seq1 = pF1KB9758.tfa, 2133 bp
seq2 = pF1KB9758/gi568815578f_23264384.tfa (gi568815578f:23264384_23470438), 206055 bp

>pF1KB9758 2133
>gi568815578f:23264384_23470438 (Chr20)

1-1364  (100001-101364)   100% ->
1365-1459  (102620-102714)   100% ->
1460-1627  (104379-104546)   100% ->
1628-1785  (105201-105358)   100% ->
1786-2133  (105708-106055)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAAGCGGTGCAGTTCTGCTGGAATCCAAATCCTCCCCATTTAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAAGCGGTGCAGTTCTGCTGGAATCCAAATCCTCCCCATTTAACCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACTGCATGAGATGCATGAGCTTCGCCTCCTGGGTCACCTGTGTGACGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACTGCATGAGATGCATGAGCTTCGCCTCCTGGGTCACCTGTGTGACGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGTCAGCGTGGAGTATCAGGGTGTCCGCAAAGACTTCATGGCCCACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGTCAGCGTGGAGTATCAGGGTGTCCGCAAAGACTTCATGGCCCACAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCAGTGCTGGCTGCCACCAGCAAGTTTTTTAAGGAAGTGTTCCTTAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCAGTGCTGGCTGCCACCAGCAAGTTTTTTAAGGAAGTGTTCCTTAATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAGAGTGTGGATGGTACTAGGACTAATGTCTACTTAAATGAAGTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAGAGTGTGGATGGTACTAGGACTAATGTCTACTTAAATGAAGTGCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTGCTGACTTTGCTTCATTTCTTGAGTTTGTCTACACTGCAAAGGTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTGCTGACTTTGCTTCATTTCTTGAGTTTGTCTACACTGCAAAGGTACAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGGAAGAAGATCGGGTGCAGCGAATGCTGGAAGTGGCTGAAAAGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGGAAGAAGATCGGGTGCAGCGAATGCTGGAAGTGGCTGAAAAGCTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ATGTTTGGATTTATCAGAAACTTGTTTTCAATTAAAGAAACAGATGTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ATGTTTGGATTTATCAGAAACTTGTTTTCAATTAAAGAAACAGATGTTAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGTCAGTACTTTTGGAGTTGCAAAATTTCTCAGAGTCTCAGGAGGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGTCAGTACTTTTGGAGTTGCAAAATTTCTCAGAGTCTCAGGAGGTGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGAGCAGTGGCTCCCAAGTTAGTGCTGCTCCTGCCCCCAGGGCAAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGAGCAGTGGCTCCCAAGTTAGTGCTGCTCCTGCCCCCAGGGCAAGTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGCCACCGATGGCCCTCACCCCAGTGGTCTCACGGATTCCTTGGACTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGCCACCGATGGCCCTCACCCCAGTGGTCTCACGGATTCCTTGGACTACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CAGGAGAGAGAGCCAGCAATGGCATGTCTTCAGATTTGCCACCGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CAGGAGAGAGAGCCAGCAATGGCATGTCTTCAGATTTGCCACCGAAGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCCAAGGACAAACTAGACAAGAAGAAAGAGGTAGTTAAACCTCCCTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCCAAGGACAAACTAGACAAGAAGAAAGAGGTAGTTAAACCTCCCTACCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TAAAATCAGGAGAGCTAGTGGAAGGCTGGCTGGGAGGAAGGTCTTTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TAAAATCAGGAGAGCTAGTGGAAGGCTGGCTGGGAGGAAGGTCTTTGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGATCCCTAAAAAGAAATATACGAGAAGACTCCGAGAGCAGCAGAAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGATCCCTAAAAAGAAATATACGAGAAGACTCCGAGAGCAGCAGAAAACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCTGAGGGTGATGTGGGGGACTACAGGTGTCCCCAGGACCAAAGCCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCTGAGGGTGATGTGGGGGACTACAGGTGTCCCCAGGACCAAAGCCCGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAGGGTGGGCACGGAGATGGAGCAGGTTTCCAAAAATGAGGGTTGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAGGGTGGGCACGGAGATGGAGCAGGTTTCCAAAAATGAGGGTTGCCAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CAGGTGCTGAGTTGGAGGAATTGTCAAAGAAAGCAGGGCCGGAGGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CAGGTGCTGAGTTGGAGGAATTGTCAAAGAAAGCAGGGCCGGAGGAGGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GAGGAGGAGGAGGAGGAGGACGAAGAAGGGGAGAAGAAGAAGAGCAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GAGGAGGAGGAGGAGGAGGACGAAGAAGGGGAGAAGAAGAAGAGCAACTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TAAGTGCAGCATTTGCGAGAAGGCGTTTCTGTATGAGAAGAGCTTCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TAAGTGCAGCATTTGCGAGAAGGCGTTTCTGTATGAGAAGAGCTTCCTGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGCACAGCAAGCACCGCCACGGCGTGGCCACCGAGGTGGTGTACCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGCACAGCAAGCACCGCCACGGCGTGGCCACCGAGGTGGTGTACCGCTGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GACACCTGCGGCCAGACCTTCGCCAACCGCTGCAACCTGAAGAGCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GACACCTGCGGCCAGACCTTCGCCAACCGCTGCAACCTGAAGAGCCACCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GCGCCACGTGCACAGCAGCGAGCGCCATTTCCCATGCGAGCTGTGCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GCGCCACGTGCACAGCAGCGAGCGCCATTTCCCATGCGAGCTGTGCGGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGAAGTTCAAGCGCAAGAAGGACGTGAAGCGGCACGTGCTGCAGGTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGAAGTTCAAGCGCAAGAAGGACGTGAAGCGGCACGTGCTGCAGGTGCAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GAGGGCGGCGGCGAGCGGCACCGCTGCGGCCAGTGCGGCAAGGGCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GAGGGCGGCGGCGAGCGGCACCGCTGCGGCCAGTGCGGCAAGGGCCTGAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TTCCAAGACAGCGCTGCGGCTGCACGAGCGCACACACACGGGAGACCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TTCCAAGACAGCGCTGCGGCTGCACGAGCGCACACACACGGGAGACCGGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CCTACGGCTGCACCGAGTGCGGCGCCAGGTTCTCGCAGCCGTCCGCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CCTACGGCTGCACCGAGTGCGGCGCCAGGTTCTCGCAGCCGTCCGCGCTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 AAGACGCACATGAG         AATTCATACAGGGGAAAAACCTTTTGT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 101351 AAGACGCACATGAGGTA...CAGAATTCATACAGGGGAAAAACCTTTTGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 CTGTGATGAATGTGGTGCAAGATTCACTCAGAACCACATGCTGATTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102647 CTGTGATGAATGTGGTGCAAGATTCACTCAGAACCACATGCTGATTTATC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 ATAAAAGGTGTCACACAG         GTGAAAGACCTTTTATGTGTGAA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 102697 ATAAAAGGTGTCACACAGGTA...TAGGTGAAAGACCTTTTATGTGTGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 ACATGTGGCAAGAGTTTTGCTTCTAAGGAGTACTTAAAACACCACAATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104402 ACATGTGGCAAGAGTTTTGCTTCTAAGGAGTACTTAAAACACCACAATAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 AATCCATACTGGATCCAAACCCTTTAAATGTGAAGTATGTTTCAGGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104452 AATCCATACTGGATCCAAACCCTTTAAATGTGAAGTATGTTTCAGGACTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 TTGCCCAGCGGAATTCACTGTACCAGCATATTAAAGTCCACACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 104502 TTGCCCAGCGGAATTCACTGTACCAGCATATTAAAGTCCACACAGGTA..

