seq1 = pF1KB9830.tfa, 1026 bp
seq2 = pF1KB9830/gi568815595r_151237820.tfa (gi568815595r:151237820_151438845), 201026 bp

>pF1KB9830 1026
>gi568815595r:151237820_151438845 (Chr3)

(complement)

1-1026  (100001-101026)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAAGCCGTCGACAACCTCACCTCTGCGCCTGGGAACACCAGTCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 100001 ATGCAAGCCGTCGACAACCTCACCTCTGCGCCTGGTAACACCAGTCTGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCAGAGACTACAAAATCACCCAGGTCCTCTTCCCACTGCTCTACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACCAGAGACTACAAAATCACCCAGGTCCTCTTCCCACTGCTCTACACTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCTGTTTTTTGTTGGACTTATCACAAATGGCCTGGCGATGAGGATTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCTGTTTTTTGTTGGACTTATCACAAATGGCCTGGCGATGAGGATTTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTCAAATCCGGAGTAAATCAAACTTTATTATTTTTCTTAAGAACACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTTCAAATCCGGAGTAAATCAAACTTTATTATTTTTCTTAAGAACACAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATTTCTGATCTTCTCATGATTCTGACTTTTCCATTCAAAATTCTTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATTTCTGATCTTCTCATGATTCTGACTTTTCCATTCAAAATTCTTAGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATGCCAAACTGGGAACAGGACCACTGAGAACTTTTGTGTGTCAAGTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATGCCAAACTGGGAACAGGACCACTGAGAACTTTTGTGTGTCAAGTTACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCCGTCATATTTTATTTCACAATGTATATCAGTATTTCATTCCTGGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCCGTCATATTTTATTTCACAATGTATATCAGTATTTCATTCCTGGGACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATAACTATCGATCGCTACCAGAAGACCACCAGGCCATTTAAAACATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATAACTATCGATCGCTACCAGAAGACCACCAGGCCATTTAAAACATCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCCCAAAAATCTCTTGGGGGCTAAGATTCTCTCTGTTGTCATCTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACCCCAAAAATCTCTTGGGGGCTAAGATTCTCTCTGTTGTCATCTGGGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTCATGTTCTTACTCTCTTTGCCTAACATGATTCTGACCAACAGGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTCATGTTCTTACTCTCTTTGCCTAACATGATTCTGACCAACAGGCAGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAGAGACAAGAATGTGAAGAAATGCTCTTTCCTTAAATCAGAGTTCGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAGAGACAAGAATGTGAAGAAATGCTCTTTCCTTAAATCAGAGTTCGGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TAGTCTGGCATGAAATAGTAAATTACATCTGTCAAGTCATTTTCTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TAGTCTGGCATGAAATAGTAAATTACATCTGTCAAGTCATTTTCTGGATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AATTTCTTAATTGTTATTGTATGTTATACACTCATTACAAAAGAACTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AATTTCTTAATTGTTATTGTATGTTATACACTCATTACAAAAGAACTGTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCGGTCATACGTAAGAACGAGGGGTGTAGGTAAAGTCCCCAGGAAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCGGTCATACGTAAGAACGAGGGGTGTAGGTAAAGTCCCCAGGAAAAAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGAACGTCAAAGTTTTCATTATCATTGCTGTATTCTTTATTTGTTTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGAACGTCAAAGTTTTCATTATCATTGCTGTATTCTTTATTTGTTTTGTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCTTTCCATTTTGCCCGAATTCCTTACACCCTGAGCCAAACCCGGGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCTTTCCATTTTGCCCGAATTCCTTACACCCTGAGCCAAACCCGGGATGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTTTGACTGCACTGCTGAAAATACTCTGTTCTATGTGAAAGAGAGCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTTTGACTGCACTGCTGAAAATACTCTGTTCTATGTGAAAGAGAGCACTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGTGGTTAACTTCCTTAAATGCATGCCTGGATCCGTTCATCTATTTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGTGGTTAACTTCCTTAAATGCATGCCTGGATCCGTTCATCTATTTTTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTTTGCAAGTCCTTCAGAAATTCCTTGATAAGTATGCTGAAGTGCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTTTGCAAGTCCTTCAGAAATTCCTTGATAAGTATGCTGAAGTGCCCCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TTCTGCAACATCTCTGTCCCAGGACAATAGGAAAAAAGAACAGGATGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TTCTGCAACATCTCTGTCCCAGGACAATAGGAAAAAAGAACAGGATGGTG

   1000     .    :    .    :    .
   1001 GTGACCCAAATGAAGAGACTCCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||
 101001 GTGACCCAAATGAAGAGACTCCAATG