seq1 = pF1KB9834.tfa, 1038 bp
seq2 = pF1KB9834/gi568815590r_56012945.tfa (gi568815590r:56012945_56213982), 201038 bp

>pF1KB9834 1038
>gi568815590r:56012945_56213982 (Chr8)

(complement)

1-1038  (100001-101038)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCTCGCCCCTGGCCCTACGCCCCTACCTCCGGAGCGAGTTTTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCTCGCCCCTGGCCCTACGCCCCTACCTCCGGAGCGAGTTTTCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCGGTGGACGCGCGGCCCTGCAGCAGTCCCTCAGAGCTACCTGCGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATCGGTGGACGCGCGGCCCTGCAGCAGTCCCTCAGAGCTACCTGCGAAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCTTCTGGGGGCCACTCTTCCTCGGGCCCCGCGGCTGCCGCGCCGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCTTCTGGGGGCCACTCTTCCTCGGGCCCCGCGGCTGCCGCGCCGGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCTGGTGCTCCATTGACTGGGAGCAGGTGTGCTTGCTGCAGAGGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCTGGTGCTCCATTGACTGGGAGCAGGTGTGCTTGCTGCAGAGGCTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGCTGGAGGGTTTGGCTCGGTGTACAAGGCGACTTACCGCGGTGTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGCTGGAGGGTTTGGCTCGGTGTACAAGGCGACTTACCGCGGTGTTCCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGCCATAAAGCAAGTGAACAAGTGCACCAAGAACCGACTAGCATCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGCCATAAAGCAAGTGAACAAGTGCACCAAGAACCGACTAGCATCTCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGGAGTTTCTGGGCTGAGCTCAACGTAGCAAGGCTGCGCCACGATAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGGAGTTTCTGGGCTGAGCTCAACGTAGCAAGGCTGCGCCACGATAACAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGTGCGCGTGGTGGCTGCCAGCACGCGCACGCCCGCAGGGTCCAATAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGTGCGCGTGGTGGCTGCCAGCACGCGCACGCCCGCAGGGTCCAATAGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TAGGGACCATCATCATGGAGTTCGGTGGCAACGTCACTTTACACCAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TAGGGACCATCATCATGGAGTTCGGTGGCAACGTCACTTTACACCAAGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCTATGGCGCCGCCGGCCACCCTGAGGGGGACGCAGGGGAGCCTCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCTATGGCGCCGCCGGCCACCCTGAGGGGGACGCAGGGGAGCCTCACTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCGCACTGGAGGACAGTTAAGTTTGGGAAAGTGTCTCAAGTACTCACTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCGCACTGGAGGACAGTTAAGTTTGGGAAAGTGTCTCAAGTACTCACTAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATGTTGTGAACGGCCTGCTCTTCCTCCACTCGCAAAGCATTGTGCACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATGTTGTGAACGGCCTGCTCTTCCTCCACTCGCAAAGCATTGTGCACTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GACCTGAAGCCCGCGAACATCTTGATCAGTGAGCAGGATGTCTGTAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GACCTGAAGCCCGCGAACATCTTGATCAGTGAGCAGGATGTCTGTAAAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TAGTGACTTCGGTTGCTCTGAGAAGTTGGAAGATCTGCTGTGCTTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TAGTGACTTCGGTTGCTCTGAGAAGTTGGAAGATCTGCTGTGCTTCCAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CACCCTCTTACCCTCTAGGAGGCACATACACCCACCGCGCCCCGGAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CACCCTCTTACCCTCTAGGAGGCACATACACCCACCGCGCCCCGGAGCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTGAAAGGAGAGGGCGTGACGCCTAAAGCCGACATTTATTCCTTTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTGAAAGGAGAGGGCGTGACGCCTAAAGCCGACATTTATTCCTTTGCCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CACTCTCTGGCAAATGACTACCAAGCAGGCGCCGTATTCGGGGGAGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CACTCTCTGGCAAATGACTACCAAGCAGGCGCCGTATTCGGGGGAGCGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGCACATACTGTACGCGGTGGTGGCCTACGACCTGCGCCCGTCCCTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGCACATACTGTACGCGGTGGTGGCCTACGACCTGCGCCCGTCCCTCTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCTGCCGTCTTCGAGGACTCGCTCCCCGGGCAGCGCCTTGGGGACGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCTGCCGTCTTCGAGGACTCGCTCCCCGGGCAGCGCCTTGGGGACGTCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCAGCGCTGCTGGAGACCCAGCGCGGCGCAGAGGCCGAGCGCGCGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCAGCGCTGCTGGAGACCCAGCGCGGCGCAGAGGCCGAGCGCGCGGCTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .
   1001 TTTTGGTGGATCTCACCTCTTTGAAAGCTGAACTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TTTTGGTGGATCTCACCTCTTTGAAAGCTGAACTCGGC