Result of SIM4 for
pF1KB9768
seq1 = pF1KB9768.tfa, 3018 bp
seq2 = pF1KB9768/gi568815582f_88353639.tfa (gi568815582f:88353639_88634976), 281338 bp
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0 . : . : . : . : . :
1 ATGTCCAGGCGGAAACAGAGCAACCCCCGGCAGATCAAGC G
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100001 ATGTCCAGGCGGAAACAGAGCAACCCCCGGCAGATCAAGCGTG...CAGG
50 . : . : . : . : . :
42 TTCCCTCGGAGACATGGAGGCCAGAGAGGAGGTGCAGTTGGTGGGTGCCA
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132302 TTCCCTCGGAGACATGGAGGCCAGAGAGGAGGTGCAGTTGGTGGGTGCCA
100 . : . : . : . : . :
92 GCCACATGGAGCAAAAGGCCACGGCACCTGAAGCCCCGAGCCCTCCCAGC
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132352 GCCACATGGAGCAAAAGGCCACGGCACCTGAAGCCCCGAGCCCTCCCAGC
150 . : . : . : . : . :
142 GCAG ATGTTAACTCACCCCCACCGCTGCCGCCCCCCACATC
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132402 GCAGGTG...CAGATGTTAACTCACCCCCACCGCTGCCGCCCCCCACATC
200 . : . : . : . : . :
183 CCCAGGAGGCCCCAAGGAGCTGGAAGGACAGGAACCAGAACCCAGGCCCA
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135430 CCCAGGAGGCCCCAAGGAGCTGGAAGGACAGGAACCAGAACCCAGGCCCA
250 . : . : . : . : . :
233 CGGAGGAAGAGCCGGGCAGTCCCTGGAGCGGGCCAG ACGAG
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135480 CGGAGGAAGAGCCGGGCAGTCCCTGGAGCGGGCCAGGTA...CAGACGAG
300 . : . : . : . : . :
274 CTGGAGCCGGTGGTGCAGGATGGGCAGAGGCGCATACGGGCCCGACTCAG
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160754 CTGGAGCCGGTGGTGCAGGATGGGCAGAGGCGCATACGGGCCCGACTCAG
350 . : . : . : . : . :
324 CCTCGCCACGGGCCTGTCCTGGGGCCCGTTCCATGGGAGTGTCCAGACCA
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160804 CCTCGCCACGGGCCTGTCCTGGGGCCCGTTCCATGGGAGTGTCCAGACCA
400 . : . : . : . : . :
374 GAGCCTCATCCCCCAGGCAGGCGGAGCCG AGCCCAGCCCTG
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160854 GAGCCTCATCCCCCAGGCAGGCGGAGCCGGTA...CAGAGCCCAGCCCTG
450 . : . : . : . : . :
415 ACCCTGCTGCTGGTGGACGAGGCCTGCTGGCTGAGGACGCTGCCCCAGGC
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173188 ACCCTGCTGCTGGTGGACGAGGCCTGCTGGCTGAGGACGCTGCCCCAGGC
500 . : . : . : . : . :
465 CCTGACTGAGGCCGAGGCCAACACAGAGATCCACAGGAAGG
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173238 CCTGACTGAGGCCGAGGCCAACACAGAGATCCACAGGAAGGGTC...CAG
550 . : . : . : . : . :
506 ATGACGCACTCTGGTGCAGGGTCACCAAGCCGGTGCCTGCGGGGGGACTC
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174394 ATGACGCACTCTGGTGCAGGGTCACCAAGCCGGTGCCTGCGGGGGGACTC
600 . : . : . : . : . :
556 CTGAGCGTGCTCCTCACGGCCGAGCCCCACAGCACCCCCGGCCACCCTGT
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174444 CTGAGCGTGCTCCTCACGGCCGAGCCCCACAGCACCCCCGGCCACCCTGT
650 . : . : . : . : . :
606 GAAGAAGGAGCCAGCAGAGCCCACGTGCCCGGCCCCTGCACACGACCTCC
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174494 GAAGAAGGAGCCAGCAGAGCCCACGTGCCCGGCCCCTGCACACGACCTCC
700 . : . : . : . : . :
656 AGCTCCTGCCCCAGCAGGCCGGGATGGCCTCCATCCTTGCCACCGCAGTG
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174544 AGCTCCTGCCCCAGCAGGCCGGGATGGCCTCCATCCTTGCCACCGCAGTG
