Result of SIM4 for pF1KB9877

seq1 = pF1KB9877.tfa, 1638 bp
seq2 = pF1KB9877/gi568815580r_46862771.tfa (gi568815580r:46862771_46968697), 105927 bp

>pF1KB9877 1638
>gi568815580r:46862771_46968697 (Chr18)

(complement)

1-1638  (4290-5927)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCAGGGTCCACTACGCTGCGCGCAGTGGGGAAGCTGCAGGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4290 ATGGCGGCAGGGTCCACTACGCTGCGCGCAGTGGGGAAGCTGCAGGTGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTGGCCACTAAGACGGAGCCGAAAAAGCTAGAGAAATATTTGCAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4340 TCTGGCCACTAAGACGGAGCCGAAAAAGCTAGAGAAATATTTGCAGAAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTCCGCCTTGCCCATGACCGCAGACATCCTGGCGGAGACTGGAATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4390 TCTCCGCCTTGCCCATGACCGCAGACATCCTGGCGGAGACTGGAATCAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGACGGTGAAGCGCCTGCGGAAGCACCAGCACGTGGGCGACTTTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4440 AAGACGGTGAAGCGCCTGCGGAAGCACCAGCACGTGGGCGACTTTGCCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGACTTAGCGGCCCGGTGGAAGAAGCTGGTGCTCGTGGACCGAAACACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4490 AGACTTAGCGGCCCGGTGGAAGAAGCTGGTGCTCGTGGACCGAAACACCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCCTGACCCGCAGGACCCTGAGGAGAGCGCTTCCCGACAGCGCTTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4540 GGCCTGACCCGCAGGACCCTGAGGAGAGCGCTTCCCGACAGCGCTTCGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGGCTCTTCAGGAGCGGGAAAAGGCCTGGGGCTTCCCAGAAAACGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4590 GAGGCTCTTCAGGAGCGGGAAAAGGCCTGGGGCTTCCCAGAAAACGCGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCCCCCAGGAGCCCATCTCACAGCCCTGAGCACAGACGGACAGCACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4640 GGCCCCCAGGAGCCCATCTCACAGCCCTGAGCACAGACGGACAGCACGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GAACACCTCCGGGGCAACAGAGACCTCACCCGAGGTCTCCCAGTCGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4690 GAACACCTCCGGGGCAACAGAGACCTCACCCGAGGTCTCCCAGTCGCGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCCAGAGCCGAGAGAAAGCGCCCCAGAATGGCCCCAGCTGATTCCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4740 CCCAGAGCCGAGAGAAAGCGCCCCAGAATGGCCCCAGCTGATTCCGGCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCATCGGGACCCTCCAACGCGCACCGCTCCCCTCCCGATGCCCGAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4790 CCATCGGGACCCTCCAACGCGCACCGCTCCCCTCCCGATGCCCGAGGGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGAGCCCGCTGTGCCCGGGGAGCAACCCGGAAGAGGCCACGCTCACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4840 CTGAGCCCGCTGTGCCCGGGGAGCAACCCGGAAGAGGCCACGCTCACGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCTCAGGGCGGGCCTCTGCTGGGTCAAGGCTGCCAGGGCCAACCCCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4890 GCTCAGGGCGGGCCTCTGCTGGGTCAAGGCTGCCAGGGCCAACCCCAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGAAGCGGTGGGGAGCCACAGCAAGGGGCACAAATCGTCCCGCGGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4940 GGAAGCGGTGGGGAGCCACAGCAAGGGGCACAAATCGTCCCGCGGGGCTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CGGCTCAGAAATCGCCTCCTGTCCAGGAAAGCCAGTCAGAGAGGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4990 CGGCTCAGAAATCGCCTCCTGTCCAGGAAAGCCAGTCAGAGAGGCTGCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCGGCCGGCGCTGATTCCGCCGGGCCGAAAACGGTGCCCAGCCATGTCTT
