seq1 = pF1KB9779.tfa, 2661 bp
seq2 = pF1KB9779/gi568815580f_41855292.tfa (gi568815580f:41855292_42167513), 312222 bp

>pF1KB9779 2661
>gi568815580f:41855292_42167513 (Chr18)

1-68  (100001-100068)   100% ->
69-257  (102279-102467)   100% ->
258-401  (107198-107341)   100% ->
402-531  (115036-115165)   100% ->
532-618  (132521-132607)   100% ->
619-714  (135168-135263)   100% ->
715-786  (137979-138050)   100% ->
787-891  (140599-140703)   100% ->
892-984  (141347-141439)   100% ->
985-1170  (149065-149250)   100% ->
1171-1325  (158151-158305)   100% ->
1326-1416  (160185-160275)   100% ->
1417-1484  (165347-165414)   100% ->
1485-1590  (172152-172257)   100% ->
1591-1707  (174034-174150)   100% ->
1708-1839  (178535-178666)   100% ->
1840-1968  (182401-182529)   100% ->
1969-2038  (183490-183559)   100% ->
2039-2103  (185386-185450)   100% ->
2104-2188  (188442-188526)   100% ->
2189-2263  (194240-194314)   100% ->
2264-2432  (202592-202760)   100% ->
2433-2523  (209449-209539)   100% ->
2524-2649  (212097-212222)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGGAAGCAGAGAAGTTTCACTACATCTATAGTTGTGACCTGGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGGAAGCAGAGAAGTTTCACTACATCTATAGTTGTGACCTGGATAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAACGTCCAGCTTAAGAT         AGGAAGCTTGGAAGGGAAGAGAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100051 CAACGTCCAGCTTAAGATGTA...CAGAGGAAGCTTGGAAGGGAAGAGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AACAAAAGAGTTATAAAGCTGTCCTGGAAGACCCAATGTTGAAGTTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102302 AACAAAAGAGTTATAAAGCTGTCCTGGAAGACCCAATGTTGAAGTTCTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGACTATATCAAGAGACATGCTCTGATCTTTATGTTACTTGTCAAGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102352 GGACTATATCAAGAGACATGCTCTGATCTTTATGTTACTTGTCAAGTTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGCAGAAGGGAAGCCTTTGGCCTTGCCAGTGAGAACATCCTACAAAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102402 TGCAGAAGGGAAGCCTTTGGCCTTGCCAGTGAGAACATCCTACAAAGCAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTAGTACAAGATGGAA         CTGGAATGAATGGCTGAAACTACCA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 102452 TTAGTACAAGATGGAAGTA...TAGCTGGAATGAATGGCTGAAACTACCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTAAAATACCCTGACCTGCCCAGGAATGCCCAAGTGGCCCTCACCATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107223 GTAAAATACCCTGACCTGCCCAGGAATGCCCAAGTGGCCCTCACCATATG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGATGTGTATGGTCCCGGAAAAGCAGTGCCTGTAGGAGGAACAACGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107273 GGATGTGTATGGTCCCGGAAAAGCAGTGCCTGTAGGAGGAACAACGGTTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CGCTCTTTGGAAAATACGG         CATGTTTCGCCAAGGGATGCAT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 107323 CGCTCTTTGGAAAATACGGGTA...TAGCATGTTTCGCCAAGGGATGCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GACTTGAAAGTCTGGCCTAATGTAGAAGCAGATGGATCAGAACCCACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115058 GACTTGAAAGTCTGGCCTAATGTAGAAGCAGATGGATCAGAACCCACAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AACTCCTGGCAGAACAAGTAGCACTCTCTCAGAAGATCAGATGAGCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115108 AACTCCTGGCAGAACAAGTAGCACTCTCTCAGAAGATCAGATGAGCCGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTGCCAAG         CTCACCAAAGCTCATCGACAAGGACACATGGTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 115158 TTGCCAAGGTA...CAGCTCACCAAAGCTCATCGACAAGGACACATGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AAAGTAGATTGGCTGGATAGATTGACATTTAGAGAAATAGAAATGATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132554 AAAGTAGATTGGCTGGATAGATTGACATTTAGAGAAATAGAAATGATAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGAG         AGTGAAAAACGAAGTTCTAATTTCATGTACCTGATGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132604 TGAGGTG...CAGAGTGAAAAACGAAGTTCTAATTTCATGTACCTGATGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTGAATTTCGATGTGTCAAGTGTGATGATAAGGAATATGGTATTGTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135205 TTGAATTTCGATGTGTCAAGTGTGATGATAAGGAATATGGTATTGTTTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TATGAAAAG         GACGGTGATGAATCATCTCCAATTTTAACAAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 135255 