seq1 = pF1KB9838.tfa, 1056 bp
seq2 = pF1KB9838/gi568815590r_143329348.tfa (gi568815590r:143329348_143530406), 201059 bp

>pF1KB9838 1056
>gi568815590r:143329348_143530406 (Chr8)

(complement)

1-1056  (100001-101059)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGCGGAGCTGGCGATGGGCGCCGAGCTGCCCAGCAGCCCGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGCGGAGCTGGCGATGGGCGCCGAGCTGCCCAGCAGCCCGCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCGAGTACGTCAACGACTTCGACCTGATGAAGTTCGAGGTGAAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATCGAGTACGTCAACGACTTCGACCTGATGAAGTTCGAGGTGAAGAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCCTCCCGAGGCCGAGCGCTTCTGCCACCGCCTGCCGCCAGGCTCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCCTCCCGAGGCCGAGCGCTTCTGCCACCGCCTGCCGCCAGGCTCGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCTCGACGCCGCTCAGCACGCCCTGCTCCTCCGTGCCCTCCTCGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCTCGACGCCGCTCAGCACGCCCTGCTCCTCCGTGCCCTCCTCGCCCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCTGCGCGCCCAGCCCGGGCACCGGCGGCGGCGGCGGCGCGGGGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTCTGCGCGCCCAGCCCGGGCACCGGCGGCGGCGGCGGCGCGGGGGGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGGCGGCTCGTCTCAGGCCGGGGGCGCCCCCGGGCCGCCGAGCGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCGGCGGCTCGTCTCAGGCCGGGGGCGCCCCCGGGCCGCCGAGCGGGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCCGGCGCCGTCGGGGGCACCTCGGGGAAGCCGGCGCTGGAGGATCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCCGGCGCCGTCGGGGGCACCTCGGGGAAGCCGGCGCTGGAGGATCTGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTGGATGAGCGGCTACCAGCATCACCTCAACCCCGAGGCGCTCAACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTGGATGAGCGGCTACCAGCATCACCTCAACCCCGAGGCGCTCAACCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CGCCCGAGGACGCGGTGGAGGCGCTCATCGGCAGCGGCCACCACGGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CGCCCGAGGACGCGGTGGAGGCGCTCATCGGCAGCGGCCACCACGGCGCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CACCACGGCGCGCACCACCCGGCGGCCGCCGCAGCCTACGAGGCTTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CACCACGGCGCGCACCACCCGGCGGCCGCCGCAGCCTACGAGGCTTTCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGGCCCGGGCTTCGCGGGCGGCGGCGGAGCGGACGACATGGGCGCCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGGCCCGGGCTTCGCGGGCGGCGGCGGAGCGGACGACATGGGCGCCGGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACCACCACGGCGCGCACCACGCCGCCCACCACCACCACGCCGCCCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 100551 ACCACCACGGCGCGCACCACGCCGCCCACCATCACCACGCCGCCCACCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CACCACCACCACCACCACCA   TGGCGGCGCGGGACACGGCGGTGGCGC
        ||||||||||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||
 100601 CACCACCACCACCACCACCACCATGGCGGCGCGGGACACGGCGGTGGCGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    648 GGGCCACCACGTGCGCCTGGAGGAGCGCTTCTCCGACGACCAGCTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGGCCACCACGTGCGCCTGGAGGAGCGCTTCTCCGACGACCAGCTGGTGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    698 CCATGTCGGTGCGCGAGCTGAACCGGCAGCTCCGCGGCTTCAGCAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCATGTCGGTGCGCGAGCTGAACCGGCAGCTCCGCGGCTTCAGCAAGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    748 GAGGTCATCCGGCTCAAGCAGAAGCGGCGCACGCTCAAGAACCGCGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAGGTCATCCGGCTCAAGCAGAAGCGGCGCACGCTCAAGAACCGCGGCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    798 CGCGCAGTCCTGCCGCTTCAAGCGGGTGCAGCAGCGGCACATTCTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CGCGCAGTCCTGCCGCTTCAAGCGGGTGCAGCAGCGGCACATTCTGGAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    848 GCGAGAAGTGCCAACTCCAGAGCCAGGTGGAGCAGCTGAAGCTGGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCGAGAAGTGCCAACTCCAGAGCCAGGTGGAGCAGCTGAAGCTGGAGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    898 GGGCGCCTGGCCAAAGAGCGGGACCTGTACAAGGAGAAATACGAGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GGGCGCCTGGCCAAAGAGCGGGACCTGTACAAGGAGAAATACGAGAAGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    948 GGCGGGCCGGGGCGGCCCCGGGAGCGCGGGCGGGGCCGGTTTCCCGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGCGGGCCGGGGCGGCCCCGGGAGCGCGGGCGGGGCCGGTTTCCCGCGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    998 AGCCTTCGCCGCCGCAGGCCGGTCCCGGCGGGGCCAAGGGCACGGCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGCCTTCGCCGCCGCAGGCCGGTCCCGGCGGGGCCAAGGGCACGGCCGAC

   1050     .
   1048 TTCTTCCTG
        |||||||||
 101051 TTCTTCCTG