seq1 = pF1KB9782.tfa, 627 bp
seq2 = pF1KB9782/gi568815594r_2150547.tfa (gi568815594r:2150547_2361980), 211434 bp

>pF1KB9782 627
>gi568815594r:2150547_2361980 (Chr4)

(complement)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-164  (100157-100256)   100% ->
165-194  (103970-103999)   100% ->
195-309  (109459-109573)   100% ->
310-472  (110735-110897)   100% ->
473-627  (111280-111434)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCTGAACTCCCTGCTGATCCTGCTGGAGGCGGCCGAGTACCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCTGAACTCCCTGCTGATCCTGCTGGAGGCGGCCGAGTACCTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGCAGGGATCGAG         AGGCCGAGCACGGCTACGCCTCGGTGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGCAGGGATCGAGGTA...CAGAGGCCGAGCACGGCTACGCCTCGGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGCCCTTCGACGGCGACTTCGCCAGGGAGAAAACAAAGGCGGCCGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100184 TGCCCTTCGACGGCGACTTCGCCAGGGAGAAAACAAAGGCGGCCGGCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGCGCAAGGCCCCGAACAACAG         GTCTTCACACAACGAGCT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100234 GTGCGCAAGGCCCCGAACAACAGGTA...CAGGTCTTCACACAACGAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGAAAAGCACAG         ACGAGCCAAACTCAGGCTGTACCTTGAGC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103988 AGAAAAGCACAGGTA...CAGACGAGCCAAACTCAGGCTGTACCTTGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AGCTCAAGCAACTGGTGCCCCTGGGCCCCGACAGCACCCGCCACACCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109488 AGCTCAAGCAACTGGTGCCCCTGGGCCCCGACAGCACCCGCCACACCACG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTGAGCCTCCTGAAGCGGGCCAAGGTGCACATCAAG         AAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 109538 CTGAGCCTCCTGAAGCGGGCCAAGGTGCACATCAAGGTG...CAGAAACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GGAGGAGCAGGACCGCCGGGCACTGAGCATCAAGGAGCAGCTGCAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110740 GGAGGAGCAGGACCGCCGGGCACTGAGCATCAAGGAGCAGCTGCAGCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AGCATCGTTTCCTGAAGCGGCGCCTGGAGCAGCTGTCGGTGCAGAGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110790 AGCATCGTTTCCTGAAGCGGCGCCTGGAGCAGCTGTCGGTGCAGAGCGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GAGCGCGTGCGCACAGATAGCACGGGCTCTGCTGTCTCCACGGACGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110840 GAGCGCGTGCGCACAGATAGCACGGGCTCTGCTGTCTCCACGGACGACTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGAGCAAG         AAGTGGACATAGAGGGCATGGAGTTTGGCCCTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 110890 AGAGCAAGGTG...TAGAAGTGGACATAGAGGGCATGGAGTTTGGCCCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GTGAGCTGGACAGTGTTGGCAGCAGCAGTGACGCGGACGACCACTACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111313 GTGAGCTGGACAGTGTTGGCAGCAGCAGTGACGCGGACGACCACTACAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CTGCAGAGTGGCACCGGCGGCGACAGTGGCTTCGGGCCCCACTGCCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111363 CTGCAGAGTGGCACCGGCGGCGACAGTGGCTTCGGGCCCCACTGCCGGCG

    650     .    :    .    :
    606 GCTGGGCCGCCCCGCCCTCTCG
        ||||||||||||||||||||||
 111413 GCTGGGCCGCCCCGCCCTCTCG