seq1 = pF1KB9786.tfa, 573 bp
seq2 = pF1KB9786/gi568815587r_3727566.tfa (gi568815587r:3727566_3928138), 200573 bp

>pF1KB9786 573
>gi568815587r:3727566_3928138 (Chr11)

(complement)

1-573  (100001-100573)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGAGCATCAAGTGCGTGGTGGTGGGTGATGGGGCTGTGGGCAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGAGCATCAAGTGCGTGGTGGTGGGTGATGGGGCTGTGGGCAAGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGCCTGCTCATCTGCTACACAACTAACGCTTTCCCCAAAGAGTACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGCCTGCTCATCTGCTACACAACTAACGCTTTCCCCAAAGAGTACATCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCACCGTGTTCGACAATTACAGCGCGCAGAGCGCAGTTGACGGGCGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCACCGTGTTCGACAATTACAGCGCGCAGAGCGCAGTTGACGGGCGCACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGAACCTGAACCTGTGGGACACTGCGGGCCAGGAGGAGTATGACCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGAACCTGAACCTGTGGGACACTGCGGGCCAGGAGGAGTATGACCGCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGTACACTCTCCTACCCTCAGACCAACGTTTTCGTCATCTGTTTCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGTACACTCTCCTACCCTCAGACCAACGTTTTCGTCATCTGTTTCTCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTGCCAGTCCGCCGTCCTATGAGAACGTGCGGCACAAGTGGCATCCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTGCCAGTCCGCCGTCCTATGAGAACGTGCGGCACAAGTGGCATCCAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGTGCCACCACTGCCCTGATGTGCCCATCCTGCTGGTGGGCACCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGTGCCACCACTGCCCTGATGTGCCCATCCTGCTGGTGGGCACCAAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGACCTGAGAGCCCAGCCTGACACCCTACGGCGCCTCAAGGAGCAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGACCTGAGAGCCCAGCCTGACACCCTACGGCGCCTCAAGGAGCAGGGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGCGCCCATCACACCGCAGCAGGGCCAGGCACTGGCCAAGCAGATCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGCGCCCATCACACCGCAGCAGGGCCAGGCACTGGCCAAGCAGATCCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCTGTGCGCTACCTCGAATGCTCAGCCCTGCAACAGGATGGTGTCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCTGTGCGCTACCTCGAATGCTCAGCCCTGCAACAGGATGGTGTCAAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGTGTTCGCCGAGGCTGTCCGGGCTGTGCTCAACCCCACGCCGATCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGTGTTCGCCGAGGCTGTCCGGGCTGTGCTCAACCCCACGCCGATCAAGC

    550     .    :    .    :
    551 GTGGGCGGTCCTGCATCCTCTTG
        |||||||||||||||||||||||
 100551 GTGGGCGGTCCTGCATCCTCTTG