seq1 = pF1KB9778.tfa, 2394 bp
seq2 = pF1KB9778/gi568815588r_32801573.tfa (gi568815588r:32801573_33035558), 233986 bp

>pF1KB9778 2394
>gi568815588r:32801573_33035558 (Chr10)

(complement)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-153  (102959-103044)   100% ->
154-376  (105515-105737)   100% ->
377-547  (107295-107465)   99% ->
548-786  (109450-109688)   100% ->
787-942  (111819-111974)   100% ->
943-1038  (112824-112919)   100% ->
1039-1128  (113213-113302)   98% ->
1129-1269  (115174-115314)   100% ->
1270-1469  (115475-115674)   100% ->
1470-1708  (123435-123673)   100% ->
1709-1931  (123889-124111)   100% ->
1932-2164  (125104-125336)   100% ->
2165-2331  (127025-127191)   100% ->
2332-2394  (133924-133986)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATTTACAACCAATTTTCTGGATTGGACTGATCAGTTCAGTTTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATTTACAACCAATTTTCTGGATTGGACTGATCAGTTCAGTTTGCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTGTTTGCTCAAACAG         ATGAAAATAGATGTTTAAAAGCAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTGTTTGCTCAAACAGGTA...CAGATGAAAATAGATGTTTAAAAGCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGCCAAATCATGTGGAGAATGTATACAAGCAGGGCCAAATTGTGGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102983 ATGCCAAATCATGTGGAGAATGTATACAAGCAGGGCCAAATTGTGGGTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGCACAAATTCA         ACATTTTTACAGGAAGGAATGCCTACTTC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103033 TGCACAAATTCAGTA...TAGACATTTTTACAGGAAGGAATGCCTACTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGCACGATGTGATGATTTAGAAGCCTTAAAAAAGAAGGGTTGCCCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105544 TGCACGATGTGATGATTTAGAAGCCTTAAAAAAGAAGGGTTGCCCTCCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGACATAGAAAATCCCAGAGGCTCCAAAGATATAAAGAAAAATAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105594 ATGACATAGAAAATCCCAGAGGCTCCAAAGATATAAAGAAAAATAAAAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTAACCAACCGTAGCAAAGGAACAGCAGAGAAGCTCAAGCCAGAGGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105644 GTAACCAACCGTAGCAAAGGAACAGCAGAGAAGCTCAAGCCAGAGGATAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TACTCAGATCCAACCACAGCAGTTGGTTTTGCGATTAAGATCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 105694 TACTCAGATCCAACCACAGCAGTTGGTTTTGCGATTAAGATCAGGTA...

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    377    GGGAGCCACAGACATTTACATTAAAATTCAAGAGAGCTGAAGACTAT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107292 TAGGGGAGCCACAGACATTTACATTAAAATTCAAGAGAGCTGAAGACTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCCATTGACCTCTACTACCTTATGGACCTGTCTTATTCAATGAAAGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 107342 CCCATTGACCTCTACTACCTTATGGACCTGTCTTACTCAATGAAAGACGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TTTGGAGAATGTAAAAAGTCTTGGAACAGATCTGATGAATGAAATGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107392 TTTGGAGAATGTAAAAAGTCTTGGAACAGATCTGATGAATGAAATGAGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGATTACTTCGGACTTCAGAATTG         GATTTGGCTCATTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 107442 GGATTACTTCGGACTTCAGAATTGGTA...CAGGATTTGGCTCATTTGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAAAAGACTGTGATGCCTTACATTAGCACAACACCAGCTAAGCTCAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109467 GAAAAGACTGTGATGCCTTACATTAGCACAACACCAGCTAAGCTCAGGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCCTTGCACAAGTGAACAGAACTGCACCAGCCCATTTAGCTACAAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109517 CCCTTGCACAAGTGAACAGAACTGCACCAGCCCATTTAGCTACAAAAATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGCTCAGTCTTACTAATAAAGGAGAAGTATTTAATGAACTTGTTGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109567 