seq1 = pF1KB9866.tfa, 1305 bp
seq2 = pF1KB9866/gi568815585r_20041984.tfa (gi568815585r:20041984_20243288), 201305 bp

>pF1KB9866 1305
>gi568815585r:20041984_20243288 (Chr13)

(complement)

1-1305  (100001-101305)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCGACTGGAGCTTTCTGGGAAGACTCTTAGAAAATGCACAGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCGACTGGAGCTTTCTGGGAAGACTCTTAGAAAATGCACAGGAGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCACGGTCATCGGCAAGGTTTGGCTGACCGTGCTGTTCATCTTCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCCACGGTCATCGGCAAGGTTTGGCTGACCGTGCTGTTCATCTTCCGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTTGGTGCTGGGGGCCGCGGCGGAGGACGTGTGGGGCGATGAGCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTTGGTGCTGGGGGCCGCGGCGGAGGACGTGTGGGGCGATGAGCAGTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACTTCACCTGCAACACCCAGCAGCCGGGCTGCGAGAACGTCTGCTACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACTTCACCTGCAACACCCAGCAGCCGGGCTGCGAGAACGTCTGCTACGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGGGCCTTCCCCATCTCCCACATCCGCTTCTGGGCGCTGCAGATCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGGGCCTTCCCCATCTCCCACATCCGCTTCTGGGCGCTGCAGATCATCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCGTGTCCACGCCCACCCTCATCTACCTGGGCCACGTGCTGCACATCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCGTGTCCACGCCCACCCTCATCTACCTGGGCCACGTGCTGCACATCGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGCATGGAAGAGAAGAAGAAAGAGAGGGAGGAGGAGGAGCAGCTGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGCATGGAAGAGAAGAAGAAAGAGAGGGAGGAGGAGGAGCAGCTGAAGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGAGAGCCCCAGCCCCAAGGAGCCACCGCAGGACAATCCCTCGTCGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGAGAGCCCCAGCCCCAAGGAGCCACCGCAGGACAATCCCTCGTCGCGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACGACCGCGGCAGGGTGCGCATGGCCGGGGCGCTGCTGCGGACCTACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACGACCGCGGCAGGGTGCGCATGGCCGGGGCGCTGCTGCGGACCTACGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTCAACATCATCTTCAAGACGCTGTTCGAGGTGGGCTTCATCGCCGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTCAACATCATCTTCAAGACGCTGTTCGAGGTGGGCTTCATCGCCGGCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTACTTTCTGTACGGCTTCGAGCTGAAGCCGCTCTACCGCTGCGACCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTACTTTCTGTACGGCTTCGAGCTGAAGCCGCTCTACCGCTGCGACCGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGCCCTGCCCCAACACGGTGGACTGCTTCATCTCCAGGCCCACGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGCCCTGCCCCAACACGGTGGACTGCTTCATCTCCAGGCCCACGGAGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACCATCTTCATCATCTTCATGCTGGCGGTGGCCTGCGCGTCCCTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACCATCTTCATCATCTTCATGCTGGCGGTGGCCTGCGCGTCCCTGCTGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CAACATGCTGGAGATCTACCACCTGGGCTGGAAGAAGCTCAAGCAGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CAACATGCTGGAGATCTACCACCTGGGCTGGAAGAAGCTCAAGCAGGGCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGACCAGCCGCCTCGGCCCGGACGCCTCCGAGGCCCCGCTGGGGACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGACCAGCCGCCTCGGCCCGGACGCCTCCGAGGCCCCGCTGGGGACAGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GATCCCCCGCCCCTGCCCCCCAGCTCCCGGCCGCCCGCCGTTGCCATCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GATCCCCCGCCCCTGCCCCCCAGCTCCCGGCCGCCCGCCGTTGCCATCGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GTTCCCACCCTACTATGCGCACACCGCTGCGCCCCTGGGACAGGCCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GTTCCCACCCTACTATGCGCACACCGCTGCGCCCCTGGGACAGGCCCGCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCGTGGGCTACCCCGGGGCCCCGCCACCAGCCGCGGACTTCAAAATGCTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 100851 CCGTGGGCTACCCCGGGGCCCCGCCACCAGCCGCGGACTTCAAACTGCTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCCCTGACCGAGGCGCGCGGAAAGGGCCAGTCCGCCAAGCTCTACAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCCCTGACCGAGGCGCGCGGAAAGGGCCAGTCCGCCAAGCTCTACAACGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCACCACCACCTGCTGATGACTGAGCAGAACTGGGCCAACCAGGCGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCACCACCACCTGCTGATGACTGAGCAGAACTGGGCCAACCAGGCGGCCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGCGGCAGCCCCCGGCACTCAAGGCTTACCCGGCAGCGTCCACGCCTGCA
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGCGGCAGCCCCCGGCGCTCAAGGCTTACCCGGCAGCGTCCACGCCTGCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GCCCCCAGCCCCGTCGGCAGCAGCTCCCCGCCACTCGCGCACGAGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GCCCCCAGCCCCGTCGGCAGCAGCTCCCCGCCACTCGCGCACGAGGCTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGCGGGCGCGGCGCCCCTGCTGCTGGATGGGAGCGGCAGCAGTCTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGCGGGCGCGGCGCCCCTGCTGCTGGATGGGAGCGGCAGCAGTCTGGAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GGAGCGCCCTGGCAGGGACCCCCGAGGAGGAGGAGCAGGCCGTGACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GGAGCGCCCTGGCAGGGACCCCCGAGGAGGAGGAGCAGGCCGTGACCACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GCGGCCCAGATGCACCAGCCGCCCTTGCCCCTCGGAGACCCAGGTCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GCGGCCCAGATGCACCAGCCGCCCTTGCCCCTCGGAGACCCAGGTCGGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CAGCAAGGCCAGCAGGGCCAGCAGCGGGCGGGCCAGACCGGAGGACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CAGCAAGGCCAGCAGGGCCAGCAGCGGGCGGGCCAGACCGGAGGACTTGG

   1300     .
   1301 CCATC
        |||||
 101301 CCATC