TATGAAAAGGTA...TAGGACGGTGATGAATCATCTCCAATTTTAACAAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TTTTGAATTAGTGAAAGTTCCTGACCCCCAGATGTCTATG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 138011 TTTTGAATTAGTGAAAGTTCCTGACCCCCAGATGTCTATGGTA...TAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AGAATTTAGTTGAGAGCAAACACCACAAGCTTGCCCGGAGTTTAAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140600 AGAATTTAGTTGAGAGCAAACACCACAAGCTTGCCCGGAGTTTAAGAAGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GGACCTTCTGACCACGATCTGAAACCCAATGCTGCCACGAGAGATCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140650 GGACCTTCTGACCACGATCTGAAACCCAATGCTGCCACGAGAGATCAGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 AAAT         ATTATTGTGAGTTATCCACCAACCAAGCAACTTACAT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140700 AAATGTA...TAGATTATTGTGAGTTATCCACCAACCAAGCAACTTACAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ATGAAGAACAAGATCTTGTTTGGAAGTTTAGATATTATCTTACGAATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141384 ATGAAGAACAAGATCTTGTTTGGAAGTTTAGATATTATCTTACGAATCAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GAAAAA         GCCTTGACAAAATTCTTGAAATGTGTTAATTGGGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141434 GAAAAAGTG...TAGGCCTTGACAAAATTCTTGAAATGTGTTAATTGGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TCTACCTCAAGAGGCCAAACAGGCCTTGGAACTTCTGGGAAAATGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149100 TCTACCTCAAGAGGCCAAACAGGCCTTGGAACTTCTGGGAAAATGGAAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CGATGGATGTAGAGGACTCCTTGGAGCTGTTATCCTCTCATTACACCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149150 CGATGGATGTAGAGGACTCCTTGGAGCTGTTATCCTCTCATTACACCAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CCAACTGTGAGGCGTTATGCTGTTGCCCGGTTGCGACAGGCCGATGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149200 CCAACTGTGAGGCGTTATGCTGTTGCCCGGTTGCGACAGGCCGATGATGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 G         GATTTGTTGATGTACCTATTACAATTGGTCCAGGCTCTCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149250 GGTG...CAGGATTTGTTGATGTACCTATTACAATTGGTCCAGGCTCTCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AATATGAAAATTTTGATGATATAAAGAATGGATTGGAACCTACCAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158191 AATATGAAAATTTTGATGATATAAAGAATGGATTGGAACCTACCAAGAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GATAGTCAGAGTTCAGTGTCAGAAAATGTGTCAAATTCTGGAATAAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158241 GATAGTCAGAGTTCAGTGTCAGAAAATGTGTCAAATTCTGGAATAAATTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TGCAGAAATAGATAG         CTCCCAAATTATAACCAGCCCCCTTC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 158291 TGCAGAAATAGATAGGTA...CAGCTCCCAAATTATAACCAGCCCCCTTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CTTCAGTCTCTTCACCTCCTCCTGCATCAAAAACAAAAGAAGTTCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160211 CTTCAGTCTCTTCACCTCCTCCTGCATCAAAAACAAAAGAAGTTCCAGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GGCGAAAATCTGGAA         CAAGATCTCTGTACCTTCTTGATATC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 160261 GGCGAAAATCTGGAAGTG...CAGCAAGATCTCTGTACCTTCTTGATATC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 GAGAGCCTGCAAAAACTCAACACTGGCTAATTATTTATACTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 165373 GAGAGCCTGCAAAAACTCAACACTGGCTAATTATTTATACTGGTA...AA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1485  GTATGTGATAGTGGAATGTGAAGATCAAGATACTCAGCAGAGAGATCCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172151 GGTATGTGATAGTGGAATGTGAAGATCAAGATACTCAGCAGAGAGATCCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 AAGACCCATGAGATGTACTTGAACGTAATGAGAAGATTCAGCCAAGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172201 AAGACCCATGAGATGTACTTGAACGTAATGAGAAGATTCAGCCAAGCATT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 GTTGAAG         GGTGATAAGTCTGTCAGAGTTATGCGTTCTTTGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172251 GTTGAAGGTA...CAGGGTGATAAGTCTGTCAGAGTTATGCGTTCTTTGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 TGGCTGCACAACAGACATTTGTAGATCGGTTGGTGCATCTAATGAAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174068 TGGCTGCACAACAGACATTTGTAGATCGGTTGGTGCATCTAATGAAGGCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 GTACAACGCGAAAGTGGAAATCGTAAGAAAAAG         AATGAGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 174118 