seq1 = pF1KB9774.tfa, 2013 bp
seq2 = pF1KB9774/gi568815591f_149095590.tfa (gi568815591f:149095590_149324644), 229055 bp

>pF1KB9774 2013
>gi568815591f:149095590_149324644 (Chr7)

1-165  (100001-100165)   100% ->
166-585  (102744-103163)   100% ->
586-712  (111107-111233)   100% ->
713-832  (111762-111881)   100% ->
833-952  (114996-115115)   100% ->
953-1066  (116769-116882)   100% ->
1067-1180  (118112-118225)   100% ->
1181-2013  (128223-129055)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGTTTGTGTCAACACGGCCGCAGCCTCAGCAGCTGGGCATCCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGTTTGTGTCAACACGGCCGCAGCCTCAGCAGCTGGGCATCCAGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGGGCTGGACAGCGGGAGCTGGAGCTGGGCCCAGGCTCTGCCCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGGGGCTGGACAGCGGGAGCTGGAGCTGGGCCCAGGCTCTGCCCCCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGAGGTCTGCCACCAGGAGCCGGCGCTGCGCGGGGAAATGGCCGAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGAGGTCTGCCACCAGGAGCCGGCGCTGCGCGGGGAAATGGCCGAGGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGCCGCCCATGCAG         GCTCAAGAATGGGACATGGACGCCCG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATGCCGCCCATGCAGGTG...CAGGCTCAAGAATGGGACATGGACGCCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCGGCCAATGCCTTTTCAGTTCCCACCCTTTCCAGATAGGGCACCTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102770 GCGGCCAATGCCTTTTCAGTTCCCACCCTTTCCAGATAGGGCACCTGTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCCCCGACCGCATGATGCGAGAGCCCCAGTTGCCCACAGCAGAGATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102820 TCCCCGACCGCATGATGCGAGAGCCCCAGTTGCCCACAGCAGAGATCTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTCTGGACTGTGGTGGCTGCCATTCAGGCTGTGGAGAGGAAGGTGGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102870 CTCTGGACTGTGGTGGCTGCCATTCAGGCTGTGGAGAGGAAGGTGGATGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCAGGCCAGCCAGCTGCTGAACCTGGAGGGGCGCACGGGGACAGCCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102920 CCAGGCCAGCCAGCTGCTGAACCTGGAGGGGCGCACGGGGACAGCCGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGAAGCTGGCCGACTGTGAAAAGACGGCCGTGGAATTTGGGAACCACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102970 AGAAGCTGGCCGACTGTGAAAAGACGGCCGTGGAATTTGGGAACCACATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAGAGCAAGTGGGCCGTGCTGGGGACCCTGCTGCAGGAGTACGGGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103020 GAGAGCAAGTGGGCCGTGCTGGGGACCCTGCTGCAGGAGTACGGGCTGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCAGAGGCGGCTGGAGAACTTGGAGAACTTGCTGCGCAACAGGAACTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103070 GCAGAGGCGGCTGGAGAACTTGGAGAACTTGCTGCGCAACAGGAACTTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GGGTCCTGCGGCTGCCCCCGGGCAGCAAGGGGGAGGCCCCCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 103120 GGGTCCTGCGGCTGCCCCCGGGCAGCAAGGGGGAGGCCCCCAAGGTA...

