seq1 = pF1KB9808.tfa, 723 bp
seq2 = pF1KB9808/gi568815597r_115186073.tfa (gi568815597r:115186073_115386795), 200723 bp

>pF1KB9808 723
>gi568815597r:115186073_115386795 (Chr1)

(complement)

1-723  (100001-100723)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCATGTTGTTCTACACTCTGATCACAGCTTTTCTGATCGGCATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCATGTTGTTCTACACTCTGATCACAGCTTTTCTGATCGGCATACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGGAACCACACTCAGAGAGCAATGTCCCTGCAGGACACACCATCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGGAACCACACTCAGAGAGCAATGTCCCTGCAGGACACACCATCCCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGCCCACTGGACTAAACTTCAGCATTCCCTTGACACTGCCCTTCGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGCCCACTGGACTAAACTTCAGCATTCCCTTGACACTGCCCTTCGCAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCCGCAGCGCCCCGGCAGCGGCGATAGCTGCACGCGTGGCGGGGCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCCGCAGCGCCCCGGCAGCGGCGATAGCTGCACGCGTGGCGGGGCAGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGCAACATTACTGTGGACCCCAGGCTGTTTAAAAAGCAGCGACTCCGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 100201 CCGCAACATTACTGTGGACCCCAGGCTGTTTAAAAAGCGGCGACTCCGTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CACCCCGTGTGCTGTTTAGCACCCAGCCTCCCCGTGAAGCTGCAGACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CACCCCGTGTGCTGTTTAGCACCCAGCCTCCCCGTGAAGCTGCAGACACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGGATCTGGACTTCGAGGTCGGTGGTGCTGCCCCCTTCAACAGGACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGGATCTGGACTTCGAGGTCGGTGGTGCTGCCCCCTTCAACAGGACTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGGAGCAAGCGGTCATCATCCCATCCCATCTTCCACAGGGGCGAATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGGAGCAAGCGGTCATCATCCCATCCCATCTTCCACAGGGGCGAATTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CGGTGTGTGACAGTGTCAGCGTGTGGGTTGGGGATAAGACCACCGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CGGTGTGTGACAGTGTCAGCGTGTGGGTTGGGGATAAGACCACCGCCACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GACATCAAGGGCAAGGAGGTGATGGTGTTGGGAGAGGTGAACATTAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GACATCAAGGGCAAGGAGGTGATGGTGTTGGGAGAGGTGAACATTAACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGTGTATTCAAACAGTACTTTTTTGAGACCAAGTGCCGGGACCCAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAGTGTATTCAAACAGTACTTTTTTGAGACCAAGTGCCGGGACCCAAATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCGTTGACAGCGGGTGCCGGGGCATTGACTCAAAGCACTGGAACTCATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCGTTGACAGCGGGTGCCGGGGCATTGACTCAAAGCACTGGAACTCATAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TGTACCACGACTCACACCTTTGTCAAGGCGCTGACCATGGATGGCAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TGTACCACGACTCACACCTTTGTCAAGGCGCTGACCATGGATGGCAAGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGCTGCCTGGCGGTTTATCCGGATAGATACGGCCTGTGTGTGTGTGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGCTGCCTGGCGGTTTATCCGGATAGATACGGCCTGTGTGTGTGTGCTCA

    700     .    :    .    :
    701 GCAGGAAGGCTGTGAGAAGAGCC
        |||||||||||||||||||||||
 100701 GCAGGAAGGCTGTGAGAAGAGCC