GTACAACGCGAAAGTGGAAATCGTAAGAAAAAGGTA...TAGAATGAGAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 ACTACAGGCATTGCTTGGAGATAATGAAAAGATGAATTTGTCAGATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178543 ACTACAGGCATTGCTTGGAGATAATGAAAAGATGAATTTGTCAGATGTGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 AACTTATCCCGTTGCCTTTAGAACCCCAAGTGAAAATTAGAGGAATAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178593 AACTTATCCCGTTGCCTTTAGAACCCCAAGTGAAAATTAGAGGAATAATT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 CCGGAAACAGCTACACTGTTTAAA         AGTGCCCTTATGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 178643 CCGGAAACAGCTACACTGTTTAAAGTA...CAGAGTGCCCTTATGCCTGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 ACAGTTGTTTTTTAAGACGGAAGATGGAGGCAAATATCCAGTTATATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182418 ACAGTTGTTTTTTAAGACGGAAGATGGAGGCAAATATCCAGTTATATTTA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 AGCATGGAGATGATTTACGTCAAGATCAACTTATTCTTCAAATCATTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182468 AGCATGGAGATGATTTACGTCAAGATCAACTTATTCTTCAAATCATTTCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 CTCATGGACAAG         CTGTTACGGAAAGAAAATCTGGACTTGAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 182518 CTCATGGACAAGGTG...AAGCTGTTACGGAAAGAAAATCTGGACTTGAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 ATTGACACCTTATAAGGTGTTAGCCACCAGTACAAAACATG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 183519 ATTGACACCTTATAAGGTGTTAGCCACCAGTACAAAACATGGTA...TAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2039 GCTTCATGCAGTTTATCCAGTCAGTTCCTGTGGCTGAAGTTCTTGATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185386 GCTTCATGCAGTTTATCCAGTCAGTTCCTGTGGCTGAAGTTCTTGATACA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 GAGGGAAGCATTCAG         AACTTTTTTAGAAAATATGCACCAAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 185436 GAGGGAAGCATTCAGGTA...CAGAACTTTTTTAGAAAATATGCACCAAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2130 TGAGAATGGGCCAAATGGGATTAGTGCTGAGGTCATGGACACTTACGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188468 TGAGAATGGGCCAAATGGGATTAGTGCTGAGGTCATGGACACTTACGTTA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2180 AAAGCTGTG         CTGGATATTGCGTGATCACCTATATACTTGGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 188518 AAAGCTGTGGTA...CAGCTGGATATTGCGTGATCACCTATATACTTGGA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2221 GTTGGAGACAGGCACCTGGATAACCTTTTGCTAACAAAAACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 194272 GTTGGAGACAGGCACCTGGATAACCTTTTGCTAACAAAAACAGGTA...C

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2264   GCAAACTCTTCCACATAGACTTTGGATATATTTTGGGTCGGGATCCAA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202590 AGGCAAACTCTTCCACATAGACTTTGGATATATTTTGGGTCGGGATCCAA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2312 AGCCTCTTCCTCCACCAATGAAGCTGAATAAAGAAATGGTAGAAGGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202640 AGCCTCTTCCTCCACCAATGAAGCTGAATAAAGAAATGGTAGAAGGAATG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2362 GGGGGCACACAGAGTGAGCAGTACCAAGAGTTCCGTAAACAGTGTTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202690 GGGGGCACACAGAGTGAGCAGTACCAAGAGTTCCGTAAACAGTGTTACAC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2412 GGCTTTCCTCCACCTGCGAAG         GTATTCTAATCTGATTTTGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 202740 GGCTTTCCTCCACCTGCGAAGGTA...TAGGTATTCTAATCTGATTTTGA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2453 ACTTGTTTTCCTTGATGGTTGATGCAAACATTCCAGATATTGCACTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209469 ACTTGTTTTCCTTGATGGTTGATGCAAACATTCCAGATATTGCACTTGAA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2503 CCAGATAAAACTGTGAAAAAG         GTTCAGGATAAATTCCGCTT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 209519 CCAGATAAAACTGTGAAAAAGGTA...TAGGTTCAGGATAAATTCCGCTT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2544 AGACCTGTCGGATGAAGAGGCTGTGCATTACATGCAGAGTCTGATTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212117 AGACCTGTCGGATGAAGAGGCTGTGCATTACATGCAGAGTCTGATTGATG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2594 AGAGTGTCCATGCTCTTTTTGCTGCAGTGGTGGAACAGATTCACAAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212167 AGAGTGTCCATGCTCTTTTTGCTGCAGTGGTGGAACAGATTCACAAGTTT

   2850     .
   2644 GCCCAG
        ||||||
 212217 GCCCAG