seq1 = pF1KB9833.tfa, 1035 bp
seq2 = pF1KB9833/gi568815581r_50762983.tfa (gi568815581r:50762983_50964017), 201035 bp

>pF1KB9833 1035
>gi568815581r:50762983_50964017 (Chr17)

(complement)

1-1035  (100001-101035)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGCTTGAAATCCAAGTAGCACTAAATTTTATTATTTCGTATTTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGCTTGAAATCCAAGTAGCACTAAATTTTATTATTTCGTATTTGTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAATAAGCTTCCCAGGAGACGTGTCAACATTTTTGGTGAAGAACTTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAATAAGCTTCCCAGGAGACGTGTCAACATTTTTGGTGAAGAACTTGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GACTTCTTAAGAAGAAATATGAAGGGCACTGGTATCCTGAAAAGCCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GACTTCTTAAGAAGAAATATGAAGGGCACTGGTATCCTGAAAAGCCATAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAAGGATCGGGGTTTAGATGTATACACATAGGGGAGAAAGTGGACCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAAGGATCGGGGTTTAGATGTATACACATAGGGGAGAAAGTGGACCCAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GATTGAACAAGCATCCAAAGAGAGTGGTTTGGACATTGATGATGTTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GATTGAACAAGCATCCAAAGAGAGTGGTTTGGACATTGATGATGTTCGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCAATCTGCCACAGGATCTTAGTGTTTGGATCGACCCATTTGAGGTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCAATCTGCCACAGGATCTTAGTGTTTGGATCGACCCATTTGAGGTTTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TACCAAATTGGTGAAAAGGGACCAGTGAAGGTGCTTTACGTGGATGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TACCAAATTGGTGAAAAGGGACCAGTGAAGGTGCTTTACGTGGATGATAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TAATGAAAATGGATGTGAGTTGGATAAGGAGATCAAAAACAGCTTTAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TAATGAAAATGGATGTGAGTTGGATAAGGAGATCAAAAACAGCTTTAACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CAGAGGCCCAGGTTTTTATGCCCATAAGTGACCCAGCCTCATCAGTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CAGAGGCCCAGGTTTTTATGCCCATAAGTGACCCAGCCTCATCAGTGTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCTCTCCATCGCCTCCTTTTGGTCACTCTGCTGCTGTAAGCCCTACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGCTCTCCATCGCCTCCTTTTGGTCACTCTGCTGCTGTAAGCCCTACCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CATGCCCCGGTCCACTCAGCCTTTAACCTTTACCACTGCCACTTTTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CATGCCCCGGTCCACTCAGCCTTTAACCTTTACCACTGCCACTTTTGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCACCAAGTTCGGCTCTACCAAAATGAAGAATAGTGGCCGTAGCAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCACCAAGTTCGGCTCTACCAAAATGAAGAATAGTGGCCGTAGCAACAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTTGCACGTACTTCTCCCATCAACCTCGGCTTGAATGTGAATGACCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTTGCACGTACTTCTCCCATCAACCTCGGCTTGAATGTGAATGACCTCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GAAGCAGAAAGCCATCTCTTCCTCAATGCACTCTCTGTATGGGCTTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GAAGCAGAAAGCCATCTCTTCCTCAATGCACTCTCTGTATGGGCTTGGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGGGTAGCCAGCAGCAGCCACAGCAACAGCAGCAGCCAGCCCAGCCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGGGTAGCCAGCAGCAGCCACAGCAACAGCAGCAGCCAGCCCAGCCGCCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCGCCACCACCACCACCACAGCAGCAACAACAGCAGAAAACCTCTGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCGCCACCACCACCACCACAGCAGCAACAACAGCAGAAAACCTCTGCTCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTCTCCTAATGCCAAGGAATTTATTTTTCCTAATATGCAGGGTCAAGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTCTCCTAATGCCAAGGAATTTATTTTTCCTAATATGCAGGGTCAAGGTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GTAGTACCAATGGAATGTTCCCAGGTGACAGCCCCCTTAACCTCAGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GTAGTACCAATGGAATGTTCCCAGGTGACAGCCCCCTTAACCTCAGTCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTCCAGTACAGTAATGCCTTTGATGTGTTTGCAGCCTATGGAGGCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTCCAGTACAGTAATGCCTTTGATGTGTTTGCAGCCTATGGAGGCCTCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGAGAAGTCTTTTGTAGATGGCTTGAATTTTAGCTTAAATAACATGCAGT
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGAGAAATCTTTTGTAGATGGCTTGAATTTTAGCTTAAATAACATGCAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .
   1001 ATTCTAACCAGCAATTCCAGCCTGTTATGGCTAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ATTCTAACCAGCAATTCCAGCCTGTTATGGCTAAC