seq1 = pF1KB9772.tfa, 1647 bp
seq2 = pF1KB9772/gi568815579r_9313278.tfa (gi568815579r:9313278_9517910), 204633 bp

>pF1KB9772 1647
>gi568815579r:9313278_9517910 (Chr19)

(complement)

1-34  (99373-99406)   100% ->
35-115  (100003-100083)   100% ->
116-204  (102169-102257)   100% ->
205-1647  (103191-104633)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGAGAACTACAAGAATTTGGCCACAGTAG         GATATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
  99373 ATGCTGGAGAACTACAAGAATTTGGCCACAGTAGGTA...CAGGATATCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GCTCTTCAAACCCAGTCTGATCTCTTGGCTGGAACAAGAAGAGTCTAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100010 GCTCTTCAAACCCAGTCTGATCTCTTGGCTGGAACAAGAAGAGTCTAGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAGTGCAGAGAGGTGATTTCCAAG         CTTCAGAATGGAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100060 CAGTGCAGAGAGGTGATTTCCAAGGTG...CAGCTTCAGAATGGAAAGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CAACTTAAAACCAAAGAGTTAGCCCTTCAGCAGGATGTTTTGGGGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102186 CAACTTAAAACCAAAGAGTTAGCCCTTCAGCAGGATGTTTTGGGGGAGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AACCTCCAGTGGGATTCAAATG         ATAGGAAGCCACAACGGAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 102236 AACCTCCAGTGGGATTCAAATGGTA...CAGATAGGAAGCCACAACGGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GGGAGGTCAGTGATGTTAAGCAATGTGGAGATGTCTCCAGTGAACACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103210 GGGAGGTCAGTGATGTTAAGCAATGTGGAGATGTCTCCAGTGAACACTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TGCCTTAAGACACATGTGAGAACTCAAAATAGTGAGAACACATTTGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103260 TGCCTTAAGACACATGTGAGAACTCAAAATAGTGAGAACACATTTGAGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTATCTGTATGGAGTAGACTTCCTTACTCTGCACAAGAAAACCTCTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103310 TTATCTGTATGGAGTAGACTTCCTTACTCTGCACAAGAAAACCTCTACTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GAGAGCAACGTTCTGTATTTAGTCAGTGTGGAAAAGCCTTCAGCCTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103360 GAGAGCAACGTTCTGTATTTAGTCAGTGTGGAAAAGCCTTCAGCCTGAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCAGATGTTGTTTGCCAGAGAACGTGCACAGGAGAGAAAGCTTTTGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103410 CCAGATGTTGTTTGCCAGAGAACGTGCACAGGAGAGAAAGCTTTTGATTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAGTGACTCTGGGAAATCCTTCATTAATCATTCACACCTTCAGGGACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103460 CAGTGACTCTGGGAAATCCTTCATTAATCATTCACACCTTCAGGGACATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TAAGAACTCACAATGGAGAAAGTCTCCATGAATGGAAGGAATGTGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103510 TAAGAACTCACAATGGAGAAAGTCTCCATGAATGGAAGGAATGTGGGAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGCTTTATTCACTCCACAGACCTTGCTGTGCGTATACAAACTCACAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103560 GGCTTTATTCACTCCACAGACCTTGCTGTGCGTATACAAACTCACAGGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AGAAAAACCCTACAAATGTAAGGAATGTGGAAAAGGATTTAGATATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103610 AGAAAAACCCTACAAATGTAAGGAATGTGGAAAAGGATTTAGATATTCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CATACCTTAATATTCACATGGGAACCCACACTGGAGACAATCCCTATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103660 CATACCTTAATATTCACATGGGAACCCACACTGGAGACAATCCCTATGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TGTAAGGAGTGTGGGAAAGCCTTCACCAGGTCTTGTCAACTTACTCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103710 TGTAAGGAGTGTGGGAAAGCCTTCACCAGGTCTTGTCAACTTACTCAGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CAGAAAAACTCACACTGGAGAGAAACCTTATAAATGTAAGGATTGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103760 CAGAAAAACTCACACTGGAGAGAAACCTTATAAATGTAAGGATTGTGGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GAGCCTTCACTGTTTCCTCTTGCTTAAGTCAACATATGAAAATCCATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103810 GAGCCTTCACTGTTTCCTCTTGCTTAAGTCAACATATGAAAATCCATGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GGTGAGAAGCCTTATGAATGCAAGGAATGTGGGATAGCCTTCACTAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103860 GGTGAGAAGCCTTATGAATGCAAGGAATGTGGGATAGCCTTCACTAGATC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TTCTCAACTTACTGAACATTTAAAAACTCACACTGCAAAGGATCCCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103910 TTCTCAACTTACTGAACATTTAAAAACTCACACTGCAAAGGATCCCTTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 AATGTAAGATATGTGGAAAATCCTTTAGAAATTCCTCATGCCTCAGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103960 AATGTAAGATATGTGGAAAATCCTTTAGAAATTCCTCATGCCTCAGTGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 CACTTTCGAATTCACACTGGAATAAAACCCTATAAATGTAAGGATTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104010 CACTTTCGAATTCACACTGGAATAAAACCCTATAAATGTAAGGATTGTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GAAAGCCTTCACTCAGAACTCAGACCTTACTAAGCATGCACGAACTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104060 GAAAGCCTTCACTCAGAACTCAGACCTTACTAAGCATGCACGAACTCACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 GTGGAGAGAGGCCCTATGAATGTAAGGAATGTGGAAAGGCCTTTGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104110 GTGGAGAGAGGCCCTATGAATGTAAGGAATGTGGAAAGGCCTTTGCCAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 TCCTCTCGCCTTAGTGAACATACAAGAACTCACACTGGAGAGAAGCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104160 TCCTCTCGCCTTAGTGAACATACAAGAACTCACACTGGAGAGAAGCCTTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 TGAATGTGTCAAATGTGGGAAAGCCTTTGCTATTTCTTCAAATCTTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104210 TGAATGTGTCAAATGTGGGAAAGCCTTTGCTATTTCTTCAAATCTTAGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 GACATTTGAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCCTTTGAGTGCCTGGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104260 GACATTTGAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCCTTTGAGTGCCTGGAATGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 GGTAAAGCATTTACGCATTCCTCCAGTCTTAATAATCACATGCGGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104310 GGTAAAGCATTTACGCATTCCTCCAGTCTTAATAATCACATGCGGACCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 CAGCGCCAAAAAACCATTCACGTGTATGGAATGTGGCAAAGCCTTTAAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 104360 CAGCGCCAAAAAACCATTCACGTGTATGGAATGTGGCAAAGCTTTTAAGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 TTCCCACGTGTGTTAACCTTCACATGCGGATCCACACTGGAGAAAAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104410 TTCCCACGTGTGTTAACCTTCACATGCGGATCCACACTGGAGAAAAACCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 TACAAATGTAAACAGTGTGGGAAATCCTTCAGTTACTCCAATTCGTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104460 TACAAATGTAAACAGTGTGGGAAATCCTTCAGTTACTCCAATTCGTTTCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 GTTACATGAACGAACTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTAAGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104510 GTTACATGAACGAACTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTAAGGAGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 GCGGGAAAGCCTTCAGTTCTTCCAGTTCCTTTCGAAATCATGAAAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104560 GCGGGAAAGCCTTCAGTTCTTCCAGTTCCTTTCGAAATCATGAAAGAAGG

   1650     .    :    .    :
   1624 CATGCGGATGAGAGACTGTCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||
 104610 CATGCGGATGAGAGACTGTCAGCA