seq1 = pF1KB9761.tfa, 2298 bp
seq2 = pF1KB9761/gi568815592r_100290364.tfa (gi568815592r:100290364_100563468), 273105 bp

>pF1KB9761 2298
>gi568815592r:100290364_100563468 (Chr6)

(complement)

1-175  (100001-100175)   100% ->
176-258  (109625-109707)   100% ->
259-348  (113113-113202)   100% ->
349-457  (113770-113878)   100% ->
458-543  (114021-114106)   100% ->
544-743  (114791-114990)   100% ->
744-850  (115217-115323)   100% ->
851-998  (116054-116201)   100% ->
999-1167  (142511-142679)   100% ->
1168-1570  (169580-169982)   100% ->
1571-2298  (172378-173105)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAGAAAAGTCCAAAAATGCTGCGCGGACTAGGAGGGAGAAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAAGAAAAGTCCAAAAATGCTGCGCGGACTAGGAGGGAGAAGGAAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGTGAATTTTATGAACTGGCTAAATTACTGCCTTTGCCCTCGGCTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGTGAATTTTATGAACTGGCTAAATTACTGCCTTTGCCCTCGGCTATCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTCGCAGCTGGACAAAGCATCCATAATCAGACTCACGACCAGCTATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTCGCAGCTGGACAAAGCATCCATAATCAGACTCACGACCAGCTATCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAAATGAGAGTGGTGTTCCCAGAAG         GGCTCGGCGAGGCGTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100151 AAAATGAGAGTGGTGTTCCCAGAAGGTA...CAGGGCTCGGCGAGGCGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGGCCACTCAAGTCGGACCAGCCCCCTGGACAACGTTGGCCGAGAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109641 GGGCCACTCAAGTCGGACCAGCCCCCTGGACAACGTTGGCCGAGAACTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCTCCCATCTGCTCCAG         ACCCTGGATGGCTTCATCTTCGTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 109691 GCTCCCATCTGCTCCAGGTA...CAGACCCTGGATGGCTTCATCTTCGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTAGCCCCAGATGGGAAGATCATGTACATCTCAGAGACAGCCTCAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113137 GTAGCCCCAGATGGGAAGATCATGTACATCTCAGAGACAGCCTCAGTCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTTGGGTCTTTCTCAG         GTAGAGCTGACCGGAAACAGCATTT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 113187 CTTGGGTCTTTCTCAGGTA...CAGGTAGAGCTGACCGGAAACAGCATTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATGAATACATTCACCCGGCAGACCACGACGAGATGACGGCGGTGCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113795 ATGAATACATTCACCCGGCAGACCACGACGAGATGACGGCGGTGCTCACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCCCATCAACCCTACCACTCTCACTTCGTGCAGG         AGTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 113845 GCCCATCAACCCTACCACTCTCACTTCGTGCAGGGTA...CAGAGTATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GATCGAGCGCTCCTTCTTCCTGAGGATGAAGTGCGTCTTGGCCAAGCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114028 GATCGAGCGCTCCTTCTTCCTGAGGATGAAGTGCGTCTTGGCCAAGCGTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACGCCGGCCTCACCTGTGGCGGCTACAAG         GTCATCCACTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 114078 ACGCCGGCCTCACCTGTGGCGGCTACAAGGTG...CAGGTCATCCACTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AGCGGCTACTTGAAGATCCGCCAGTACAGCCTGGACATGTCCCCCTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114803 AGCGGCTACTTGAAGATCCGCCAGTACAGCCTGGACATGTCCCCCTTCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CGGCTGCTACCAAAACGTGGGCCTGGTGGCCGTGGGCCACTCGCTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114853 CGGCTGCTACCAAAACGTGGGCCTGGTGGCCGTGGGCCACTCGCTGCCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCAGCGCCGTCACGGAGATCAAGCTACACAGCAATATGTTTATGTTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114903 CCAGCGCCGTCACGGAGATCAAGCTACACAGCAATATGTTTATGTTCCGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GCCAGCCTGGACATGAAGCTCATCTTTCTGGACTCCAG         GGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 114953 GCCAGCCTGGACATGAAGCTCATCTTTCTGGACTCCAGGTG...CAGGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GGCGGAGCTGACGGGGTACGAACCTCAGGACCTGATTGAGAAGACTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115220 GGCGGAGCTGACGGGGTACGAACCTCAGGACCTGATTGAGAAGACTCTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ACCACCATGTGCACGGCTGCGACACCTTCCACCTGCGCTGCGCGCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115270 ACCACCATGTGCACGGCTGCGACACCTTCCACCTGCGCTGCGCGCACCAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TTGC         TGCTGGTGAAGGGACAGGTGACCACCAAGTACTACAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115320 TTGCGTA...CAGTGCTGGTGAAGGGACAGGTGACCACCAAGTACTACAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GTTCCTGGCGAAACACGGCGGCTGGGTATGGGTGCAGAGCTACGCGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116091 GTTCCTGGCGAAACACGGCGGCTGGGTATGGGTGCAGAGCTACGCGACCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TCGTGCACAACAGTCGCTCCTCCAGGCCACACTGTATCGTCAGCGTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116141 TCGTGCACAACAGTCGCTCCTCCAGGCCACACTGTATCGTCAGCGTCAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TATGTCCTCAC         AGACACAGAATACAAAGGGCTGCAGCTCTC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 116191 TATGTCCTCACGTG...CAGAGACACAGAATACAAAGGGCTGCAGCTCTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CCTGGATCAGATCTCAGCCTCCAAACCAGCCTTCTCCTATACCAGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142541 