seq1 = pF1KB9820.tfa, 933 bp
seq2 = pF1KB9820/gi568815575f_55523712.tfa (gi568815575f:55523712_55724644), 200933 bp

>pF1KB9820 933
>gi568815575f:55523712_55724644 (ChrX)

1-933  (100001-100933)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACTTAAAACTAAAAGACTGTGAATTTTGGTATAGTCTCCATGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACTTAAAACTAAAAGACTGTGAATTTTGGTATAGTCTCCATGGCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTCCCAGGGCTGCTGGACTGGGACATGAGGAATGAGTTATTTCTGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTCCCAGGGCTGCTGGACTGGGACATGAGGAATGAGTTATTTCTGCCTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTACCACAGACCAGTGCTCTTTAGCTGAGCAAATCCTTGCCAAATACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTACCACAGACCAGTGCTCTTTAGCTGAGCAAATCCTTGCCAAATACAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCGGAGTAATGAAGCCCCCAGAAATGCCTCAGAAGAGGAGACCCAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCGGAGTAATGAAGCCCCCAGAAATGCCTCAGAAGAGGAGACCCAGTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGATGGAGATGGTCCTCCCTGTGAACCCAATCTGTGGATGTGGGTGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGATGGAGATGGTCCTCCCTGTGAACCCAATCTGTGGATGTGGGTGGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCAATATCCTGTGCCCCCTTGGCAGCCAGGAGGCCCCAAAGCCCAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCAATATCCTGTGCCCCCTTGGCAGCCAGGAGGCCCCAAAGCCCAGTGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAAGAGGATCTGACAAACATTTCTCCTTTCCCTCAGCCCCCACAAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAAGAGGATCTGACAAACATTTCTCCTTTCCCTCAGCCCCCACAAAAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGAAGGGTCTAACTGCTCAGAGGACAAAGTGGTAGAGTCTCTGCCATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGAAGGGTCTAACTGCTCAGAGGACAAAGTGGTAGAGTCTCTGCCATCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCTCCAGTGAGCAGTCTCCTTTACAGAAGCAGGGTATCCATTCCCCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCTCCAGTGAGCAGTCTCCTTTACAGAAGCAGGGTATCCATTCCCCCAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GACTTTGAGCTCACAGAAGAGGAGGCTGAGGAACCAGACGACAACTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GACTTTGAGCTCACAGAAGAGGAGGCTGAGGAACCAGACGACAACTCCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCAGTCCCCTGAAATGAAATGTTACCAGAGCCAGAAACTATGGCAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCAGTCCCCTGAAATGAAATGTTACCAGAGCCAGAAACTATGGCAAATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACAACCAAGAGAAGTCCTGGCAAAGGCCCCCTCTCAATTGTAGCCACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACAACCAAGAGAAGTCCTGGCAAAGGCCCCCTCTCAATTGTAGCCACCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATTGCCCTAGCATTAAGAAACAACCCCCACTGTGGCCTCAGTGTGCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATTGCCCTAGCATTAAGAAACAACCCCCACTGTGGCCTCAGTGTGCAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GATCTACAATTTCACCCGACAGCATTTCCCCTTTTTCTGGACAGCTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GATCTACAATTTCACCCGACAGCATTTCCCCTTTTTCTGGACAGCTCCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATGGCTGGAAGAGCACCATTCATTACAACCTCTGCTTCCTGGACAGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATGGCTGGAAGAGCACCATTCATTACAACCTCTGCTTCCTGGACAGCTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GAGAAGGTGCCAGACAGCCTTAAGGATGAAGATAATGCAAGACCTCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAGAAGGTGCCAGACAGCCTTAAGGATGAAGATAATGCAAGACCTCGCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTGCCTTTGGAAGCTCACTAAGGAGGGGCACCGCCGCTTTTGGGAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTGCCTTTGGAAGCTCACTAAGGAGGGGCACCGCCGCTTTTGGGAGGAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTCGTGCCTTAGCCTTTGCTCAAAGGGAGAGAATCCAAGAGTGCATGAGT
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTCGTGTCTTAGCCTTTGCTCAAAGGGAGAGAATCCAAGAGTGCATGAGT

    900     .    :    .    :    .    :
    901 CAGCCAGAGTTGTTGACCTCTCTCTTTGATCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CAGCCAGAGTTGTTGACCTCTCTCTTTGATCTT