seq1 = pF1KB9814.tfa, 882 bp
seq2 = pF1KB9814/gi568815592r_31559128.tfa (gi568815592r:31559128_31759947), 200820 bp

>pF1KB9814 882
>gi568815592r:31559128_31759947 (Chr6)

(complement)

1-882  (100001-100882)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCCTGCGACGGCTTGGTGGCTGGCTACCTCGCCCTTGGGGCCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCCTGCGACGGCTTGGTGGCTGGCTACCTCGCCCTTGGGGCCGCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAACCAATGAGGCCTGACCCGCCTTACCCAGAACCCAGACGGGTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAACCAATGAGGCCTGACCCGCCTTACCCAGAACCCAGACGGGTGGACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTCCTCGGAGAATTCAGGAAGTGACTGGGATAGTGCCCCAGAAACCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTCCTCGGAGAATTCAGGAAGTGACTGGGATAGTGCCCCAGAAACCATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAAGATGTGGGGCATCCCAAGACTAAGGACTCGGGGGCATTGAGGGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAAGATGTGGGGCATCCCAAGACTAAGGACTCGGGGGCATTGAGGGTTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TAGGGCTGCTTCCGAACCAAGCAAGGAGGAGCCCCAAGTTGAGCAGCTAG
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGGGGCTGCTTCCGAACCAAGCAAGGAGGAGCCCCAAGTTGAGCAGCTAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGAGCAAAAGAATGGATTCCCTCAAGTGGGACCAGCCTATCTCTAGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGAGCAAAAGAATGGATTCCCTCAAGTGGGACCAGCCTATCTCTAGCACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAAGAGTCTGGGAGACTGGAGGCTGGAGGGGCCAGTCCCAAACTCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAAGAGTCTGGGAGACTGGAGGCTGGAGGGGCCAGTCCCAAACTCAGATG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGATCATGTGGATTCAGGTGGCACCAGGAGACCAGGGGTGTCCCCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGATCATGTGGATTCAGGTGGCACCAGGAGACCAGGGGTGTCCCCTGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGGGACTGAGCGTCCCTGGGCCAGGAGCCCCATTGGAGAAACCTGGTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGGGACTGAGCGTCCCTGGGCCAGGAGCCCCATTGGAGAAACCTGGTAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGTGAGAAGCTGTTGGGCTGGCTGCGGGGGGAACCAGGAGCTCCCTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGTGAGAAGCTGTTGGGCTGGCTGCGGGGGGAACCAGGAGCTCCCTCCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTACTTGGGGGGCCCAGAAGAGTGTCTGCAGATCTCCACCAACCTGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTACTTGGGGGGCCCAGAAGAGTGTCTGCAGATCTCCACCAACCTGACCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCATCTTCTGGAGCTGCTGGCCTCTGCCCTGCTGGCCCTGTGCTCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCATCTTCTGGAGCTGCTGGCCTCTGCCCTGCTGGCCCTGTGCTCACGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCACTGCGGGCAGCCTTGGACACACTGGGCCTGCGTGGACCGCTGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCACTGCGGGCAGCCTTGGACACACTGGGCCTGCGTGGACCGCTGGGCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTGGCTACATGGCCTACTGTCCTTCCTGGCTGCCCTGCATGGGCTCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTGGCTACATGGCCTACTGTCCTTCCTGGCTGCCCTGCATGGGCTCCATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTGTTCTGAGCCTACTTACTGCCCACCCTTTGCACTTCGCCTGCCTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTGTTCTGAGCCTACTTACTGCCCACCCTTTGCACTTCGCCTGCCTCTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGTCTCCTGCAGGCCTTGGTGCTGGCTGTCAGCCTCCGGGAGCCCAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGTCTCCTGCAGGCCTTGGTGCTGGCTGTCAGCCTCCGGGAGCCCAATGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGATGAGGCGGCCACTGACTGGGAGAGTGAGGGGTTGGAGAGGGAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGATGAGGCGGCCACTGACTGGGAGAGTGAGGGGTTGGAGAGGGAAGGTG

    850     .    :    .    :    .    :
    851 AGGAGCAGAGGGGAGACCCGGGAAAGGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGGAGCAGAGGGGAGACCCGGGAAAGGGGCTG