCCGGGGAGCAACCCGGAAGAGGCCACGCTCACGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCTCAGGGCGGGCCTCTGCTGGGTCAAGGCTGCCAGGGCCAACCCCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCTCAGGGCGGGCCTCTGCTGGGTCAAGGCTGCCAGGGCCAACCCCAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGAAGCGGTGGGGAGCCACAGCAAGGGGCACAAATCGTCCCGCGGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGAAGCGGTGGGGAGCCACAGCAAGGGGCACAAATCGTCCCGCGGGGCTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CGGCTCAGAAATCGCCTCCTGTCCAGGAAAGCCAGTCAGAGAGGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CGGCTCAGAAATCGCCTCCTGTCCAGGAAAGCCAGTCAGAGAGGCTGCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCGGCCGGCGCTGATTCCGCCGGGCCGAAAACGGTGCCCAGCCATGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCGGCCGGCGCTGATTCCGCCGGGCCGAAAACGGTGCCCAGCCATGTCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTCGGAGCTCTGGGACCCCTCAGAGGCCTGGATGCAGGCCAACTACGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTCGGAGCTCTGGGACCCCTCAGAGGCCTGGATGCAGGCCAACTACGATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCTGTCCGCTTTTGAGGCCATGACCTCCCAGGCAAACCCAGAAGCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCTGTCCGCTTTTGAGGCCATGACCTCCCAGGCAAACCCAGAAGCACTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TCCGCGCCAACGCTCCAGGAGGAAGCTGCTTTCCCTGGACGCAGAGTGAA
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TCCGCGCCAGCGCTCCAGGAGGAAGCTGCTTTCCCTGGACGCAGAGTGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CGCTAAGATGCCGGTGTACTCGGGCTCCAGGCCTGCCTGCCAGCTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CGCTAAGATGCCGGTGTACTCGGGCTCCAGGCCTGCCTGCCAGCTCCAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGCCGACGCTGCGCCAGCAGTGCCTCCGGGTGCCTAGGAACAATCCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGCCGACGCTGCGCCAGCAGTGCCTCCGGGTGCCTAGGAACAATCCGGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GCCCTCGGCGACGTGGAAGGGGTCCCCTACTCGGTTCTTGAACCCGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GCCCTCGGCGACGTGGAAGGGGTCCCCTACTCGGTTCTTGAACCCGTTCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGAAGGGTGGACGCCCGATCAGCCGTACCGCACAGAGAAAGACAATGCCG
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGAAGGGTGGACGCCCGATCAGCTGTACCGCACAGAGAAAGACAATGCCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CACTCGCTCGAGAGACAGATGAATTATGGAGGATTCATTGCCTCCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CACTCGCTCGAGAGACAGATGAATTATGGAGGATTCATTGCCTCCAGGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TTCAAGGAAGAAAAGCCACAGGAGCACGAGTCTTGGCGGGAGCTGTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TTCAAGGAAGAAAAGCCACAGGAGCACGAGTCTTGGCGGGAGCTGTACCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GCGGCTTCGGGACGCCCGAGAGCAGCGGCTGCGAGTAGTGACCACGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GCGGCTTCGGGACGCCCGAGAGCAGCGGCTGCGAGTAGTGACCACGAAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TCCGATCCGCACGTGAAAACAAACCCAGCGGCCGACAGACAAAGATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 TCCGATCCGCACGTGAAAACAAACCCAGCGGCCGACAGACAAAGATGATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TGTTTCAACTCTGTGGCCAAGACGCCTTATGATGCTTCCAGGAGGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TGTTTCAACTCTGTGGCCAAGACGCCTTATGATGCTTCCAGGAGGCAAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GAAGTCTGCAGGAGCCGCTGACCCCGGAAATGGAGAGATGGAGCCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GAAGTCTGCAGGAGCCGCTGACCCCGGAAATGGAGAGATGGAGCCAGCCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CCAAGCCCGCAGGAAGCAGCCAGGCTCCCTCCGGCCTCGGGGACGGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CCAAGCCCGCAGGAAGCAGCCAGGCTCCCTCCGGCCTCGGGGACGGCGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 GGCGGCAGCGTGAGCGGCGGCGGCAGCAGCAACCGGCACGCGGCGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 GGCGGCAGCGTGAGCGGCGGCGGCAGCAGCAACCGGCACGCGGCGCCCGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GGACAAAACCCGAAAACAGGCTGCCAAGAAAGTGGCCCCGCTGATGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GGACAAAACCCGAAAACAGGCTGCCAAGAAAGTGGCCCCGCTGATGGCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .
   1601 AGGCAATTCGAGACTACAAGGGAAGATTCTCCCGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 AGGCAATTCGAGACTACAAGGGAAGATTCTCCCGACGA