seq1 = pF1KB9773.tfa, 1923 bp
seq2 = pF1KB9773/gi568815592f_31817680.tfa (gi568815592f:31817680_31929869), 112190 bp

>pF1KB9773 1923
>gi568815592f:31817680_31929869 (Chr6)

1-1923  (10272-12194)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAAAGCCGCGGCGATCGGCATCGACCTGGGCACCACCTACTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  10272 ATGGCCAAAGCCGCGGCGATCGGCATCGACCTGGGCACCACCTACTCCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGTGGGGGTGTTCCAACACGGCAAGGTGGAGATCATCGCCAACGACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  10322 CGTGGGGGTGTTCCAACACGGCAAGGTGGAGATCATCGCCAACGACCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAACCGCACCACCCCCAGCTACGTGGCCTTCACGGACACCGAGCGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  10372 GCAACCGCACCACCCCCAGCTACGTGGCCTTCACGGACACCGAGCGGCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCGGGGATGCGGCCAAGAACCAGGTGGCGCTGAACCCGCAGAACACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  10422 ATCGGGGATGCGGCCAAGAACCAGGTGGCGCTGAACCCGCAGAACACCGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTTTGACGCGAAGCGGCTGATCGGCCGCAAGTTCGGCGACCCGGTGGTGC
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
  10472 GTTTGACGCGAAGCGGCTGATTGGCCGCAAGTTCGGCGACCCGGTGGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGTCGGACATGAAGCACTGGCCTTTCCAGGTGATCAACGACGGAGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  10522 AGTCGGACATGAAGCACTGGCCTTTCCAGGTGATCAACGACGGAGACAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCCAAGGTGCAGGTGAGCTACAAGGGGGACACCAAGGCATTCTACCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
  10572 CCCAAGGTGCAGGTGAGCTACAAGGGGGAGACCAAGGCATTCTACCCCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGAGATCTCGTCCATGGTGCTGACCAAGATGAAGGAGATCGCCGAGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  10622 GGAGATCTCGTCCATGGTGCTGACCAAGATGAAGGAGATCGCCGAGGCGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCTGGGCTACCCGGTGACCAACGCGGTGATCACCGTGCCGGCCTACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  10672 ACCTGGGCTACCCGGTGACCAACGCGGTGATCACCGTGCCGGCCTACTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AACGACTCGCAGCGCCAGGCCACCAAGGATGCGGGTGTGATCGCGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  10722 AACGACTCGCAGCGCCAGGCCACCAAGGATGCGGGTGTGATCGCGGGGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAACGTGCTGCGGATCATCAACGAGCCCACGGCCGCCGCCATCGCCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  10772 CAACGTGCTGCGGATCATCAACGAGCCCACGGCCGCCGCCATCGCCTACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCCTGGACAGAACGGGCAAGGGGGAGCGCAACGTGCTCATCTTTGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  10822 GCCTGGACAGAACGGGCAAGGGGGAGCGCAACGTGCTCATCTTTGACCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGCGGGGGCACCTTCGACGTGTCCATCCTGACGATCGACGACGGCATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  10872 GGCGGGGGCACCTTCGACGTGTCCATCCTGACGATCGACGACGGCATCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGAGGTGAAGGCCACGGCCGGGGACACCCACCTGGGTGGGGAGGACTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  10922 CGAGGTGAAGGCCACGGCCGGGGACACCCACCTGGGTGGGGAGGACTTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACAACAGGCTGGTGAACCACTTCGTGGAGGAGTTCAAGAGAAAACACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  10972 ACAACAGGCTGGTGAACCACTTCGTGGAGGAGTTCAAGAGAAAACACAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAGGACATCAGCCAGAACAAGCGAGCCGTGAGGCGGCTGCGCACCGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11022 AAGGACATCAGCCAGAACAAGCGAGCCGTGAGGCGGCTGCGCACCGCCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CGAGAGGGCCAAGAGGACCCTGTCGTCCAGCACCCAGGCCAGCCTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11072 CGAGAGGGCCAAGAGGACCCTGTCGTCCAGCACCCAGGCCAGCCTGGAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCGACTCCCTGTTTGAGGGCATCGACTTCTACACGTCCATCACCAGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11122 TCGACTCCCTGTTTGAGGGCATCGACTTCTACACGTCCATCACCAGGGCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGGTTCGAGGAGCTGTGCTCCGACCTGTTCCGAAGCACCCTGGAGCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11172 