seq1 = pF1KB9822.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KB9822/gi568815591r_44784413.tfa (gi568815591r:44784413_44985266), 200854 bp

>pF1KB9822 936
>gi568815591r:44784413_44985266 (Chr7)

(complement)

1-936  (99919-100854)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGACGGCGACAGCGGCAGCGAGCGCGGCGGCGGCGGTGGGCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99919 ATGGCGGACGGCGACAGCGGCAGCGAGCGCGGCGGCGGCGGTGGGCCGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGGTTCCAGCCCGCGTCCCGCGGCGGCGGCGAGCAAGAGACGCAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99969 CGGGTTCCAGCCCGCGTCCCGCGGCGGCGGCGAGCAAGAGACGCAGGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGCCTCGAAGCGGCTGGACATCCAGAACAAGCGCTTCTACTTAGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100019 TGGCCTCGAAGCGGCTGGACATCCAGAACAAGCGCTTCTACTTAGATGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGCAGAACGCCAAGGGCCGCTTCCTCAAGATCGCCGAGGTGGGCGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100069 AAGCAGAACGCCAAGGGCCGCTTCCTCAAGATCGCCGAGGTGGGCGCGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGGTTCCAAGAGCCGCCTCACGCTGTCCATGGCGGTGGCCGCCGAGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100119 CGGTTCCAAGAGCCGCCTCACGCTGTCCATGGCGGTGGCCGCCGAGTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGACTCGCTGGGCGACTTCATAGAACACTACGCGCAGCTGGGCCCTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100169 GCGACTCGCTGGGCGACTTCATAGAACACTACGCGCAGCTGGGCCCTAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCCCCGAGCAGCTGGCGGCGGGCGCCGAGGAGGGCGGCGGGCCGCGGCG
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 100219 AGCCCCGAGCAGCTGGCGGCTGGCGCCGAGGAGGGCGGCGGGCCGCGGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGCGCTCAAGAGCGAATTCTTGGTGCGTGAGAACCGCAAGTACTACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100269 CGCGCTCAAGAGCGAATTCTTGGTGCGTGAGAACCGCAAGTACTACCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCTCAAGGAGAACCAGCGCGGCCGCTTCCTGCGCATCCGCCAAACGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100319 ACCTCAAGGAGAACCAGCGCGGCCGCTTCCTGCGCATCCGCCAAACGGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AACCGCGGCGGTGGCGGCTTCGGCGCGGGCCCCGGGCCGGGCGGCTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100369 AACCGCGGCGGTGGCGGCTTCGGCGCGGGCCCCGGGCCGGGCGGCTTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAGCGGCCAGACCATCGCGCTGCCTGCGCAGGGCCTCATCGAGTTCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100419 GAGCGGCCAGACCATCGCGCTGCCTGCGCAGGGCCTCATCGAGTTCCGCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACGCGCTGGCGAAGCTCATAGACGACTACGGAGGCGAGGACGACGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100469 ACGCGCTGGCGAAGCTCATAGACGACTACGGAGGCGAGGACGACGAGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCAGGCGGCCCGGGAGGCGGCGCCGGGGGCCCAGGGGGCGGCCTGTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100519 GCAGGCGGCCCGGGAGGCGGCGCCGGGGGCCCAGGGGGCGGCCTGTATGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGAGCTCCCGGAGGGCACCTCCATCACCGTGGACTCCAAGCGCTTCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100569 AGAGCTCCCGGAGGGCACCTCCATCACCGTGGACTCCAAGCGCTTCTTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCGATGTGGGCTGCAACAAATACGGGGTGTTTCTGCGAGTGAGCGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100619 TCGATGTGGGCTGCAACAAATACGGGGTGTTTCTGCGAGTGAGCGAGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAGCCGTCCTACCGCAATGCCATCACCGTACCCTTCAAAGCCTGGGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100669 AAGCCGTCCTACCGCAATGCCATCACCGTACCCTTCAAAGCCTGGGGCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GTTCGGAGGCGCCTTTTGCCGGTATGCGGATGAGATGAAAGAAATCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100719 GTTCGGAGGCGCCTTTTGCCGGTATGCGGATGAGATGAAAGAAATCCAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AACGACAGAGGGATAAGCTTTATGAGCGACGTGGTGGGGGCAGCGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100769 AACGACAGAGGGATAAGCTTTATGAGCGACGTGGTGGGGGCAGCGGCGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 GGCGAAGAGTCAGAGGGTGAGGAGGTGGATGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100819 GGCGAAGAGTCAGAGGGTGAGGAGGTGGATGAGGAT