750 . : . : . : . : . :
706 ATCAACA AAGACGTCTTCCCCTGCAAGGACTGTGGCATCTG
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174594 ATCAACAGTA...CAGAAGACGTCTTCCCCTGCAAGGACTGTGGCATCTG
800 . : . : . : . : . :
747 GTACCGCAGCGAGCGCAACCTGCAGGCGCACCTGCTCTACTACTGCGCCA
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178398 GTACCGCAGCGAGCGCAACCTGCAGGCGCACCTGCTCTACTACTGCGCCA
850 . : . : . : . : . :
797 GCCGCCAGGGCACCGGCTCCCCGGCCGCAGCCGCCACAGACGAGAAGCCC
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178448 GCCGCCAGGGCACCGGCTCCCCGGCCGCAGCCGCCACAGACGAGAAGCCC
900 . : . : . : . : . :
847 AAAGAGACCTACCCCAACGAGCGCGTCTGCCCCTTCCCCCAGTGCCGCAA
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178498 AAAGAGACCTACCCCAACGAGCGCGTCTGCCCCTTCCCCCAGTGCCGCAA
950 . : . : . : . : . :
897 GAGCTGCCCCAGCGCCAGCTCCCTGGAGATCCACATGCGCAGCCACAGCG
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178548 GAGCTGCCCCAGCGCCAGCTCCCTGGAGATCCACATGCGCAGCCACAGCG
1000 . : . : . : . : . :
947 GAGAGCGGCCCTTCGTGTGCCTGATCTGCCTGTCGGCCTTC
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
178598 GTG...CAGGAGAGCGGCCCTTCGTGTGCCTGATCTGCCTGTCGGCCTTC
1050 . : . : . : . : . :
988 ACCACCAAGGCCAACTGCGAGCGGCACCTCAAGGTGCACACGGACACGCT
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179017 ACCACCAAGGCCAACTGCGAGCGGCACCTCAAGGTGCACACGGACACGCT
1100 . : . : . : . : . :
1038 GAGCG GTGTCTGCCACAGCTGTGGCTTCATCTCCACCACAA
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179067 GAGCGGTA...CAGGTGTCTGCCACAGCTGTGGCTTCATCTCCACCACAA
1150 . : . : . : . : . :
1079 GGGACATCCTCTACAGCCACTTGGTCACCAACCACATGGTCTGCCAGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
179187 GGGACATCCTCTACAGCCACTTGGTCACCAACCACATGGTCTGCCAGCCT
1200 . : . : . : . : . :
1129 GGCTCCAAGGGTGAGATCTACTCGCCAGGGGCCGGACACCCAGCAACCAA
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179237 GGCTCCAAGGGTGAGATCTACTCGCCAGGGGCCGGACACCCAGCAACCAA
1250 . : . : . : . : . :
1179 GCTGCCCCCAG ACAGTCTGGGCAGCTTCCAGCAGCAGCACA
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179287 GCTGCCCCCAGGTG...CAGACAGTCTGGGCAGCTTCCAGCAGCAGCACA
1300 . : . : . : . : . :
1220 CGGCCCTGCAAGGCCCCCTGGCCTCCGCGGACCTGGGCCTGGCGCCCACC
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179540 CGGCCCTGCAAGGCCCCCTGGCCTCCGCGGACCTGGGCCTGGCGCCCACC
1350 . : . : . : . : . :
1270 CCATCGCCAGGACTGGACAGAAAGGCCCTGGCCGAGGCCACCAACGGAGA
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179590 CCATCGCCAGGACTGGACAGAAAGGCCCTGGCCGAGGCCACCAACGGAGA
1400 . : . : . : . : . :
1320 GGCCAGAGCGGAGCCTCTGGCCCAGAATGGAGGCAGCAGCGAGCCCCCGG
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179640 GGCCAGAGCGGAGCCTCTGGCCCAGAATGGAGGCAGCAGCGAGCCCCCGG
1450 . : . : . : . : . :
1370 CGGCCCCCAGGAGCATCAAGGTGGAGGCGGTGGAGGAGCCGGAGGCGGCC
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179690 CGGCCCCCAGGAGCATCAAGGTGGAGGCGGTGGAGGAGCCGGAGGCGGCC
1500 . : . : . : . : . :
1420 CCCATCCTGGGCCCCGGAGAGCCTGGGCCCCAGGCCCCGTCGCGGACGCC
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179740 CCCATCCTGGGCCCCGGAGAGCCTGGGCCCCAGGCCCCGTCGCGGACGCC
