seq1 = pF1KB9868.tfa, 1350 bp
seq2 = pF1KB9868/gi568815588f_110978042.tfa (gi568815588f:110978042_111179391), 201350 bp

>pF1KB9868 1350
>gi568815588f:110978042_111179391 (Chr10)

1-1350  (100001-101350)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCTCCCTGCAGCCGGACGCGGGCAACGCGAGCTGGAACGGGACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCTCCCTGCAGCCGGACGCGGGCAACGCGAGCTGGAACGGGACCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGCCGGGGGGCGGCGCCCGGGCCACCCCTTACTCCCTGCAGGTGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGCCGGGGGGCGGCGCCCGGGCCACCCCTTACTCCCTGCAGGTGACGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGACGCTGGTGTGCCTGGCCGGCCTGCTCATGCTGCTCACCGTGTTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGACGCTGGTGTGCCTGGCCGGCCTGCTCATGCTGCTCACCGTGTTCGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AACGTGCTCGTCATCATCGCCGTGTTCACGAGCCGCGCGCTCAAGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AACGTGCTCGTCATCATCGCCGTGTTCACGAGCCGCGCGCTCAAGGCGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCAAAACCTCTTCCTGGTGTCTCTGGCCTCGGCCGACATCCTGGTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCAAAACCTCTTCCTGGTGTCTCTGGCCTCGGCCGACATCCTGGTGGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGCTCGTCATCCCTTTCTCGCTGGCCAACGAGGTCATGGGCTACTGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGCTCGTCATCCCTTTCTCGCTGGCCAACGAGGTCATGGGCTACTGGTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCGGCAAGGCTTGGTGCGAGATCTACCTGGCGCTCGACGTGCTCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCGGCAAGGCTTGGTGCGAGATCTACCTGGCGCTCGACGTGCTCTTCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACGTCGTCCATCGTGCACCTGTGCGCCATCAGCCTGGACCGCTACTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CACGTCGTCCATCGTGCACCTGTGCGCCATCAGCCTGGACCGCTACTGGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCATCACACAGGCCATCGAGTACAACCTGAAGCGCACGCCGCGCCGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCATCACACAGGCCATCGAGTACAACCTGAAGCGCACGCCGCGCCGCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAGGCCATCATCATCACCGTGTGGGTCATCTCGGCCGTCATCTCCTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGGCCATCATCATCACCGTGTGGGTCATCTCGGCCGTCATCTCCTTCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCCGCTCATCTCCATCGAGAAGAAGGGCGGCGGCGGCGGCCCGCAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCCGCTCATCTCCATCGAGAAGAAGGGCGGCGGCGGCGGCCCGCAGCCGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCGAGCCGCGCTGCGAGATCAACGACCAGAAGTGGTACGTCATCTCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCGAGCCGCGCTGCGAGATCAACGACCAGAAGTGGTACGTCATCTCGTCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TGCATCGGCTCCTTCTTCGCTCCCTGCCTCATCATGATCCTGGTCTACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TGCATCGGCTCCTTCTTCGCTCCCTGCCTCATCATGATCCTGGTCTACGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCGCATCTACCAGATCGCCAAGCGTCGCACCCGCGTGCCACCCAGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCGCATCTACCAGATCGCCAAGCGTCGCACCCGCGTGCCACCCAGCCGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGGGTCCGGACGCCGTCGCCGCGCCGCCGGGGGGCACCGAGCGCAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGGGTCCGGACGCCGTCGCCGCGCCGCCGGGGGGCACCGAGCGCAGGCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AACGGTCTGGGCCCCGAGCGCAGCGCGGGCCCGGGGGGCGCAGAGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AACGGTCTGGGCCCCGAGCGCAGCGCGGGCCCGGGGGGCGCAGAGGCCGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ACCGCTGCCCACCCAGCTCAACGGCGCCCCTGGCGAGCCCGCGCCGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 ACCGCTGCCCACCCAGCTCAACGGCGCCCCTGGCGAGCCCGCGCCGGCCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GGCCGCGCGACACCGACGCGCTGGACCTGGAGGAGAGCTCGTCTTCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GGCCGCGCGACACCGACGCGCTGGACCTGGAGGAGAGCTCGTCTTCCGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CACGCCGAGCGGCCTCCAGGGCCCCGCAGACCCGAGCGCGGTCCCCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CACGCCGAGCGGCCTCCAGGGCCCCGCAGACCCGAGCGCGGTCCCCGGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CAAAGGCAAGGCCCGAGCGAGCCAGGTGAAGCCGGGCGACAGCCTGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CAAAGGCAAGGCCCGAGCGAGCCAGGTGAAGCCGGGCGACAGCCTGCCGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GGCGCGGGCCGGGGGCGACGGGGATCGGGACGCCGGCTGCAGGGCCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GGCGCGGGCCGGGGGCGACGGGGATCGGGACGCCGGCTGCAGGGCCGGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAGGAGCGCGTCGGGGCTGCCAAGGCGTCGCGCTGGCGCGGGCGGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAGGAGCGCGTCGGGGCTGCCAAGGCGTCGCGCTGGCGCGGGCGGCAGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CCGCGAGAAGCGCTTCACGTTCGTGCTGGCCGTGGTCATCGGAGTGTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CCGCGAGAAGCGCTTCACGTTCGTGCTGGCCGTGGTCATCGGAGTGTTCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TGGTGTGCTGGTTCCCCTTCTTCTTCACCTACACGCTCACGGCCGTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TGGTGTGCTGGTTCCCCTTCTTCTTCACCTACACGCTCACGGCCGTCGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TGCTCCGTGCCACGCACGCTCTTCAAATTCTTCTTCTGGTTCGGCTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TGCTCCGTGCCACGCACGCTCTTCAAATTCTTCTTCTGGTTCGGCTACTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CAACAGCTCGTTGAACCCGGTCATCTACACCATCTTCAACCACGATTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CAACAGCTCGTTGAACCCGGTCATCTACACCATCTTCAACCACGATTTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GCCGCGCCTTCAAGAAGATCCTCTGTCGGGGGGACAGGAAGCGGATCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 GCCGCGCCTTCAAGAAGATCCTCTGTCGGGGGGACAGGAAGCGGATCGTG