AGGTTCGAGGAGCTGTGCTCCGACCTGTTCCGAAGCACCCTGGAGCCCGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGAGAAGGCTCTGCGCGACGCCAAGCTGGACAAGGCCCAGATTCACGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11222 GGAGAAGGCTCTGCGCGACGCCAAGCTGGACAAGGCCCAGATTCACGACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGGTCCTGGTCGGGGGCTCCACCCGCATCCCCAAGGTGCAGAAGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11272 TGGTCCTGGTCGGGGGCTCCACCCGCATCCCCAAGGTGCAGAAGCTGCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CAGGACTTCTTCAACGGGCGCGACCTGAACAAGAGCATCAACCCCGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11322 CAGGACTTCTTCAACGGGCGCGACCTGAACAAGAGCATCAACCCCGACGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGCTGTGGCCTACGGGGCGGCGGTGCAGGCGGCCATCCTGATGGGGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11372 GGCTGTGGCCTACGGGGCGGCGGTGCAGGCGGCCATCCTGATGGGGGACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGTCCGAGAACGTGCAGGACCTGCTGCTGCTGGACGTGGCTCCCCTGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11422 AGTCCGAGAACGTGCAGGACCTGCTGCTGCTGGACGTGGCTCCCCTGTCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CTGGGGCTGGAGACGGCCGGAGGCGTGATGACTGCCCTGATCAAGCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11472 CTGGGGCTGGAGACGGCCGGAGGCGTGATGACTGCCCTGATCAAGCGCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CTCCACCATCCCCACCAAGCAGACGCAGATCTTCACCACCTACTCCGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11522 CTCCACCATCCCCACCAAGCAGACGCAGATCTTCACCACCTACTCCGACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ACCAACCCGGGGTGCTGATCCAGGTGTACGAGGGCGAGAGGGCCATGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11572 ACCAACCCGGGGTGCTGATCCAGGTGTACGAGGGCGAGAGGGCCATGACG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 AAAGACAACAATCTGTTGGGGCGCTTCGAGCTGAGCGGCATCCCTCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11622 AAAGACAACAATCTGTTGGGGCGCTTCGAGCTGAGCGGCATCCCTCCGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CCCCAGGGGCGTGCCCCAGATCGAGGTGACCTTCGACATCGATGCCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11672 CCCCAGGGGCGTGCCCCAGATCGAGGTGACCTTCGACATCGATGCCAACG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 GCATCCTGAACGTCACGGCCACGGACAAGAGCACCGGCAAGGCCAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11722 GCATCCTGAACGTCACGGCCACGGACAAGAGCACCGGCAAGGCCAACAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 ATCACCATCACCAACGACAAGGGCCGCCTGAGCAAGGAGGAGATCGAGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
  11772 ATCACCATCACCAACGACAAGGGCCGCCTGAGCAAGGAGGAGATCGAGCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CATGGTGCAGGAGGCGGAGAAGTACAAAGCGGAGGACGAGGTGCAGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11822 CATGGTGCAGGAGGCGGAGAAGTACAAAGCGGAGGACGAGGTGCAGCGCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 AGAGGGTGTCAGCCAAGAACGCCCTGGAGTCCTACGCCTTCAACATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11872 AGAGGGTGTCAGCCAAGAACGCCCTGGAGTCCTACGCCTTCAACATGAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 AGCGCCGTGGAGGATGAGGGGCTCAAGGGCAAGATCAGCGAGGCCGACAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
  11922 AGCGCCGTGGAGGATGAGGGGCTCAAGGGCAAGATCAGCGAGGCGGACAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 GAAGAAGGTGCTGGACAAGTGTCAAGAGGTCATCTCGTGGCTGGACGCCA
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11972 GAAGAAGGTTCTGGACAAGTGTCAAGAGGTCATCTCGTGGCTGGACGCCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 ACACCTTGGCCGAGAAGGACGAGTTTGAGCACAAGAGGAAGGAGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  12022 ACACCTTGGCCGAGAAGGACGAGTTTGAGCACAAGAGGAAGGAGCTGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 CAGGTGTGTAACCCCATCATCAGCGGACTGTACCAGGGTGCCGGTGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  12072 CAGGTGTGTAACCCCATCATCAGCGGACTGTACCAGGGTGCCGGTGGTCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 CGGGCCTGGGGGCTTCGGGGCTCAGGGTCCCAAGGGAGGGTCTGGGTCAG
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  12122 CGGGCCTGGCGGCTTCGGGGCTCAGGGTCCCAAGGGAGGGTCTGGGTCAG

   1900     .    :    .    :
   1901 GCCCCACCATTGAGGAGGTAGAT
        |||| |||||||||||||| |||
  12172 GCCCTACCATTGAGGAGGTGGAT