1550 . : . : . : . : . :
1470 GTCGCCGCGCAGCCCCGCCCCGGCCAGGGTCAAGGCCGAGCTGTCCAGCC
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179790 GTCGCCGCGCAGCCCCGCCCCGGCCAGGGTCAAGGCCGAGCTGTCCAGCC
1600 . : . : . : . : . :
1520 CCACGCCGGGCTCCAGCCCGGTGCCCGGCGAGCTGGGCCTGGCCGGGGCC
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179840 CCACGCCGGGCTCCAGCCCGGTGCCCGGCGAGCTGGGCCTGGCCGGGGCC
1650 . : . : . : . : . :
1570 CTGTTCCTTCCGCAGTACGTGTTCGGGCCCGACGCGGCGCCCCCCGCCTC
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179890 CTGTTCCTTCCGCAGTACGTGTTCGGGCCCGACGCGGCGCCCCCCGCCTC
1700 . : . : . : . : . :
1620 GGAGATCCTGGCCAAGATGTCCGAGCTGGTGCACAGCCGGCTGCAGCAGG
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179940 GGAGATCCTGGCCAAGATGTCCGAGCTGGTGCACAGCCGGCTGCAGCAGG
1750 . : . : . : . : . :
1670 GCGCGGGCGCGGGCGCCGGCGGCGCGCAGACCGGGCTCTTCCCGGGGGCC
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179990 GCGCGGGCGCGGGCGCCGGCGGCGCGCAGACCGGGCTCTTCCCCGGGGCC
1800 . : . : . : . : . :
1720 CCCAAGGGCGCTACGTGCTTCGAGTGCGAGATCACCTTCAGCAACGTCAA
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180040 CCCAAGGGCGCTACGTGCTTCGAGTGCGAGATCACCTTCAGCAACGTCAA
1850 . : . : . : . : . :
1770 CAACTACTACGTGCACAAGCGCCTCTACTGTTCAGGCCGCCGTGCGCCCG
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180090 CAACTACTACGTGCACAAGCGCCTCTACTGTTCAGGCCGCCGTGCGCCCG
1900 . : . : . : . : . :
1820 AGGACGCGCCTGCCGCGCGCAGGCCCAAGGCGCCCCCCGGCCCGGCCCGC
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180140 AGGACGCGCCTGCCGCGCGCAGGCCCAAGGCGCCCCCCGGCCCGGCCCGC
1950 . : . : . : . : . :
1870 GCGCCCCCCGGCCAGCCCGCCGAACCCGACGCGCCGCGCTCGTCCCCGGG
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180190 GCGCCCCCCGGCCAGCCCGCCGAACCCGACGCGCCGCGCTCGTCCCCGGG
2000 . : . : . : . : . :
1920 CCCCGGAGCGCGCGAGGAGGGGGCTGGGGGCGCGGCCACGCCCGAGGACG
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180240 CCCCGGAGCGCGCGAGGAGGGGGCTGGGGGCGCGGCCACGCCCGAGGACG
2050 . : . : . : . : . :
1970 GCGCGGGCGGCCGGGGCAGCGAGGGCAGCCAGAGCCCGGGTAGCTCCGTG
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180290 GCGCGGGCGGCCGGGGCAGCGAGGGCAGCCAGAGCCCGGGTAGCTCCGTG
2100 . : . : . : . : . :
2020 GACGACGCGGAGGACGACCCCAGCCGCACGCTGTGCGAGGCCTGCAACAT
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180340 GACGACGCGGAGGACGACCCCAGCCGCACGCTGTGCGAGGCCTGCAACAT
2150 . : . : . : . : . :
2070 CCGCTTCAGCCGCCACGAGACCTACACCGTGCACAAGCGGTACTACTGCG
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180390 CCGCTTCAGCCGCCACGAGACCTACACCGTGCACAAGCGGTACTACTGCG
2200 . : . : . : . : . :
2120 CCTCGCGCCACGACCCGCCGCCGCGCCGACCGGCCGCGCCCCCGGGACCC
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180440 CCTCGCGCCACGACCCGCCGCCGCGCCGACCGGCCGCGCCCCCGGGACCC
2250 . : . : . : . : . :
2170 CCTGGGCCGGCCGCGCCCCCGGCCCCCTCTCCCGCCGCGCCTGTGCGCAC
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180490 CCTGGGCCGGCCGCGCCCCCGGCCCCCTCTCCCGCCGCGCCTGTGCGCAC
2300 . : . : . : . : . :
2220 GCGCAGACGCCGCAAGCTCTACGAGCTGCACGCGGCCGGCGCCCCGCCCC
