seq1 = pF1KB9815.tfa, 897 bp
seq2 = pF1KB9815/gi568815578r_59839035.tfa (gi568815578r:59839035_60039931), 200897 bp

>pF1KB9815 897
>gi568815578r:59839035_60039931 (Chr20)

(complement)

1-897  (100001-100897)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCAGAGGCCCGAGCTCCGCGGTCCTGCCTAGCGCCCTGGGATCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCAGAGGCCCGAGCTCCGCGGTCCTGCCTAGCGCCCTGGGATCCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGCTCGGCCCCCGGAGCCTCAGCTGCCTGTCGGACCTGGACGGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAGCTCGGCCCCCGGAGCCTCAGCTGCCTGTCGGACCTGGACGGCGGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGCCCTGGAGCCGCGGGCCTGTAGGCCCCCTGGGAGCCCGGGCCGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGCCCTGGAGCCGCGGGCCTGTAGGCCCCCTGGGAGCCCGGGCCGCGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCGCCGCCAACGCCAGCGCCGTCGGGCTGCGACCCCCGCCTGCGGCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCGCCGCCAACGCCAGCGCCGTCGGGCTGCGACCCCCGCCTGCGGCCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATCCTGCGGCGGGCGCGCTCACTGCCCAGCTCCCCCGAGCGCCGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATCCTGCGGCGGGCGCGCTCACTGCCCAGCTCCCCCGAGCGCCGCCAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGCCGCGGGCGCGCCGGGCGCTGCGTGTCGGCCGGGCTGCAGCCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGCCGCGGGCGCGCCGGGCGCTGCGTGTCGGCCGGGCTGCAGCCAGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCCGCGTGCGCTTCGCCGACGCCCTGGGCTTGGAGCTGGCACAGGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCCGCGTGCGCTTCGCCGACGCCCTGGGCTTGGAGCTGGCACAGGTCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGTGTTCAACGCGGGAGACGACCCGTCCGTGCCGCTGCACGTGCTGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGTGTTCAACGCGGGAGACGACCCGTCCGTGCCGCTGCACGTGCTGTCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGCTCGCAATCAACTCGGACCTGTGCTGCAGCAGCCAGGACCTGGAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGCTCGCAATCAACTCGGACCTGTGCTGCAGCAGCCAGGACCTGGAGTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACCCTGCATTGCCTGGTGCCCGATTTCCCGCCGCCCGTCGAGGCCGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ACCCTGCATTGCCTGGTGCCCGATTTCCCGCCGCCCGTCGAGGCCGCCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTTGGCGAGCGCCTGCAGCGGCAGCTCGTGTGCCTGGAGCGTGTCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTTGGCGAGCGCCTGCAGCGGCAGCTCGTGTGCCTGGAGCGTGTCACTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCTCGGACCTTGGCATCAGCGGTACGGTGCGCGTGTGCAACGTGGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCTCGGACCTTGGCATCAGCGGTACGGTGCGCGTGTGCAACGTGGCCTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAGAAGCAGGTGGCTGTGCGCTACACTTTCTCGGGCTGGCGCAGTACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAGAAGCAGGTGGCTGTGCGCTACACTTTCTCGGGCTGGCGCAGTACCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGAGGCGGTGGCGCGGTGGCGCGGGCCCGCAGGCCCCGAGGGCACGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGAGGCGGTGGCGCGGTGGCGCGGGCCCGCAGGCCCCGAGGGCACGGAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACGTTTTCACCTTCGGCTTTCCAGTACCGCCCTTCCTGCTGGAGCTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACGTTTTCACCTTCGGCTTTCCAGTACCGCCCTTCCTGCTGGAGCTCGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCCCGCGTGCACTTCGCGGTGCGCTACCAAGTGGCGGGTGCCGAGTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCCCGCGTGCACTTCGCGGTGCGCTACCAAGTGGCGGGTGCCGAGTACTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGACAACAACGACCACCGAGACTACAGCCTCACATGTCGCAACCACGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGACAACAACGACCACCGAGACTACAGCCTCACATGTCGCAACCACGCGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    851 TGCACATGCCTCGCGGGGAGTGCGAAGAGAGCTGGATCCACTTCATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCACATGCCTCGCGGGGAGTGCGAAGAGAGCTGGATCCACTTCATC