seq1 = pF1KB9762.tfa, 2400 bp
seq2 = pF1KB9762/gi568815588f_103267990.tfa (gi568815588f:103267990_103488220), 220231 bp

>pF1KB9762 2400
>gi568815588f:103267990_103488220 (Chr10)

1-559  (100001-100559)   100% ->
560-797  (105369-105606)   99% ->
798-1113  (110246-110561)   100% ->
1114-1277  (111619-111782)   100% ->
1278-1413  (111895-112030)   100% ->
1414-1534  (113732-113852)   100% ->
1535-1664  (115249-115378)   100% ->
1665-1829  (117337-117501)   100% ->
1830-2007  (119186-119363)   100% ->
2008-2185  (119532-119709)   100% ->
2186-2400  (120017-120231)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGCTGGCGGAGGAGCAGACGGAGGTGGCGGTCAAGCTAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGCTGGCGGAGGAGCAGACGGAGGTGGCGGTCAAGCTAGAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGAGGGACCGCCAACGCTGCTACCTCCGCAGGCGGGGGACGGCGCAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGAGGGACCGCCAACGCTGCTACCTCCGCAGGCGGGGGACGGCGCAGGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGGTAGCGGCGGCACTACCAACAACGGCCCCAACGGCGGCGGCGGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGGTAGCGGCGGCACTACCAACAACGGCCCCAACGGCGGCGGCGGGAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTTGCGGCGTCGTCGTCCACTGGCGGGGATGGCGGGACCCCCAAGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTTGCGGCGTCGTCGTCCACTGGCGGGGATGGCGGGACCCCCAAGCCCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGTGGCTGTCTCCGCCGCTGCCCCGGCGGGGGCGGCCCCGGTGCCCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGTGGCTGTCTCCGCCGCTGCCCCGGCGGGGGCGGCCCCGGTGCCCGCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGCTCCGGACGCCGGCGCTCCGCATGACCGACAGACTCTACTGGCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTGCTCCGGACGCCGGCGCTCCGCATGACCGACAGACTCTACTGGCCGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCAGTTCCTACGGCAGAGCAAACTCCGCGAGGCCGAAGAGGCGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCAGTTCCTACGGCAGAGCAAACTCCGCGAGGCCGAAGAGGCGCTGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCGTGAGGCCGGGCTGCTGGAGGAGGCAGTGGCGGGCTCCGGAGCCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCGTGAGGCCGGGCTGCTGGAGGAGGCAGTGGCGGGCTCCGGAGCCCCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GAGAGGTGGACAGCGCCGGCGCTGAGGTGACCAGCGCGCTTCTCAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GAGAGGTGGACAGCGCCGGCGCTGAGGTGACCAGCGCGCTTCTCAGCCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGACCGCCTCGGCCCCTGGCCCTGCGGCCCCCGACCCTCCGGGCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGACCGCCTCGGCCCCTGGCCCTGCGGCCCCCGACCCTCCGGGCACTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGCTTCGGGGGCCACGGTCGTCTCAGGTTCAGCCTCAGGTCCTGCGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGCTTCGGGGGCCACGGTCGTCTCAGGTTCAGCCTCAGGTCCTGCGGCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CGGGTAAAG         TTGGAAGCGTTGCTGTGGAAGACCAGCCAGAT
        |||||||||>>>...>>>||||||| ||||||||||||||||||||||||
 100551 CGGGTAAAGGTG...TAGTTGGAAGTGTTGCTGTGGAAGACCAGCCAGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GTCAGTGCCGTGTTGTCAGCCTACAACCAACAAGGAGATCCCACAATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105401 GTCAGTGCCGTGTTGTCAGCCTACAACCAACAAGGAGATCCCACAATGTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGAAGAATACTATAGTGGACTGAAACACTTCATTGAATGTTCCCTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105451 TGAAGAATACTATAGTGGACTGAAACACTTCATTGAATGTTCCCTGGACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GCCATCGGGCAGAGTTGTCCCAACTTTTTTATCCTCTGTTTGTGCACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105501 GCCATCGGGCAGAGTTGTCCCAACTTTTTTATCCTCTGTTTGTGCACATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TACTTGGAGCTAGTCTACAATCAACATGAGAATGAAGCAAAGTCATTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105551 