seq1 = pF1KB9783.tfa, 753 bp
seq2 = pF1KB9783/gi568815576r_39033894.tfa (gi568815576r:39033894_39252444), 218551 bp

>pF1KB9783 753
>gi568815576r:39033894_39252444 (Chr22)

(complement)

1-69  (100001-100069)   100% ->
70-113  (102613-102656)   100% ->
114-179  (111009-111074)   100% ->
180-246  (113743-113809)   100% ->
247-598  (117693-118044)   100% ->
599-753  (118397-118551)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCTGTCAGCCATCGGCGAGCAGGTGTTCGCCGTGGAGAGCATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCTGTCAGCCATCGGCGAGCAGGTGTTCGCCGTGGAGAGCATCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGAAGCGCGTGCGGAAG         GGTAAAGTCGAGTATCTGGTGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100051 GAAGAAGCGCGTGCGGAAGGTG...CAGGGTAAAGTCGAGTATCTGGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGTGGAAAGGATGGCCCCCAAA         GTACAGCACGTGGGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 102635 AGTGGAAAGGATGGCCCCCAAAGTA...CAGGTACAGCACGTGGGAGCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GAAGAGCACATCTTGGACCCCCGCCTCGTCATGGCCTACGAGGAGAA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 111028 GAAGAGCACATCTTGGACCCCCGCCTCGTCATGGCCTACGAGGAGAAGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    180       GGAGGAGAGAGACCGAGCATCGGGGTATAGGAAGAGAGGTCCGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111078 ...CAGGGAGGAGAGAGACCGAGCATCGGGGTATAGGAAGAGAGGTCCGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AACCCAAGCGGCTTCTGCTGCAG         CGGCTGTACAGCATGGAC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 113787 AACCCAAGCGGCTTCTGCTGCAGGTA...CAGCGGCTGTACAGCATGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 CTGCGGAGCTCCCACAAGGCCAAGGGCAAGGAGAAGCTCTGCTTCTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117711 CTGCGGAGCTCCCACAAGGCCAAGGGCAAGGAGAAGCTCTGCTTCTCCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GACGTGCCCACTCGGCAGCGGGAGCCCTGAGGGGGTGGTCAAGGCGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117761 GACGTGCCCACTCGGCAGCGGGAGCCCTGAGGGGGTGGTCAAGGCGGGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CACCTGAGCTGGTGGACAAGGGCCCCTTGGTGCCCACCCTGCCCTTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117811 CACCTGAGCTGGTGGACAAGGGCCCCTTGGTGCCCACCCTGCCCTTCCCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTCCGCAAGCCCCGAAAGGCCCACAAGTACCTGCGGCTCTCGCGCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117861 CTCCGCAAGCCCCGAAAGGCCCACAAGTACCTGCGGCTCTCGCGCAAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GTTCCCGCCCCGCGGGCCCAACCTGGAGAGCCACAGCCATCGACGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117911 GTTCCCGCCCCGCGGGCCCAACCTGGAGAGCCACAGCCATCGACGGGAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCTTCCTGCAGGAGCCACCGGCCCCAGACGTCCTGCAGGCGGCTGGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117961 TCTTCCTGCAGGAGCCACCGGCCCCAGACGTCCTGCAGGCGGCTGGCGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TGGGAGCCTGCTGCGCAGCCCCCTGAAGAGGAGG         CAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 118011 TGGGAGCCTGCTGCGCAGCCCCCTGAAGAGGAGGGTA...CAGCAGATGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CGACCTGGCCGAGGGGCCCCCTCCCTGGACACCTGCGCTCCCCTCAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118404 CGACCTGGCCGAGGGGCCCCCTCCCTGGACACCTGCGCTCCCCTCAAGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGGTGACCGTGACCGACATCACCGCCAACTCCATCACCGTCACCTTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118454 AGGTGACCGTGACCGACATCACCGCCAACTCCATCACCGTCACCTTCCGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    706 GAGGCCCAGGCAGCTGAGGGCTTCTTCCGAGACCGCAGTGGGAAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118504 GAGGCCCAGGCAGCTGAGGGCTTCTTCCGAGACCGCAGTGGGAAGTTC