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180540 GCGCAGACGCCGCAAGCTCTACGAGCTGCACGCGGCCGGCGCCCCGCCCC
2350 . : . : . : . : . :
2270 CCCCGCCGCCCGGCCACGCCCCCGCGCCCGAGTCGCCGCGGCCCGGAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
180590 CCCCGCCGCCCGGCCACGCCCCCGCGCCCGAGTCGCCGCGGCCCGGAAGC
2400 . : . : . : . : . :
2320 GGAAGCGGAAGCGGCCCCGGCCTCGCCCCTGCGCGCTCGCCCGGCCCCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
180640 GGAAGCGGAAGCGGCCCCGGCCTCGCCCCTGCGCGCTCGCCCGGCCCCGC
2450 . : . : . : . : . :
2370 GGCCGACGGCCCCATCGACCTGAGCAAGAAGCCGCGGCGCCCGCTCCCCG
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180690 GGCCGACGGCCCCATCGACCTGAGCAAGAAGCCGCGGCGCCCGCTCCCCG
2500 . : . : . : . : . :
2420 GAGCCCCGGCACCGGCGCTGGCCGACTACCACGAGTGCACGGCCTGCCGC
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180740 GAGCCCCGGCACCGGCGCTGGCCGACTACCACGAGTGCACGGCCTGCCGC
2550 . : . : . : . : . :
2470 GTGAGCTTCCACAGCCTCGAGGCCTACCTGGCGCACAAGAAGTACTCGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
180790 GTGAGCTTCCACAGCCTCGAGGCCTACCTGGCGCACAAGAAGTACTCGTG
2600 . : . : . : . : . :
2520 CCCCGCTGCGCCACCGCCCGGCGCGCTCGGCCTGCCCGCCGCCGCCTGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
180840 CCCCGCTGCGCCACCGCCCGGCGCGCTCGGCCTGCCCGCCGCCGCCTGCC
2650 . : . : . : . : . :
2570 CCTACTGCCCCCCGAACGGCCCGGTGCGCGGGGACCTGCTGGAGCATTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
180890 CCTACTGCCCCCCGAACGGCCCGGTGCGCGGGGACCTGCTGGAGCATTTC
2700 . : . : . : . : . :
2620 CGCCTGGCGCACGGCCTGCTGCTCGGCGCGCCCCTGGCCGGCCCGGGGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
180940 CGCCTGGCGCACGGCCTGCTGCTCGGCGCGCCCCTGGCCGGCCCGGGGGT
2750 . : . : . : . : . :
2670 CGAGGCCCGGACGCCGGCCGACCGCGGCCCCTCGCCCGCTCCCGCCCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
180990 CGAGGCCCGGACGCCGGCCGACCGCGGCCCCTCGCCCGCTCCCGCCCCCG
2800 . : . : . : . : . :
2720 CCGCCTCCCCGCAGCCCGGGTCCCGTGGCCCCCGGGACGGCCTCGGCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181040 CCGCCTCCCCGCAGCCCGGGTCCCGTGGCCCCCGGGACGGCCTCGGCCCG
2850 . : . : . : . : . :
2770 GAGCCCCAGGAGCCGCCGCCCGGCCCGCCCCCGTCCCCGGCCGCCGCGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181090 GAGCCCCAGGAGCCGCCGCCCGGCCCGCCCCCGTCCCCGGCCGCCGCGCC
2900 . : . : . : . : . :
2820 CGAGGCCGTGCCGCCCCCGCCGGCGCCCCCCTCCTACTCGGACAAGGGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181140 CGAGGCCGTGCCGCCCCCGCCGGCGCCCCCCTCCTACTCGGACAAGGGCG
2950 . : . : . : . : . :
2870 TCCAGACTCCCAGCAAGGGCACGCCGGCGCCGCTGCCCAACGGCAACCAC
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181190 TCCAGACTCCCAGCAAGGGCACGCCGGCGCCGCTGCCCAACGGCAACCAC
3000 . : . : . : . : . :
2920 CGGTACTGCCGTCTTTGCAACATCAAGTTCAGCAGCCTGTCCACCTTCAT
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181240 CGGTACTGCCGTCTTTGCAACATCAAGTTCAGCAGCCTGTCCACCTTCAT
3050 . : . : . : . : .
2970 CGCCCACAAGAAGTATTACTGCTCCTCGCACGCCGCCGAGCACGTGAAG
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181290 CGCCCACAAGAAGTATTACTGCTCCTCGCACGCCGCCGAGCACGTGAAG