seq1 = pF1KB9831.tfa, 1026 bp
seq2 = pF1KB9831/gi568815597r_28049996.tfa (gi568815597r:28049996_28251021), 201026 bp

>pF1KB9831 1026
>gi568815597r:28049996_28251021 (Chr1)

(complement)

1-1026  (100001-101026)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCCACATGACTCCTCCCACATGGACTCTGAGTTCCGATACACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCCACATGACTCCTCCCACATGGACTCTGAGTTCCGATACACTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCCCGATTGTTTACAGCATCATCTTTGTGCTCGGGGTCATTGCTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCCCGATTGTTTACAGCATCATCTTTGTGCTCGGGGTCATTGCTAATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTACGTGCTGTGGGTCTTTGCCCGCCTGTACCCTTGCAAGAAATTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTACGTGCTGTGGGTCTTTGCCCGCCTGTACCCTTGCAAGAAATTCAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGATAAAGATCTTCATGGTGAACCTCACCATGGCGGACATGCTCTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGATAAAGATCTTCATGGTGAACCTCACCATGGCGGACATGCTCTTCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GATCACCCTGCCACTTTGGATTGTCTACTACCAAAACCAGGGCAACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GATCACCCTGCCACTTTGGATTGTCTACTACCAAAACCAGGGCAACTGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TACTCCCCAAATTCCTGTGCAACGTGGCTGGCTGCCTTTTCTTCATCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TACTCCCCAAATTCCTGTGCAACGTGGCTGGCTGCCTTTTCTTCATCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCTACTGCTCTGTGGCCTTCCTGGGCGTCATCACTTATAACCGCTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACCTACTGCTCTGTGGCCTTCCTGGGCGTCATCACTTATAACCGCTTCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCAGTAACTCGGCCCATCAAGACTGCTCAGGCCAACACCCGCAAGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCAGTAACTCGGCCCATCAAGACTGCTCAGGCCAACACCCGCAAGCGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCATCTCTTTGTCCTTGGTCATCTGGGTGGCCATTGTGGGAGCTGCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCATCTCTTTGTCCTTGGTCATCTGGGTGGCCATTGTGGGAGCTGCATCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TACTTCCTCATCCTGGACTCCACCAACACAGTGCCCGACAGTGCTGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TACTTCCTCATCCTGGACTCCACCAACACAGTGCCCGACAGTGCTGGCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGGCAACGTCACTCGCTGCTTTGAGCATTACGAGAAGGGCAGCGTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGGCAACGTCACTCGCTGCTTTGAGCATTACGAGAAGGGCAGCGTGCCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCCTCATCATCCACATCTTCATCGTGTTCAGCTTCTTCCTGGTCTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCCTCATCATCCACATCTTCATCGTGTTCAGCTTCTTCCTGGTCTTCCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCATCCTCTTCTGCAACCTGGTCATCATCCGTACCTTGCTCATGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCATCCTCTTCTGCAACCTGGTCATCATCCGTACCTTGCTCATGCAGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGTGCAGCAGCAGCGCAACGCTGAAGTCAAGCGCCGGGCGCTGTGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGTGCAGCAGCAGCGCAACGCTGAAGTCAAGCGCCGGGCGCTGTGGATGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGTGCACGGTCTTGGCGGTGTTCATCATCTGCTTCGTGCCCCACCACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGTGCACGGTCTTGGCGGTGTTCATCATCTGCTTCGTGCCCCACCACGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTGCAGCTGCCCTGGACCCTTGCTGAGCTGGGCTTCCAGGACAGCAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTGCAGCTGCCCTGGACCCTTGCTGAGCTGGGCTTCCAGGACAGCAAATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCACCAGGCCATTAATGATGCACATCAGGTCACCCTCTGCCTCCTTAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCACCAGGCCATTAATGATGCACATCAGGTCACCCTCTGCCTCCTTAGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCAACTGTGTCTTAGACCCTGTTATCTACTGTTTCCTCACCAAGAAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCAACTGTGTCTTAGACCCTGTTATCTACTGTTTCCTCACCAAGAAGTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CGCAAGCACCTCACCGAAAAGTTCTACAGCATGCGCAGTAGCCGGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CGCAAGCACCTCACCGAAAAGTTCTACAGCATGCGCAGTAGCCGGAAATG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CTCCCGGGCCACCACGGATACGGTCACTGAAGTGGTTGTGCCATTCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CTCCCGGGCCACCACGGATACGGTCACTGAAGTGGTTGTGCCATTCAACC

   1000     .    :    .    :    .
   1001 AGATCCCTGGCAATTCCCTCAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGATCCCTGGCAATTCCCTCAAAAAT