seq1 = pF1KB9826.tfa, 963 bp
seq2 = pF1KB9826/gi568815583r_23586255.tfa (gi568815583r:23586255_23787217), 200963 bp

>pF1KB9826 963
>gi568815583r:23586255_23787217 (Chr15)

(complement)

1-963  (100001-100963)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCAGAACAAAGTAAGGATCTGAGCGACCCTAACTTTGCAGCCGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCAGAACAAAGTAAGGATCTGAGCGACCCTAACTTTGCAGCCGAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCAACTCCGAGGTGCACAGCAGCCCTGGGGTTTCGGAGGGGGTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCAACTCCGAGGTGCACAGCAGCCCTGGGGTTTCGGAGGGGGTTCCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGTCCGCGACCCTGGCAGAGCCGCAGAGCCCTCCTCTAGGCCCGACGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGTCCGCGACCCTGGCAGAGCCGCAGAGCCCTCCTCTAGGCCCGACGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTCCGCAGGCCGCGCCGCCTCCCCAGGCCCCGAACGACGAGGGCGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCTCCGCAGGCCGCGCCGCCTCCCCAGGCCCCGAACGACGAGGGCGACCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAGGCCCTGCAGCAGGCTGCGGAGGAGGGCCGCGCCCACCAGGCCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAGGCCCTGCAGCAGGCTGCGGAGGAGGGCCGCGCCCACCAGGCCCCGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGCGGCCCAGCCGGGCCCGGCACCGCCAGCCCCGGCGCAGCTGGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCGCGGCCCAGCCGGGCCCGGCACCGCCAGCCCCGGCGCAGCTGGTGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGGCGCACGAGCTCATGTGGTACGTGCTGGTCAAGGACCAGAAGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAGGCGCACGAGCTCATGTGGTACGTGCTGGTCAAGGACCAGAAGAAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATCATCTGGTTTCCAGACATGGTGAAAGATGTCATCGGCAGCTACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATCATCTGGTTTCCAGACATGGTGAAAGATGTCATCGGCAGCTACAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGTGGTGCAGGAGCATCCTCCGGCGCACCAGCCTCATCCTCGCCCGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGTGGTGCAGGAGCATCCTCCGGCGCACCAGCCTCATCCTCGCCCGGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTCGGGCTGCACCTGAGGCTAACCAGCCTGCACACCATGGAGTTTGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTCGGGCTGCACCTGAGGCTAACCAGCCTGCACACCATGGAGTTTGCGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGTCAAAGCGCTGGAGCCCGAGGAGCTGGACAGGGTGGCGCTGAGCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGTCAAAGCGCTGGAGCCCGAGGAGCTGGACAGGGTGGCGCTGAGCAACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCATGCCCATGACAGGCCTCCTGCTCATGATCCTGAGCCTCATCTACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCATGCCCATGACAGGCCTCCTGCTCATGATCCTGAGCCTCATCTACGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAGGGCCGCGGCGCCAGAGAGAGCGCCGTCTGGAACGTGCTGCGCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAGGGCCGCGGCGCCAGAGAGAGCGCCGTCTGGAACGTGCTGCGCATCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGGGCTGCGGCCCTGGAAGAAGCACTCCACCTTCGGGGACGTGCGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGGGCTGCGGCCCTGGAAGAAGCACTCCACCTTCGGGGACGTGCGGAAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCATCACTGAGGAGTTCGTCCAAATGAATTACCTGAAGTACCAGCGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCATCACTGAGGAGTTCGTCCAAATGAATTACCTGAAGTACCAGCGCGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCATACGTGGAGCCGCCCGAATACGAGTTCTTTTGGGGCTCCCGGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCATACGTGGAGCCGCCCGAATACGAGTTCTTTTGGGGCTCCCGGGCCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCGCGAAATCACCAAGATGCAAATCATGGAGTTCCTGGCCAGGGTCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCGCGAAATCACCAAGATGCAAATCATGGAGTTCCTGGCCAGGGTCTTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGAAAGACCCCCAGGCCTGGCCCTCCCGATACAGAGAAGCTCTGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGAAAGACCCCCAGGCCTGGCCCTCCCGATACAGAGAAGCTCTGGAGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCCAGAGCTCTGCGGGAGGCTAATCCCACTGCCCACTACCCTCGCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCCAGAGCTCTGCGGGAGGCTAATCCCACTGCCCACTACCCTCGCAGCAG

    950     .    :
    951 TGTCTCTGAGGAC
        |||||||||||||
 100951 TGTCTCTGAGGAC