seq1 = pF1KB9860.tfa, 1218 bp
seq2 = pF1KB9860/gi568815586r_90853525.tfa (gi568815586r:90853525_91054742), 201218 bp

>pF1KB9860 1218
>gi568815586r:90853525_91054742 (Chr12)

(complement)

1-1218  (100001-101218)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTCAGACCCTCGACACAAGGGAAGACCCTCTGAACCTGGGCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTCAGACCCTCGACACAAGGGAAGACCCTCTGAACCTGGGCGGCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGCGGCGGCGGCTGTGGCTGTGGCTGGGCACACTCGGCCTCCTTGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGCGGCGGCGGCTGTGGCTGTGGCTGGGCACACTCGGCCTCCTTGAGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTGGTCGTCCTGCCATCGAAGGCGCCCGGGTGCTCCAGCGTACAATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTGGTCGTCCTGCCATCGAAGGCGCCCGGGTGCTCCAGCGTACAATAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCGCACCGATATAGCCCCAAGACCGAGTATGGGCCCCCAAGGAAGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCGCACCGATATAGCCCCAAGACCGAGTATGGGCCCCCAAGGAAGCAGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAGCAACAGCACGGCCCGGGCTTTTGGTTCCAACCACCCGTGTGCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAGCAACAGCACGGCCCGGGCTTTTGGTTCCAACCACCCGTGTGCTCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACTGGGGGTGCTGGGGAGGGCCCTGGCGCCCACCCCCTCCAGGATTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACTGGGGGTGCTGGGGAGGGCCCTGGCGCCCACCCCCTCCAGGATTCTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAATTCCCCTGCCCGGTGCAAGTGTTTCGGGTGTATGGCCTGTACCCTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 100301 AAATTCCCCTGCCCGGTGCAAGTGTTTCGGGTGTATGGCCTGCACCCTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTGCTTTTGCTGCTGCTCCTGCTGGAGCGGGTCCTGGAACCCTGGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTGCTTTTGCTGCTGCTCCTGCTGGAGCGGGTCCTGGAACCCTGGCTGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGAAGCCCCCAGGCAGGAAGAAGCGCTGGGGCCGCAGAGGCCGCGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGAAGCCCCCAGGCAGGAAGAAGCGCTGGGGCCGCAGAGGCCGCGGCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGCCACCACCCTCGCCACTCCTACCCGCGGAGCCCGCCAGCGGATGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGCCACCACCCTCGCCACTCCTACCCGCGGAGCCCGCCAGCGGATGTGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CACGCTGCCGCGGCCGGTCAAGCTGTATGAGTGGAGAGAGCCTGGCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CACGCTGCCGCGGCCGGTCAAGCTGTATGAGTGGAGAGAGCCTGGCATGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GAGCGCCGCCCAACACCACCCAATTCATCATGAACCAGATCTACGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GAGCGCCGCCCAACACCACCCAATTCATCATGAACCAGATCTACGAGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATGAGGCAGCAGGAGAAGGTGGAGCGTCAGCAGGAGGCGCTGCGGGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATGAGGCAGCAGGAGAAGGTGGAGCGTCAGCAGGAGGCGCTGCGGGCGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GAAGGCCACGGTGAGCGGCGAGGCCTCCCCAGCCAGATCCTCCGGAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GAAGGCCACGGTGAGCGGCGAGGCCTCCCCAGCCAGATCCTCCGGAAACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACGCGCCCCCTGGCGGCAGCAAGGAAACCTGGGGACTGCAGGAAACTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACGCGCCCCCTGGCGGCAGCAAGGAAACCTGGGGACTGCAGGAAACTCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TATGGCTTTGTGCAGAATCCCTCTCTAGCATTCAGTCCCAACCCAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TATGGCTTTGTGCAGAATCCCTCTCTAGCATTCAGTCCCAACCCAGAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AAACCAGTCTCTTGCCCCGCTGCTGGTGGAAGAAGAGGAGGAGAAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AAACCAGTCTCTTGCCCCGCTGCTGGTGGAAGAAGAGGAGGAGAAGAAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATGATGATGAGGAGGAGTATGACCAGGAGGTGTGTGATGCAAAGGAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATGATGATGAGGAGGAGTATGACCAGGAGGTGTGTGATGCAAAGGAGGCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGCGAGGAGGAAGAAGAGGTCGAAGATGAGGAGGAAGAGGTCGAAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGCGAGGAGGAAGAAGAGGTCGAAGATGAGGAGGAAGAGGTCGAAGATGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGAGGAAGAAGAGGTCGAAGAGGCTGAATATGTGGAGGAGGGAGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGAGGAAGAAGAGGTCGAAGAGGCTGAATATGTGGAGGAGGGAGAGGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGCTGGAAGAGGAGGAGCTGGAAGAGGAAGAGGAGGTCCTGGAGGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGCTGGAAGAGGAGGAGCTGGAAGAGGAAGAGGAGGTCCTGGAGGAGAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAGCAGAGAGGGGAAGAATTTCACTTGCCTCTGGAAATGCCTTTATCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAGCAGAGAGGGGAAGAATTTCACTTGCCTCTGGAAATGCCTTTATCAAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CTTCGTAGAGGCTGAAGAAAAGAGAGAGAACTTTATAAGCTGCACTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CTTCGTAGAGGCTGAAGAAAAGAGAGAGAACTTTATAAGCTGCACTTTTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TAAACCCAGAGCAGATAATTCCCAAAGTGCCACAGGAATCCCTGTTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TAAACCCAGAGCAGATAATTCCCAAAGTGCCACAGGAATCCCTGTTCATG

   1200     .    :    .
   1201 GCACAGGACTTTAACTGT
        ||||||||||||||||||
 101201 GCACAGGACTTTAACTGT