TACTTGGAGCTAGTCTACAATCAACATGAGAATGAAGCAAAGTCATTCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TGAGAA         GTTCCATGGAGATCAGGAATGTTATTACCAGGATG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105601 TGAGAAGTA...CAGGTTCCATGGAGATCAGGAATGTTATTACCAGGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 ACCTACGAGTATTATCTAGTCTTACCAAAAAGGAACACATGAAAGGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110281 ACCTACGAGTATTATCTAGTCTTACCAAAAAGGAACACATGAAAGGGAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GAGACCATGTTGGATTTTCGAACAAGTAAATTTGTTCTGCGTATTTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110331 GAGACCATGTTGGATTTTCGAACAAGTAAATTTGTTCTGCGTATTTCCCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TGACTCGTACCAACTCTTGAAGAGGCATCTTCAGGAGAAACAGAACAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110381 TGACTCGTACCAACTCTTGAAGAGGCATCTTCAGGAGAAACAGAACAATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 AGATATGGAACATAGTTCAGGAGCACCTCTACATTGACATCTTTGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110431 AGATATGGAACATAGTTCAGGAGCACCTCTACATTGACATCTTTGATGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 ATGCCGCGTAGTAAGCAACAGATAGATGCGATGGTGGGAAGTTTGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110481 ATGCCGCGTAGTAAGCAACAGATAGATGCGATGGTGGGAAGTTTGGCAGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 AGAGGCTAAACGAGAGGCAAACAAATCAAAG         GTATTTTTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 110531 AGAGGCTAAACGAGAGGCAAACAAATCAAAGGTA...TAGGTATTTTTTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 GTTTATTAAAAGAACCAGAAATTGAGGTACCTTTGGATGACGAGGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111629 GTTTATTAAAAGAACCAGAAATTGAGGTACCTTTGGATGACGAGGATGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GAGGGAGAAAATGAAGAAGGAAAACCTAAAAAGAAGAAGCCTAAAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111679 GAGGGAGAAAATGAAGAAGGAAAACCTAAAAAGAAGAAGCCTAAAAAAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 TAGTATTGGATCCAAAAGCAAAAAACAAGATCCCAATGCTCCACCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111729 TAGTATTGGATCCAAAAGCAAAAAACAAGATCCCAATGCTCCACCTCAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 ACAG         AATCCCTCTTCCTGAGTTGAAAGATTCAGATAAGTTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111779 ACAGGTG...CAGAATCCCTCTTCCTGAGTTGAAAGATTCAGATAAGTTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 GATAAGATAATGAATATGAAAGAAACCACCAAACGAGTGCGCCTTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111932 GATAAGATAATGAATATGAAAGAAACCACCAAACGAGTGCGCCTTGGGCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 GGACTGCTTACCCTCCATTTGTTTCTATACATTTCTCAATGCTTACCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 111982 GGACTGCTTACCCTCCATTTGTTTCTATACATTTCTCAATGCTTACCAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1414         GGTCTCACTGCAGTGGATGTCACTGATGATTCTAGTCTGATT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112032 TT...CAGGGTCTCACTGCAGTGGATGTCACTGATGATTCTAGTCTGATT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 GCTGGAGGTTTTGCAGATTCAACTGTCAGAGTGTGGTCGGTAACACCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113774 GCTGGAGGTTTTGCAGATTCAACTGTCAGAGTGTGGTCGGTAACACCCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 AAAGCTTCGTAGTGTCAAACAAGCATCAG         ATCTTAGTCTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 113824 AAAGCTTCGTAGTGTCAAACAAGCATCAGGTA...TAGATCTTAGTCTTA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 TAGACAAAGAATCAGATGATGTCTTAGAAAGAATCATGGATGAGAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115261 