seq1 = pF1KB9841.tfa, 1074 bp
seq2 = pF1KB9841/gi568815597r_147658165.tfa (gi568815597r:147658165_147859238), 201074 bp

>pF1KB9841 1074
>gi568815597r:147658165_147859238 (Chr1)

(complement)

1-1074  (100001-101074)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCGATTGGAGCTTCCTGGGAAATTTCCTGGAGGAAGTACACAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCGATTGGAGCTTCCTGGGAAATTTCCTGGAGGAAGTACACAAGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCGACCGTGGTAGGCAAGGTCTGGCTCACTGTCCTCTTCATATTCCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCGACCGTGGTAGGCAAGGTCTGGCTCACTGTCCTCTTCATATTCCGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCTCGTGCTGGGCACAGCTGCTGAGTCTTCCTGGGGGGATGAGCAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCTCGTGCTGGGCACAGCTGCTGAGTCTTCCTGGGGGGATGAGCAGGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATTTCCGGTGTGATACGATTCAGCCTGGCTGCCAGAATGTCTGCTACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GATTTCCGGTGTGATACGATTCAGCCTGGCTGCCAGAATGTCTGCTACGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCAGGCTTTCCCCATCTCCCACATTCGCTACTGGGTGCTGCAGATCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCAGGCTTTCCCCATCTCCCACATTCGCTACTGGGTGCTGCAGATCATCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCGTCTCCACGCCCTCTCTGGTGTACATGGGCCACGCCATGCACACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCGTCTCCACGCCCTCTCTGGTGTACATGGGCCACGCCATGCACACTGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGCATGCAGGAGAAGCGCAAGCTACGGGAGGCCGAGAGGGCCAAAGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGCATGCAGGAGAAGCGCAAGCTACGGGAGGCCGAGAGGGCCAAAGAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCGGGGCTCTGGCTCTTACGAGTACCCGGTGGCAGAGAAGGCAGAACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCGGGGCTCTGGCTCTTACGAGTACCCGGTGGCAGAGAAGGCAGAACTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCTGCTGGGAGGAAGGGAATGGAAGGATTGCCCTCCAGGGCACTCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCTGCTGGGAGGAAGGGAATGGAAGGATTGCCCTCCAGGGCACTCTGCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AACACCTATGTGTGCAGCATCCTGATCCGCACCACCATGGAGGTGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AACACCTATGTGTGCAGCATCCTGATCCGCACCACCATGGAGGTGGGCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CATTGTGGGCCAGTACTTCATCTACGGAATCTTCCTGACCACCCTGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CATTGTGGGCCAGTACTTCATCTACGGAATCTTCCTGACCACCCTGCATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCTGCCGCAGGAGTCCCTGTCCCCACCCGGTCAACTGTTACGTATCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCTGCCGCAGGAGTCCCTGTCCCCACCCGGTCAACTGTTACGTATCCCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCCACAGAGAAGAATGTCTTCATTGTCTTTATGCTGGCTGTGGCTGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCCACAGAGAAGAATGTCTTCATTGTCTTTATGCTGGCTGTGGCTGCACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GTCCCTCCTCCTTAGCCTGGCTGAACTCTACCACCTGGGCTGGAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GTCCCTCCTCCTTAGCCTGGCTGAACTCTACCACCTGGGCTGGAAGAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCAGACAGCGATTTGTCAAACCGCGGCAGCACATGGCTAAGTGCCAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCAGACAGCGATTTGTCAAACCGCGGCAGCACATGGCTAAGTGCCAGCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCTGGCCCCTCTGTGGGCATAGTCCAGAGCTGCACACCACCCCCCGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCTGGCCCCTCTGTGGGCATAGTCCAGAGCTGCACACCACCCCCCGACTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TAATCAGTGCCTGGAGAATGGCCCTGGGGGAAAATTCTTCAATCCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TAATCAGTGCCTGGAGAATGGCCCTGGGGGAAAATTCTTCAATCCCTTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCAATAATATGGCCTCCCAACAAAACACAGACAACCTGGTCACCGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCAATAATATGGCCTCCCAACAAAACACAGACAACCTGGTCACCGAGCAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GTACGAGGTCAGGAGCAGACTCCTGGGGAAGGTTTCATCCAGGTTCGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GTACGAGGTCAGGAGCAGACTCCTGGGGAAGGTTTCATCCAGGTTCGTTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGGCCAGAAGCCTGAGGTGCCCAATGGAGTCTCACCAGGTCACCGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGGCCAGAAGCCTGAGGTGCCCAATGGAGTCTCACCAGGTCACCGCCTTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCCATGGCTATCATAGTGACAAGCGACGTCTTAGTAAGGCCAGCAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCCATGGCTATCATAGTGACAAGCGACGTCTTAGTAAGGCCAGCAGCAAG

   1050     .    :    .    :
   1051 GCAAGGTCAGATGACCTATCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||
 101051 GCAAGGTCAGATGACCTATCAGTG