seq1 = pF1KB9873.tfa, 1497 bp
seq2 = pF1KB9873/gi568815597r_110503286.tfa (gi568815597r:110503286_110704782), 201497 bp

>pF1KB9873 1497
>gi568815597r:110503286_110704782 (Chr1)

(complement)

1-1497  (100001-101497)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACAGTGGCCACCGGAGACCCAGCAGACGAGGCTGCTGCCCTCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACAGTGGCCACCGGAGACCCAGCAGACGAGGCTGCTGCCCTCCCTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCACCCACAGGACACCTATGACCCAGAGGCAGACCACGAGTGCTGTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCACCCACAGGACACCTATGACCCAGAGGCAGACCACGAGTGCTGTGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGTGGTGATCAACATCTCAGGGCTGCGGTTTGAGACCCAGCTAAAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGTGGTGATCAACATCTCAGGGCTGCGGTTTGAGACCCAGCTAAAGACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTAGCCCAGTTTCCAGAGACCCTCTTAGGGGACCCAAAGAAACGAATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTAGCCCAGTTTCCAGAGACCCTCTTAGGGGACCCAAAGAAACGAATGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTACTTTGACCCCCTCCGAAATGAGTACTTTTTCGATCGGAACCGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTACTTTGACCCCCTCCGAAATGAGTACTTTTTCGATCGGAACCGCCCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTTTGATGCCATTTTGTACTACTACCAGTCAGGGGGCCGATTGAGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCTTTGATGCCATTTTGTACTACTACCAGTCAGGGGGCCGATTGAGGCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCTGTGAATGTGCCCTTAGATATATTCTCTGAAGAAATTCGGTTTTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCTGTGAATGTGCCCTTAGATATATTCTCTGAAGAAATTCGGTTTTATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTGGGAGAAGAAGCGATGGAGATGTTTCGGGAAGATGAAGGCTACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTGGGAGAAGAAGCGATGGAGATGTTTCGGGAAGATGAAGGCTACATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGAGGAAGAGCGTCCTCTGCCTGAAAATGAGTTTCAGAGACAAGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGAGGAAGAGCGTCCTCTGCCTGAAAATGAGTTTCAGAGACAAGTGTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTTCTCTTTGAATACCCAGAGAGCTCAGGGCCTGCCAGGATTATAGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTTCTCTTTGAATACCCAGAGAGCTCAGGGCCTGCCAGGATTATAGCTAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGTGTCTGTCATGGTGATTCTGATCTCAATTGTCAGCTTCTGTCTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGTGTCTGTCATGGTGATTCTGATCTCAATTGTCAGCTTCTGTCTGGAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CATTGCCCATCTTCCGGGATGAGAATGAAGACATGCATGGTAGTGGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CATTGCCCATCTTCCGGGATGAGAATGAAGACATGCATGGTAGTGGGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACCTTCCACACCTATTCCAACAGCACCATCGGGTACCAGCAGTCCACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACCTTCCACACCTATTCCAACAGCACCATCGGGTACCAGCAGTCCACTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTTCACAGACCCTTTCTTCATTGTAGAGACACTCTGCATCATCTGGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTTCACAGACCCTTTCTTCATTGTAGAGACACTCTGCATCATCTGGTTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCTTTGAATTCTTGGTGAGGTTCTTTGCCTGTCCCAGCAAAGCCGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCTTTGAATTCTTGGTGAGGTTCTTTGCCTGTCCCAGCAAAGCCGGCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCACCAACATCATGAACATCATTGACATTGTGGCCATCATCCCCTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCACCAACATCATGAACATCATTGACATTGTGGCCATCATCCCCTACTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CATCACCCTGGGGACAGAGTTGGCTGAGAAGCCAGAGGACGCTCAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CATCACCCTGGGGACAGAGTTGGCTGAGAAGCCAGAGGACGCTCAGCAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCCAGCAGGCCATGTCACTGGCCATCCTCCGTGTCATCCGGTTGGTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCCAGCAGGCCATGTCACTGGCCATCCTCCGTGTCATCCGGTTGGTAAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GTCTTTAGGATTTTCAAGTTGTCCAGACACTCCAAAGGTCTCCAGATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GTCTTTAGGATTTTCAAGTTGTCCAGACACTCCAAAGGTCTCCAGATTCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AGGTCAGACCCTCAAAGCCAGCATGAGAGAATTGGGCCTCCTGATATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AGGTCAGACCCTCAAAGCCAGCATGAGAGAATTGGGCCTCCTGATATTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TTCTCTTCATAGGGGTCATCCTTTTCTCTAGTGCTGTGTATTTTGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TTCTCTTCATAGGGGTCATCCTTTTCTCTAGTGCTGTGTATTTTGCAGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GCCGATGAGCGAGAGTCCCAGTTCCCCAGCATCCCAGATGCCTTCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GCCGATGAGCGAGAGTCCCAGTTCCCCAGCATCCCAGATGCCTTCTGGTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGCAGTCGTCTCCATGACAACTGTAGGCTATGGAGACATGGTTCCGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGCAGTCGTCTCCATGACAACTGTAGGCTATGGAGACATGGTTCCGACTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CCATTGGGGGAAAGATAGTGGGTTCCCTATGTGCGATTGCAGGTGTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CCATTGGGGGAAAGATAGTGGGTTCCCTATGTGCGATTGCAGGTGTGTTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ACTATTGCCTTACCGGTCCCTGTCATTGTGTCCAATTTCAACTACTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ACTATTGCCTTACCGGTCCCTGTCATTGTGTCCAATTTCAACTACTTCTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CCACCGGGAGACAGAGGGAGAGGAACAGGCCCAATACTTGCAAGTGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CCACCGGGAGACAGAGGGAGAGGAACAGGCCCAATACTTGCAAGTGACAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GCTGTCCAAAGATCCCATCCTCCCCTGACCTAAAGAAAAGTAGAAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 GCTGTCCAAAGATCCCATCCTCCCCTGACCTAAAGAAAAGTAGAAGTGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TCTACCATTAGTAAGTCTGATTACATGGAGATCCAGGAGGGTGTAAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TCTACCATTAGTAAGTCTGATTACATGGAGATCCAGGAGGGTGTAAATAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CAGTAATGAGGACTTTAGAGAGGAAAACTTGAAAACAGCCAACTGTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CAGTAATGAGGACTTTAGAGAGGAAAACTTGAAAACAGCCAACTGTACCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1451 TGGCTAACACAAACTATGTGAATATTACCAAAATGTTAACTGATGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 TGGCTAACACAAACTATGTGAATATTACCAAAATGTTAACTGATGTC