seq1 = pF1KB9788.tfa, 585 bp
seq2 = pF1KB9788/gi568815589r_21040986.tfa (gi568815589r:21040986_21241570), 200585 bp

>pF1KB9788 585
>gi568815589r:21040986_21241570 (Chr9)

(complement)

1-585  (100001-100585)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCTCCTGTTCCCTCTACTGGCAGCCCTAGTGATGACCAGCTATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCTCCTGTTCCCTCTACTGGCAGCCCTAGTGATGACCAGCTATAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCTGTTGGATCTCTGGGCTGTGATCTGCCTCAGAACCATGGCCTACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCTGTTGGATCTCTGGGCTGTGATCTGCCTCAGAACCATGGCCTACTTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAGGAACACCTTGGTGCTTCTGCACCAAATGAGGAGAATCTCCCCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAGGAACACCTTGGTGCTTCTGCACCAAATGAGGAGAATCTCCCCTTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGTGTCTCAAGGACAGAAGAGACTTCAGGTTCCCCCAGGAGATGGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGTGTCTCAAGGACAGAAGAGACTTCAGGTTCCCCCAGGAGATGGTAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGGGAGCCAGTTGCAGAAGGCCCATGTCATGTCTGTCCTCCATGAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGGGAGCCAGTTGCAGAAGGCCCATGTCATGTCTGTCCTCCATGAGATGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCAGCAGATCTTCAGCCTCTTCCACACAGAGCGCTCCTCTGCTGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCAGCAGATCTTCAGCCTCTTCCACACAGAGCGCTCCTCTGCTGCCTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AACATGACCCTCCTAGACCAACTCCACACTGGACTTCATCAGCAACTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AACATGACCCTCCTAGACCAACTCCACACTGGACTTCATCAGCAACTGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACACCTGGAGACCTGCTTGCTGCAGGTAGTGGGAGAAGGAGAATCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACACCTGGAGACCTGCTTGCTGCAGGTAGTGGGAGAAGGAGAATCTGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGGCAATTAGCAGCCCTGCACTGACCTTGAGGAGGTACTTCCAGGGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGGCAATTAGCAGCCCTGCACTGACCTTGAGGAGGTACTTCCAGGGAATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGTGTCTACCTGAAAGAGAAGAAATACAGCGACTGTGCCTGGGAAGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGTGTCTACCTGAAAGAGAAGAAATACAGCGACTGTGCCTGGGAAGTTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGAATGGAAATCATGAAATCCTTGTTCTTATCAACAAACATGCAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAGAATGGAAATCATGAAATCCTTGTTCTTATCAACAAACATGCAAGAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .
    551 GACTGAGAAGTAAAGATAGAGACCTGGGCTCATCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GACTGAGAAGTAAAGATAGAGACCTGGGCTCATCT