seq1 = pF1KB9807.tfa, 681 bp
seq2 = pF1KB9807/gi568815575f_102026831.tfa (gi568815575f:102026831_102227511), 200681 bp

>pF1KB9807 681
>gi568815575f:102026831_102227511 (ChrX)

1-681  (100001-100681)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAAAACTCTTCAATGAAAATGAAGGAATGCCTTCGAATCAAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAAAACTCTTCAATGAAAATGAAGGAATGCCTTCGAATCAAGGAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATAGACAATGAAGAACAGCCACCGCACGAGGGAAAGCCAGAAGTAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATAGACAATGAAGAACAGCCACCGCACGAGGGAAAGCCAGAAGTAGCTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTATTCTGGAAGACAAGAAGTTAGAAAACGAGGGAAACACAGAAAACACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTATTCTGGAAGACAAGAAGTTAGAAAACGAGGGAAACACAGAAAACACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCAAGAGAGTTGAGGAACCGTTAAAGGATAAAGAAAAGCCAGAGAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCAAGAGAGTTGAGGAACCGTTAAAGGATAAAGAAAAGCCAGAGAGTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGAAAGGCAAAAGGAGAAGGAAAGTCAGAGAGGAAGGGAAAGTCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGAAAGGCAAAAGGAGAAGGAAAGTCAGAGAGGAAGGGAAAGTCAGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCAGGGAGGATCAAAGACAGAGGGAAAGCCAGAGAGAGGGGGAAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCAGGGAGGATCAAAGACAGAGGGAAAGCCAGAGAGAGGGGGAAGGGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGGGTGAAGGAGAGCCAGACAGTGAAAGAGAGCCAGAGAGTGAGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGGGTGAAGGAGAGCCAGACAGTGAAAGAGAGCCAGAGAGTGAGGGAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCCAGAAAGTGAAACAAGGGCTGCAGGAAAGCGCCCAGCTGAGGATGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCCAGAAAGTGAAACAAGGGCTGCAGGAAAGCGCCCAGCTGAGGATGATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TACCCAGGAAAGCCAAAAGAAAAACCAACAAGGGGCTGGCTCAGTACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TACCCAGGAAAGCCAAAAGAAAAACCAACAAGGGGCTGGCTCAGTACCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAGCAATATAAGGAAGCCATACATGATATGAATTTCAGCAATGAGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGCAATATAAGGAAGCCATACATGATATGAATTTCAGCAATGAGGACAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GATAAGAGAATTTGACAACATGGCTAGGGTGGAGGATAAAAGGAGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GATAAGAGAATTTGACAACATGGCTAGGGTGGAGGATAAAAGGAGAAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCAAACAGAAATTGGGGGCGTTTTTGTGGATGCAAAGAAATTTACAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCAAACAGAAATTGGGGGCGTTTTTGTGGATGCAAAGAAATTTACAGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCCTTCTATCCTAGGGGTCCAAGGGAATTCAGGGGTGGCTGCAGGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCCTTCTATCCTAGGGGTCCAAGGGAATTCAGGGGTGGCTGCAGGGCCCC

    650     .    :    .    :    .    :
    651 ACGAAGGGACACTGAAGACATTCCTTATGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 ACGAAGGGACACTGAAGACATTCCTTATGTG