seq1 = pF1KB9839.tfa, 1065 bp
seq2 = pF1KB9839/gi568815596r_206076183.tfa (gi568815596r:206076183_206277247), 201065 bp

>pF1KB9839 1065
>gi568815596r:206076183_206277247 (Chr2)

(complement)

1-1065  (100001-101065)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGATTTGGAGGAAACATTATTTGAAGAATTTGAAAACTATTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGATTTGGAGGAAACATTATTTGAAGAATTTGAAAACTATTCCTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGACCTAGACTATTACTCTCTGGAGTCTGATTTGGAGGAGAAAGTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGACCTAGACTATTACTCTCTGGAGTCTGATTTGGAGGAGAAAGTCCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGGAGTTGTTCACTGGGTCTCCCTGGTGTTATATTGTTTGGCTTTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGGAGTTGTTCACTGGGTCTCCCTGGTGTTATATTGTTTGGCTTTTGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGGAATTCCAGGAAATGCCATCGTCATTTGGTTCACGGGGTTCAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGGAATTCCAGGAAATGCCATCGTCATTTGGTTCACGGGGTTCAAGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAGAAGACAGTCACCACTCTGTGGTTCCTCAATCTAGCCATTGCGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAGAAGACAGTCACCACTCTGTGGTTCCTCAATCTAGCCATTGCGGATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCATTTTTCTTCTCTTTCTGCCCCTGTACATCTCCTATGTGGCCATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCATTTTTCTTCTCTTTCTGCCCCTGTACATCTCCTATGTGGCCATGAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCCACTGGCCCTTTGGCATCTGGCTGTGCAAAGCCAATTCCTTCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCCACTGGCCCTTTGGCATCTGGCTGTGCAAAGCCAATTCCTTCACTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCAGTTGAACATGTTTGCCAGTGTTTTTTTCCTGACAGTGATCAGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCAGTTGAACATGTTTGCCAGTGTTTTTTTCCTGACAGTGATCAGCCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCACTATATCCACTTGATCCATCCTGTCTTATCTCATCGGCATCGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACCACTATATCCACTTGATCCATCCTGTCTTATCTCATCGGCATCGAACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTCAAGAACTCTCTGATTGTCATTATATTCATCTGGCTTTTGGCTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTCAAGAACTCTCTGATTGTCATTATATTCATCTGGCTTTTGGCTTCTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AATTGGCGGTCCTGCCCTGTACTTCCGGGACACTGTGGAGTTCAATAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AATTGGCGGTCCTGCCCTGTACTTCCGGGACACTGTGGAGTTCAATAATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATACTCTTTGCTATAACAATTTTCAGAAGCATGATCCTGACCTCACTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATACTCTTTGCTATAACAATTTTCAGAAGCATGATCCTGACCTCACTTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCAGGCACCATGTTCTGACTTGGGTGAAATTTATCATTGGCTATCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCAGGCACCATGTTCTGACTTGGGTGAAATTTATCATTGGCTATCTCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCCTTTGCTAACAATGAGTATTTGCTACTTGTGTCTCATCTTCAAGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCCTTTGCTAACAATGAGTATTTGCTACTTGTGTCTCATCTTCAAGGTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGAAGCGAAGCATCCTGATCTCCAGTAGGCATTTCTGGACAATTCTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGAAGCGAAGCATCCTGATCTCCAGTAGGCATTTCTGGACAATTCTGGTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTGGTTGTGGCCTTTGTGGTTTGCTGGACTCCTTATCACCTGTTTAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTGGTTGTGGCCTTTGTGGTTTGCTGGACTCCTTATCACCTGTTTAGCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTGGGAGCTCACCATTCACCACAATAGCTATTCCCACCATGTGATGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTGGGAGCTCACCATTCACCACAATAGCTATTCCCACCATGTGATGCAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTGGAATCCCCCTCTCCACTGGTTTGGCATTCCTCAATAGTTGCTTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTGGAATCCCCCTCTCCACTGGTTTGGCATTCCTCAATAGTTGCTTGAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCCATCCTTTATGTCCTAATTAGTAAGAAGTTCCAAGCTCGCTTCCGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCCATCCTTTATGTCCTAATTAGTAAGAAGTTCCAAGCTCGCTTCCGGTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CTCAGTTGCTGAGATACTCAAGTACACACTGTGGGAAGTCAGCTGTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CTCAGTTGCTGAGATACTCAAGTACACACTGTGGGAAGTCAGCTGTTCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GCACAGTGAGTGAACAGCTCAGGAACTCAGAAACCAAGAATCTGTGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GCACAGTGAGTGAACAGCTCAGGAACTCAGAAACCAAGAATCTGTGTCTC

   1050     .    :    .
   1051 CTGGAAACAGCTCAA
        |||||||||||||||
 101051 CTGGAAACAGCTCAA