CCTGGATCAGATCTCAGCCTCCAAACCAGCCTTCTCCTATACCAGCAGCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CCACCCCCACCATGACTGACAACAGAAAGGGGGCCAAATCCCGGCTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142591 CCACCCCCACCATGACTGACAACAGAAAGGGGGCCAAATCCCGGCTCTCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 AGCTCAAAGTCAAAATCCAGGACTTCCCCATACCCTCAG         TA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 142641 AGCTCAAAGTCAAAATCCAGGACTTCCCCATACCCTCAGGTA...CAGTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TTCGGGATTTCACACAGAAAGATCGGAATCTGATCATGACAGCCAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169582 TTCGGGATTTCACACAGAAAGATCGGAATCTGATCATGACAGCCAGTGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GCGGAAGTCCCTTGACCGACACGGCCTCTCCGCAGCTTCTGGACCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169632 GCGGAAGTCCCTTGACCGACACGGCCTCTCCGCAGCTTCTGGACCCCGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GATAGGCCTGGCTCCCAGCACGACGCATCGTGCGCCTACAGACAGTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169682 GATAGGCCTGGCTCCCAGCACGACGCATCGTGCGCCTACAGACAGTTTTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GGACCGCAGCTCTCTCTGCTATGGCTTTGCGCTTGACCACTCGAGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169732 GGACCGCAGCTCTCTCTGCTATGGCTTTGCGCTTGACCACTCGAGGCTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TGGAAGAGAGGCATTTCCATACCCAGGCCTGTGAAGGAGGCCGATGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169782 TGGAAGAGAGGCATTTCCATACCCAGGCCTGTGAAGGAGGCCGATGTGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GCAGGCAGGTACTTCCTGGGAACGCCGCAGGCCGGGAGGGAGCCCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169832 GCAGGCAGGTACTTCCTGGGAACGCCGCAGGCCGGGAGGGAGCCCTGGTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GGGCTCTCGCGCAGCCTTGCCCCTGACAAAGGCCTCCCCAGAAAGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169882 GGGCTCTCGCGCAGCCTTGCCCCTGACAAAGGCCTCCCCAGAAAGCAGAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 AAGCCTATGAAAACAGCATGCCTCACATCGCTTCAGTCCACAGGATCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169932 AAGCCTATGAAAACAGCATGCCTCACATCGCTTCAGTCCACAGGATCCAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 G         GGCGAGGTCATTGGGATGAAGATAGTGTGGTCAGTTCTCC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169982 GGTA...TAGGGCGAGGTCATTGGGATGAAGATAGTGTGGTCAGTTCTCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 AGACCCTGGGTCGGCCAGTGAATCAGGTGACCGATATCGTACTGAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172418 AGACCCTGGGTCGGCCAGTGAATCAGGTGACCGATATCGTACTGAGCAGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 ATCAAAGTAGCCCACATGAACCCAGCAAAATTGAAACTCTTATAAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172468 ATCAAAGTAGCCCACATGAACCCAGCAAAATTGAAACTCTTATAAGAGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 ACTCAGCAAATGATTAAAGAAGAAGAGAACAGATTACAGCTAAGGAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172518 ACTCAGCAAATGATTAAAGAAGAAGAGAACAGATTACAGCTAAGGAAAGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 CCCCTCAGACCAACTGGCTTCCATTAATGGGGCTGGGAAAAAACACTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172568 CCCCTCAGACCAACTGGCTTCCATTAATGGGGCTGGGAAAAAACACTCCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 TGTGTTTTGCAAACTACCAACAGCCCCCACCAACAGGTGAAGTCTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172618 TGTGTTTTGCAAACTACCAACAGCCCCCACCAACAGGTGAAGTCTGCCAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 GGCTCTGCTCTTGCCAACACTTCACCATGTGACCATATCCAGCAGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172668 GGCTCTGCTCTTGCCAACACTTCACCATGTGACCATATCCAGCAGAGAGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1911 GGGAAAAATGTTGAGCCCCCATGAAAATGACTATGACAACAGTCCCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172718 GGGAAAAATGTTGAGCCCCCATGAAAATGACTATGACAACAGTCCCACCG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1961 CACTATCTCGGATAAGTAGTCCCAATTCGGATCGCATTTCAAAATCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172768 CACTATCTCGGATAAGTAGTCCCAATTCGGATCGCATTTCAAAATCCAGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 TTGATCCTAGCTAAAGACTATCTGCATTCGGATATATCTCCTCATCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172818 TTGATCCTAGCTAAAGACTATCTGCATTCGGATATATCTCCTCATCAGAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 AGCAGGAGACCACCCTACTGTCTCTCCAAACTGCTTTGGCTCTCACCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172868 AGCAGGAGACCACCCTACTGTCTCTCCAAACTGCTTTGGCTCTCACCGGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111 AGTATTTTGACAAGCATGCTTACACATTAACTGGATATGCCCTGGAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172918 AGTATTTTGACAAGCATGCTTACACATTAACTGGATATGCCCTGGAGCAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2161 TTATATGACAGCGAAACCATTAGAAACTATTCCTTGGGCTGTAATGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172968 TTATATGACAGCGAAACCATTAGAAACTATTCCTTGGGCTGTAATGGCTC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2211 ACACTTTGATGTAACTTCCCATCTGAGGATGCAACCAGACCCAGCACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173018 ACACTTTGATGTAACTTCCCATCTGAGGATGCAACCAGACCCAGCACAAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .
   2261 GACACAAGGGAACATCTGTTATAATAACCAACGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173068 GACACAAGGGAACATCTGTTATAATAACCAACGGAAGC