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1628     GGGAGCGTCCCTACTGCTGTGACCAGTGCGGCAAGCAGTTCACCCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104552 .CAGGGGAGCGTCCCTACTGCTGTGACCAGTGCGGCAAGCAGTTCACCCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 GCTCAACGCCCTCCAGCGCCACCGCCGCATCCACACAGGGGAGAGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105247 GCTCAACGCCCTCCAGCGCCACCGCCGCATCCACACAGGGGAGAGGCCAT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 TCATGTGCAATGCGTGCGGACGGACATTCACCGACAAGTCCACTCTTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105297 TCATGTGCAATGCGTGCGGACGGACATTCACCGACAAGTCCACTCTTCGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 CGGCACACCTCA         ATACACGATAAGAATACTCCATGGAAGTC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 105347 CGGCACACCTCAGTA...TAGATACACGATAAGAATACTCCATGGAAGTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1815 TTTCCTTGTCATTGTAGATGGCTCGCCCAAGAACGATGACGGACACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105737 TTTCCTTGTCATTGTAGATGGCTCGCCCAAGAACGATGACGGACACAAGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1865 CTGAACAGCCTGACGAAGAGTATGTGTCATCCAAGCTTTCGGATAAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105787 CTGAACAGCCTGACGAAGAGTATGTGTCATCCAAGCTTTCGGATAAATTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1915 CTGTCTTTTGCAGAAAATGGCCATTTCCACAACCTGGCTGCAGTCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105837 CTGTCTTTTGCAGAAAATGGCCATTTCCACAACCTGGCTGCAGTCCAAGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1965 CACTGTACCTACCATGCAGGAGAACAGTTCTGCTGACACAGCCTGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105887 CACTGTACCTACCATGCAGGAGAACAGTTCTGCTGACACAGCCTGCAAGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2015 CAGATGACACCGTGGTGTCCCAGGACACCCTCCTGGCCACCACCATCAGT
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105937 CAGATGACTCCGTGGTGTCCCAGGACACCCTCCTGGCCACCACCATCAGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2065 GAGCTTAGCGAGCTGACCCCACAGACAGACTCGATGCCCACACAGCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105987 GAGCTTAGCGAGCTGACCCCACAGACAGACTCGATGCCCACACAGCTTCA

   2150     .    :    .
   2115 CTCTTTGAGCAACATGGAA
        |||||||||||||||||||
 106037 CTCTTTGAGCAACATGGAA