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5040 GCGGCCGTCGCTGATTCCGCCGGGCCGAAAACGGTGCCCAGCCATGTCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTCGGAGCTCTGGGACCCCTCAGAGGCCTGGATGCAGGCCAACTACGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5090 CTCGGAGCTCTGGGACCCCTCAGAGGCCTGGATGCAGGCCAACTACGATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCTGTCCGCTTTTGAGGCCATGACCTCCCAGGCAAACCCAGAAGCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5140 TGCTGTCCGCTTTTGAGGCCATGACCTCCCAGGCAAACCCAGAAGCACTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TCCGCGCCAACGCTCCAGGAGGAAGCTGCTTTCCCTGGACGCAGAGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5190 TCCGCGCCAACGCTCCAGGAGGAAGCTGCTTTCCCTGGACGCAGAGTGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CGCTAAGATGCCGGTGTACTCGGGCTCCAGGCCTGCCTGCCAGCTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5240 CGCTAAGATGCCGGTGTACTCGGGCTCCAGGCCTGCCTGCCAGCTCCAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGCCGACGCTGCGCCAGCAGTGCCTCCGGGTGCCTAGGAACAATCCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5290 TGCCGACGCTGCGCCAGCAGTGCCTCCGGGTGCCTAGGAACAATCCGGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GCCCTCGGCGACGTGGAAGGGGTCCCCTACTCGGTTCTTGAACCCGTTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
   5340 GCCCTCGGCGACGTGGAAGGGGTCCCCTACTCGGCTCTTGAACCCGTTCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGAAGGGTGGACGCCCGATCAGCCGTACCGCACAGAGAAAGACAATGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5390 GGAAGGGTGGACGCCCGATCAGCCGTACCGCACAGAGAAAGACAATGCCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CACTCGCTCGAGAGACAGATGAATTATGGAGGATTCATTGCCTCCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5440 CACTCGCTCGAGAGACAGATGAATTATGGAGGATTCATTGCCTCCAGGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TTCAAGGAAGAAAAGCCACAGGAGCACGAGTCTTGGCGGGAGCTGTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5490 TTCAAGGAAGAAAAGCCACAGGAGCACGAGTCTTGGCGGGAGCTGTACCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GCGGCTTCGGGACGCCCGAGAGCAGCGGCTGCGAGTAGTGACCACGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5540 GCGGCTTCGGGACGCCCGAGAGCAGCGGCTGCGAGTAGTGACCACGAAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TCCGATCCGCACGTGAAAACAAACCCAGCGGCCGACAGACAAAGATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5590 TCCGATCCGCACGTGAAAACAAACCCAGCGGCCGACAGACAAAGATGATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TGTTTCAACTCTGTGGCCAAGACGCCTTATGATGCTTCCAGGAGGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5640 TGTTTCAACTCTGTGGCCAAGACGCCTTATGATGCTTCCAGGAGGCAAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GAAGTCTGCAGGAGCCGCTGACCCCGGAAATGGAGAGATGGAGCCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5690 GAAGTCTGCAGGAGCCGCTGACCCCGGAAATGGAGAGATGGAGCCAGCCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CCAAGCCCGCAGGAAGCAGCCAGGCTCCCTCCGGCCTCGGGGACGGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5740 CCAAGCCCGCAGGAAGCAGCCAGGCTCCCTCCGGCCTCGGGGACGGCGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 GGCGGCAGCGTGAGCGGCGGCGGCAGCAGCAACCGGCACGCGGCGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5790 GGCGGCAGCGTGAGCGGCGGCGGCAGCAGCAACCGGCACGCGGCGCCCGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GGACAAAACCCGAAAACAGGCTGCCAAGAAAGTGGCCCCGCTGATGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5840 GGACAAAACCCGAAAACAGGCTGCCAAGAAAGTGGCCCCGCTGATGGCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .
   1601 AGGCAATTCGAGACTACAAGGGAAGATTCTCCCGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5890 AGGCAATTCGAGACTACAAGGGAAGATTCTCCCGACGA

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