TAGACAAAGAATCAGATGATGTCTTAGAAAGAATCATGGATGAGAAAACA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 GCAAGTGAGTTGAAGATTTTGTATGGTCACAGTGGGCCTGTCTACGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115311 GCAAGTGAGTTGAAGATTTTGTATGGTCACAGTGGGCCTGTCTACGGAGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 CAGCTTCAGTCCGGATAG         GAACTATCTGCTTTCCTCTTCAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 115361 CAGCTTCAGTCCGGATAGGTA...CAGGAACTATCTGCTTTCCTCTTCAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 AGGACGGAACTGTTAGATTGTGGAGCCTTCAAACATTTACTTGTTTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117360 AGGACGGAACTGTTAGATTGTGGAGCCTTCAAACATTTACTTGTTTGGTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 GGATATAAAGGACACAACTATCCAGTATGGGACACACAATTTTCTCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117410 GGATATAAAGGACACAACTATCCAGTATGGGACACACAATTTTCTCCATA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 TGGATATTATTTTGTGTCAGGGGGCCATGACCGAGTAGCTCG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 117460 TGGATATTATTTTGTGTCAGGGGGCCATGACCGAGTAGCTCGGTA...AA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1830  GCTCTGGGCTACAGACCACTATCAGCCTTTAAGAATATTTGCCGGCCAT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119185 GGCTCTGGGCTACAGACCACTATCAGCCTTTAAGAATATTTGCCGGCCAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 CTTGCTGATGTGAATTGTACCAGATTCCATCCAAATTCTAATTATGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119235 CTTGCTGATGTGAATTGTACCAGATTCCATCCAAATTCTAATTATGTTGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 TACGGGCTCTGCAGACAGAACTGTGCGGCTCTGGGACGTCCTGAATGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119285 TACGGGCTCTGCAGACAGAACTGTGCGGCTCTGGGACGTCCTGAATGGTA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 ACTGTGTAAGGATCTTCACTGGACACAAG         GGACCAATTCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 119335 ACTGTGTAAGGATCTTCACTGGACACAAGGTA...TAGGGACCAATTCAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 TCCTTGACATTTTCTCCCAATGGGAGATTCCTGGCTACAGGAGCAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119544 TCCTTGACATTTTCTCCCAATGGGAGATTCCTGGCTACAGGAGCAACAGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2070 TGGCAGAGTGCTTCTTTGGGATATTGGACATGGTTTGATGGTTGGAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119594 TGGCAGAGTGCTTCTTTGGGATATTGGACATGGTTTGATGGTTGGAGAAT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2120 TAAAAGGCCACACTGATACAGTCTGTTCACTTAGGTTTAGTAGAGATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119644 TAAAAGGCCACACTGATACAGTCTGTTCACTTAGGTTTAGTAGAGATGGT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2170 GAAATTTTGGCATCAG         GTTCAATGGATAATACAGTTCGATT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 119694 GAAATTTTGGCATCAGGTA...TAGGTTCAATGGATAATACAGTTCGATT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2211 ATGGGATGCTATCAAAGCCTTTGAAGATTTAGAGACCGATGACTTTACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120042 ATGGGATGCTATCAAAGCCTTTGAAGATTTAGAGACCGATGACTTTACTA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2261 CAGCCACTGGGCATATAAATTTACCTGAGAATTCACAGGAGTTATTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120092 CAGCCACTGGGCATATAAATTTACCTGAGAATTCACAGGAGTTATTGTTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2311 GGAACATATATGACCAAATCAACACCAGTTGTACACCTTCATTTTACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120142 GGAACATATATGACCAAATCAACACCAGTTGTACACCTTCATTTTACTCG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :
   2361 AAGAAACCTGGTTCTAGCTGCAGGAGCTTATAGTCCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120192 AAGAAACCTGGTTCTAGCTGCAGGAGCTTATAGTCCACAA