seq1 = pF1KB9850.tfa, 1131 bp
seq2 = pF1KB9850/gi568815597r_23093089.tfa (gi568815597r:23093089_23294219), 201131 bp

>pF1KB9850 1131
>gi568815597r:23093089_23294219 (Chr1)

(complement)

1-1131  (100001-101131)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCCACTGAACCAGTCAGCAGAAGGCCTTCCCCAGGAGGCCTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCCCACTGAACCAGTCAGCAGAAGGCCTTCCCCAGGAGGCCTCCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGATCCCTGAATGCCACAGAAACCTCAGAGGCTTGGGATCCCAGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGATCCCTGAATGCCACAGAAACCTCAGAGGCTTGGGATCCCAGGACCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCAGGCGCTCAAGATCTCCCTTGCCGTGGTCCTTTCCGTCATCACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCAGGCGCTCAAGATCTCCCTTGCCGTGGTCCTTTCCGTCATCACACTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCACAGTCCTCTCCAATGCCTTTGTACTCACCACCATCTTACTCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCACAGTCCTCTCCAATGCCTTTGTACTCACCACCATCTTACTCACCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAGCTCCACACCCCTGCCAACTACCTGATTGGCTCCCTGGCCACCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAGCTCCACACCCCTGCCAACTACCTGATTGGCTCCCTGGCCACCACCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCTCTTGGTTTCCATCTTGGTAATGCCCATCAGCATCGCCTATACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCTCTTGGTTTCCATCTTGGTAATGCCCATCAGCATCGCCTATACCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCCACACCTGGAACTTTGGCCAAATCTTGTGTGACATCTGGCTGTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACCCACACCTGGAACTTTGGCCAAATCTTGTGTGACATCTGGCTGTCCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGACATCACGTGCTGCACAGCCTCCATCCTGCATCTCTGTGTCATTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGACATCACGTGCTGCACAGCCTCCATCCTGCATCTCTGTGTCATTGCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGACAGGTACTGGGCAATCACAGATGCCCTGGAATACAGTAAACGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGACAGGTACTGGGCAATCACAGATGCCCTGGAATACAGTAAACGCAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACGGCTGGCCACGCGGCCACCATGATCGCCATTGTCTGGGCCATCTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ACGGCTGGCCACGCGGCCACCATGATCGCCATTGTCTGGGCCATCTCCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGCATCTCCATCCCCCCGCTCTTCTGGCGGCAGGCCAAGGCCCAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTGCATCTCCATCCCCCCGCTCTTCTGGCGGCAGGCCAAGGCCCAGGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGATGTCGGACTGTCTGGTGAACACCTCTCAGATCTCCTACACCATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGATGTCGGACTGTCTGGTGAACACCTCTCAGATCTCCTACACCATCTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCCACCTGTGGGGCCTTCTACATTCCCTCGGTGTTGCTCATCATCCTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCCACCTGTGGGGCCTTCTACATTCCCTCGGTGTTGCTCATCATCCTATA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGGCCGGATCTACCGGGCTGCCCGGAACCGCATCCTGAATCCACCCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGGCCGGATCTACCGGGCTGCCCGGAACCGCATCCTGAATCCACCCTCAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCTATGGGAAGCGCTTCACCACGGCCCACCTCATCACAGGCTCTGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCTATGGGAAGCGCTTCACCACGGCCCACCTCATCACAGGCTCTGCCGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCCTCGCTCTGCTCGCTCAACTCCAGCCTCCATGAGGGGCACTCGCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCCTCGCTCTGCTCGCTCAACTCCAGCCTCCATGAGGGGCACTCGCACTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGCTGGCTCCCCTCTCTTTTTCAACCACGTGAAAATCAAGCTTGCTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGCTGGCTCCCCTCTCTTTTTCAACCACGTGAAAATCAAGCTTGCTGACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GTGCCCTGGAACGCAAGAGGATTTCTGCTGCTCGAGAAAGGAAAGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GTGCCCTGGAACGCAAGAGGATTTCTGCTGCTCGAGAAAGGAAAGCCACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AAAATCCTGGGCATCATTCTGGGGGCCTTTATCATCTGCTGGCTGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAAATCCTGGGCATCATTCTGGGGGCCTTTATCATCTGCTGGCTGCCCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CTTCGTGGTGTCTCTGGTCCTCCCCATCTGCCGGGACTCCTGCTGGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CTTCGTGGTGTCTCTGGTCCTCCCCATCTGCCGGGACTCCTGCTGGATCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ACCCGGCGCTCTTTGACTTCTTCACCTGGCTAGGCTATTTAAACTCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ACCCGGCGCTCTTTGACTTCTTCACCTGGCTAGGCTATTTAAACTCCCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 ATCAATCCAATAATCTACACTGTGTTTAATGAAGAGTTTCGGCAAGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 ATCAATCCAATAATCTACACTGTGTTTAATGAAGAGTTTCGGCAAGCTTT

   1100     .    :    .    :    .    :
   1101 TCAGAAAATTGTCCCTTTCCGGAAGGCCTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TCAGAAAATTGTCCCTTTCCGGAAGGCCTCC