seq1 = pF1KB9789.tfa, 606 bp
seq2 = pF1KB9789/gi568815587f_65790784.tfa (gi568815587f:65790784_65991389), 200606 bp

>pF1KB9789 606
>gi568815587f:65790784_65991389 (Chr11)

1-606  (100001-100606)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGCCGAGGCAGGCGGCCTGGAGGAGCTGACGGACGAGGAGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGCCGAGGCAGGCGGCCTGGAGGAGCTGACGGACGAGGAGATGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGCTAGGCAAGGAAGAGCTAGTGCGGCGCCTGCGGCGGGAGGAGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGCTAGGCAAGGAAGAGCTAGTGCGGCGCCTGCGGCGGGAGGAGGCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCGCCTGGCGGCACTGGTGCAGCGCGGCCGCCTCATGCAGGAGGTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCGCCTGGCGGCACTGGTGCAGCGCGGCCGCCTCATGCAGGAGGTGAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGCAGCTGCAGGGCCACCTGGGCGAGATCCGCGAGCTCAAGCAGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGGCAGCTGCAGGGCCACCTGGGCGAGATCCGCGAGCTCAAGCAGCTCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGGCGTCTGCAGGCAGAGAACCGTGAGCTGCGCGACCTCTGCTGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGGCGTCTGCAGGCAGAGAACCGTGAGCTGCGCGACCTCTGCTGCTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGACTCGGAGCGCCAGCGCGGGCGGCGCGCCGCACGCCAGTGGCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGACTCGGAGCGCCAGCGCGGGCGGCGCGCCGCACGCCAGTGGCAGCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCGGGACCCAAGCATCCCGGGCCGTGCGCGAGGACCTGGGCGGCTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCGGGACCCAAGCATCCCGGGCCGTGCGCGAGGACCTGGGCGGCTGTTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCAGAAGCTGGCCGAGCTGGAGGGCCGCCAGGAGGAGCTGCTGCGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCAGAAGCTGGCCGAGCTGGAGGGCCGCCAGGAGGAGCTGCTGCGGGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCTAGCGCTTAAGGAGCTCTGCCTGGCGCTGGGCGAAGAATGGGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACCTAGCGCTTAAGGAGCTCTGCCTGGCGCTGGGCGAAGAATGGGGCCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGCGGCGGCCCCAGCGGCGCCGGGGGATCAGGAGCCGGGCCAGCACCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGCGGCGGCCCCAGCGGCGCCGGGGGATCAGGAGCCGGGCCAGCACCCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCTTGCCTTGCCCCCGTGCGGGCCCCGCGACCTAGGCGATGGAAGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCTTGCCTTGCCCCCGTGCGGGCCCCGCGACCTAGGCGATGGAAGCTCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCACTGGCAGCGTGGGCAGTCCGGATCAGTTGCCCCTGGCCTGTTCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCACTGGCAGCGTGGGCAGTCCGGATCAGTTGCCCCTGGCCTGTTCCCCC

    600     .
    601 GATGAT
        ||||||
 100601 GATGAT