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    586    GTTCCAGTGACTTTTGTCGACATTGCTGTGTACTTCTCCGAAGACGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111104 TAGGTTCCAGTGACTTTTGTCGACATTGCTGTGTACTTCTCCGAAGACGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GTGGAAGAACTTGGACGAATGGCAGAAGGAGCTTTATAACAACCTTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111154 GTGGAAGAACTTGGACGAATGGCAGAAGGAGCTTTATAACAACCTTGTTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGGAGAACTACAAAACCCTCATGTCCCTGG         ACGCGGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 111204 AGGAGAACTACAAAACCCTCATGTCCCTGGGTA...CAGACGCGGAGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TCAGTCCCCAAGCCAGATGCTCCAGTCCAGGCTGAGCCCAGGGAAGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111773 TCAGTCCCCAAGCCAGATGCTCCAGTCCAGGCTGAGCCCAGGGAAGAACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TTGTGTGTGGGAGCAGCGCCACCCCGAAGAGAGAGAAATCCCAATGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111823 TTGTGTGTGGGAGCAGCGCCACCCCGAAGAGAGAGAAATCCCAATGGATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CCGAAGCAG         GAGCAGAGCCCCTGGTGCCTGCGCAGGATGCG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 111873 CCGAAGCAGGTG...CAGGAGCAGAGCCCCTGGTGCCTGCGCAGGATGCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TCCTCCCAGGTGAAGCGTGAGGACACCCTGTGTGTCCGGGGTCAGCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115028 TCCTCCCAGGTGAAGCGTGAGGACACCCTGTGTGTCCGGGGTCAGCGGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CCTGGAGGAAAGAGCCATCCCTACGGAATCCATTACCG         ACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 115078 CCTGGAGGAAAGAGCCATCCCTACGGAATCCATTACCGGTG...TAGACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CCCCAATTTCTGCCCAGGACCTCTTGTCCCGGATTAAACAGGAGGAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116772 CCCCAATTTCTGCCCAGGACCTCTTGTCCCGGATTAAACAGGAGGAGCAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CAGTGCGTGTGGGATCAGCAGGATTTGGCAGACAGAGATATTCCCACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116822 CAGTGCGTGTGGGATCAGCAGGATTTGGCAGACAGAGATATTCCCACGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TCCCAATTCAG         AGTCTCTCATCTCAGCACATGACATTTTGT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 116872 TCCCAATTCAGGTG...CAGAGTCTCTCATCTCAGCACATGACATTTTGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CATGGATCAAGCAGGAGGAGCAGCCATACCCATGGGGACCACGCGACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118142 CATGGATCAAGCAGGAGGAGCAGCCATACCCATGGGGACCACGCGACTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 ATGGACGGAGAGCTTGGATTAGACTCTGGCCCTA         GTGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 118192 ATGGACGGAGAGCTTGGATTAGACTCTGGCCCTAGTG...CAGGTGACAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CCTGCTGATGGTGAAGAACCCACCCCCGGCCCCGCCACAGCCCCAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128230 CCTGCTGATGGTGAAGAACCCACCCCCGGCCCCGCCACAGCCCCAGCCCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 AGCCCCAGCCACCGCAGCCGCAGCTGCAGTCGCAGCCCCAGCCCCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128280 AGCCCCAGCCACCGCAGCCGCAGCTGCAGTCGCAGCCCCAGCCCCAGAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 CTGCCCCCCATCGCGGTGGCCGAGAACCCGGGCGGCCCCCCGAGCCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128330 CTGCCCCCCATCGCGGTGGCCGAGAACCCGGGCGGCCCCCCGAGCCGAGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GCTGCTGGACGACGGTTTCCAGGTGCTGCCCGGGGAGCGTGGCTCCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128380 GCTGCTGGACGACGGTTTCCAGGTGCTGCCCGGGGAGCGTGGCTCCGGCG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 AGGCGCCGCCGGGTGGGGACCGCAGCACCGGGGGCGGCGGGGGCGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128430 AGGCGCCGCCGGGTGGGGACCGCAGCACCGGGGGCGGCGGGGGCGATGGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 GGCGGTGGGGGCGGCGGCGCGGAGGCGGGGACGGGGGCAGGCGGCGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128480 GGCGGTGGGGGCGGCGGCGCGGAGGCGGGGACGGGGGCAGGCGGCGGCTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 TGGCAGCTGCTGCCCTGGCGGGCTGCGGCGGAGCCTCCTCCTGCACGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128530 TGGCAGCTGCTGCCCTGGCGGGCTGCGGCGGAGCCTCCTCCTGCACGGCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 CCCGCAGCAAGCCCTACTCGTGCCCCGAGTGCGGCAAGAGCTTCGGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128580 CCCGCAGCAAGCCCTACTCGTGCCCCGAGTGCGGCAAGAGCTTCGGCGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 CGCAAGAGCCTCATCATCCACCACCGCAGCCACACCAAGGAGCGGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128630 CGCAAGAGCCTCATCATCCACCACCGCAGCCACACCAAGGAGCGGCCCTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 CGAGTGCGCTGAGTGCGAGAAGAGCTTCAACTGCCACTCGGGCCTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128680 CGAGTGCGCTGAGTGCGAGAAGAGCTTCAACTGCCACTCGGGCCTCATCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 GCCACCAGATGACGCACCGCGGCGAGCGGCCCTACAAGTGCTCGGAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128730 GCCACCAGATGACGCACCGCGGCGAGCGGCCCTACAAGTGCTCGGAGTGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 GAGAAGACCTACAGCCGTAAGGAGCACCTGCAGAACCACCAGCGGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128780 GAGAAGACCTACAGCCGTAAGGAGCACCTGCAGAACCACCAGCGGCTGCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 CACGGGCGAGCGGCCTTTCCAATGTGCACTGTGCGGCAAGAGCTTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128830 CACGGGCGAGCGGCCTTTCCAATGTGCACTGTGCGGCAAGAGCTTCATCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 GCAAGCAGAACCTGCTCAAGCACCAGCGCATCCACACGGGCGAGCGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128880 GCAAGCAGAACCTGCTCAAGCACCAGCGCATCCACACGGGCGAGCGCCCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1888 TACACGTGCGGCGAGTGCGGCAAGAGCTTCCGCTACAAGGAGTCGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128930 TACACGTGCGGCGAGTGCGGCAAGAGCTTCCGCTACAAGGAGTCGCTCAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1938 GGACCACCTGCGCGTGCACAGCGGCGGCCCGGGCCCCGGCGCCCCACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128980 GGACCACCTGCGCGTGCACAGCGGCGGCCCGGGCCCCGGCGCCCCACGGC

   2050     .    :    .    :    .
   1988 AGCTCCCGCCGCCTCCTGAGCAAGAC
        ||||||||||||||||||||| ||||
 129030 AGCTCCCGCCGCCTCCTGAGCGAGAC