TGCTCAGTCTTACTAATAAAGGAGAAGTATTTAATGAACTTGTTGGAAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CAGCGCATATCTGGAAATTTGGATTCTCCAGAAGGTGGTTTCGATGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109617 CAGCGCATATCTGGAAATTTGGATTCTCCAGAAGGTGGTTTCGATGCCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CATGCAAGTTGCAGTTTGTGGA         TCACTGATTGGCTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 109667 CATGCAAGTTGCAGTTTGTGGAGTA...AAGTCACTGATTGGCTGGAGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ATGTTACACGGCTGCTGGTGTTTTCCACAGATGCCGGGTTTCACTTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111838 ATGTTACACGGCTGCTGGTGTTTTCCACAGATGCCGGGTTTCACTTTGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GGAGATGGGAAACTTGGTGGCATTGTTTTACCAAATGATGGACAATGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111888 GGAGATGGGAAACTTGGTGGCATTGTTTTACCAAATGATGGACAATGTCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CCTGGAAAATAATATGTACACAATGAGCCATTATTAT         GATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 111938 CCTGGAAAATAATATGTACACAATGAGCCATTATTATGTA...TAGGATT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ATCCTTCTATTGCTCACCTTGTCCAGAAACTGAGTGAAAATAATATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112828 ATCCTTCTATTGCTCACCTTGTCCAGAAACTGAGTGAAAATAATATTCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 ACAATTTTTGCAGTTACTGAAGAATTTCAGCCTGTTTACAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 112878 ACAATTTTTGCAGTTACTGAAGAATTTCAGCCTGTTTACAAGGTA...CA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1039  GAGCTGAAAAACTTGATCCCTAAGTCAGCAGTAGGAACATTATCTGCCA
        >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 113212 GGAGCTGAAAAACTTGATCCCTAAGTCAGCAGTAGGAACATTATCTGCAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ATTCTAGCAATGTAATTCAGTTGATCATTGATGCATACAAT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 113262 ATTCTAGCAATGTAATTCAGTTGATCATTGATGCATACAATGTG...TAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TCCCTTTCCTCAGAAGTCATTTTGGAAAACGGCAAATTGTCAGAAGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115174 TCCCTTTCCTCAGAAGTCATTTTGGAAAACGGCAAATTGTCAGAAGGCGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AACAATAAGTTACAAATCTTACTGCAAGAACGGGGTGAATGGAACAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115224 AACAATAAGTTACAAATCTTACTGCAAGAACGGGGTGAATGGAACAGGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AAAATGGAAGAAAATGTTCCAATATTTCCATTGGAGATGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 115274 AAAATGGAAGAAAATGTTCCAATATTTCCATTGGAGATGAGGTA...AAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GTTCAATTTGAAATTAGCATAACTTCAAATAAGTGTCCAAAAAAGGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115475 GTTCAATTTGAAATTAGCATAACTTCAAATAAGTGTCCAAAAAAGGATTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TGACAGCTTTAAAATTAGGCCTCTGGGCTTTACGGAGGAAGTAGAGGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115525 TGACAGCTTTAAAATTAGGCCTCTGGGCTTTACGGAGGAAGTAGAGGTTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TTCTTCAGTACATCTGTGAATGTGAATGCCAAAGCGAAGGCATCCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115575 TTCTTCAGTACATCTGTGAATGTGAATGCCAAAGCGAAGGCATCCCTGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 AGTCCCAAGTGTCATGAAGGAAATGGGACATTTGAGTGTGGCGCGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115625 AGTCCCAAGTGTCATGAAGGAAATGGGACATTTGAGTGTGGCGCGTGCAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470          GTGCAATGAAGGGCGTGTTGGTAGACATTGTGAATGCAGCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115675 GTA...CAGGTGCAATGAAGGGCGTGTTGGTAGACATTGTGAATGCAGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CAGATGAAGTTAACAGTGAAGACATGGATGCTTACTGCAGGAAAGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123476 CAGATGAAGTTAACAGTGAAGACATGGATGCTTACTGCAGGAAAGAAAAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 AGTTCAGAAATCTGCAGTAACAATGGAGAGTGCGTCTGCGGACAGTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123526 AGTTCAGAAATCTGCAGTAACAATGGAGAGTGCGTCTGCGGACAGTGTGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 TTGTAGGAAGAGGGATAATACAAATGAAATTTATTCTGGCAAATTCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123576 TTGTAGGAAGAGGGATAATACAAATGAAATTTATTCTGGCAAATTCTGCG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 AGTGTGATAATTTCAACTGTGATAGATCCAATGGCTTAATTTGTGGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 123626 AGTGTGATAATTTCAACTGTGATAGATCCAATGGCTTAATTTGTGGAGGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1709        GAAATGGTGTTTGCAAGTGTCGTGTGTGTGAGTGCAACCCCAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123676 A...CAGGAAATGGTGTTTGCAAGTGTCGTGTGTGTGAGTGCAACCCCAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CTACACTGGCAGTGCATGTGACTGTTCTTTGGATACTAGTACTTGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123932 CTACACTGGCAGTGCATGTGACTGTTCTTTGGATACTAGTACTTGTGAAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 CCAGCAACGGACAGATCTGCAATGGCCGGGGCATCTGCGAGTGTGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123982 CCAGCAACGGACAGATCTGCAATGGCCGGGGCATCTGCGAGTGTGGTGTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 TGTAAGTGTACAGATCCGAAGTTTCAAGGGCAAACGTGTGAGATGTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124032 TGTAAGTGTACAGATCCGAAGTTTCAAGGGCAAACGTGTGAGATGTGTCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 GACCTGCCTTGGTGTCTGTGCTGAGCATAA         AGAATGTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 124082 GACCTGCCTTGGTGTCTGTGCTGAGCATAAGTA...CAGAGAATGTGTTC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 AGTGCAGAGCCTTCAATAAAGGAGAAAAGAAAGACACATGCACACAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125115 AGTGCAGAGCCTTCAATAAAGGAGAAAAGAAAGACACATGCACACAGGAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 TGTTCCTATTTTAACATTACCAAGGTAGAAAGTCGGGACAAATTACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125165 TGTTCCTATTTTAACATTACCAAGGTAGAAAGTCGGGACAAATTACCCCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 GCCGGTCCAACCTGATCCTGTGTCCCATTGTAAGGAGAAGGATGTTGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125215 GCCGGTCCAACCTGATCCTGTGTCCCATTGTAAGGAGAAGGATGTTGACG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 ACTGTTGGTTCTATTTTACGTATTCAGTGAATGGGAACAACGAGGTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125265 ACTGTTGGTTCTATTTTACGTATTCAGTGAATGGGAACAACGAGGTCATG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2143 GTTCATGTTGTGGAGAATCCAG         AGTGTCCCACTGGTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 125315 GTTCATGTTGTGGAGAATCCAGGTA...CAGAGTGTCCCACTGGTCCAGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 CATCATTCCAATTGTAGCTGGTGTGGTTGCTGGAATTGTTCTTATTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127044 CATCATTCCAATTGTAGCTGGTGTGGTTGCTGGAATTGTTCTTATTGGCC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 TTGCATTACTGCTGATATGGAAGCTTTTAATGATAATTCATGACAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127094 TTGCATTACTGCTGATATGGAAGCTTTTAATGATAATTCATGACAGAAGG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2284 GAGTTTGCTAAATTTGAAAAGGAGAAAATGAATGCCAAATGGGACACG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 127144 GAGTTTGCTAAATTTGAAAAGGAGAAAATGAATGCCAAATGGGACACGGT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2332        GGTGAAAATCCTATTTATAAGAGTGCCGTAACAACTGTGGTCA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127194 A...TAGGGTGAAAATCCTATTTATAAGAGTGCCGTAACAACTGTGGTCA

   2500     .    :    .    :
   2375 ATCCGAAGTATGAGGGAAAA
        ||||||||||||||||||||
 133967 ATCCGAAGTATGAGGGAAAA