seq1 = pF1KB9752.tfa, 1821 bp
seq2 = pF1KB9752/gi568815592r_84636688.tfa (gi568815592r:84636688_84864181), 227494 bp

>pF1KB9752 1821
>gi568815592r:84636688_84864181 (Chr6)

(complement)

1-292  (100001-100292)   99% ->
293-497  (101434-101638)   99% ->
498-599  (103826-103927)   100% ->
600-771  (107313-107484)   100% ->
772-939  (116095-116262)   100% ->
940-1004  (119857-119921)   100% ->
1005-1099  (125591-125685)   100% ->
1100-1821  (126773-127494)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGAGAAGCGAAGGGGCTCGCCGTGCAGCATGCTAAGCCTCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGAGAAGCGAAGGGGCTCGCCGTGCAGCATGCTAAGCCTCAAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCACGCTTTCTCGGTGGAGGCGCTGATCGGCGCCGAGAAGCAGCAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCACGCTTTCTCGGTGGAGGCGCTGATCGGCGCCGAGAAGCAGCAACAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTCAGAAGAAGCGGCGAAAACTGGGCGCCGAAGAGGCGGCGAGGGCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100101 TTCAGAAGAAGCGGCGAAAACTGGGCGCCGAAGAGGCGGCGGGGGCCGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACGACGGAGGCTGCAGCCGCGGCGGCGGCGCGGGCGAAAAGGGTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACGACGGAGGCTGCAGCCGCGGCGGCGGCGCGGGCGAAAAGGGTTCTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGAGGGAGACGAAGGCGCTGCGCTCCCGCCGCCGGCTGGGGCGACGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGAGGGAGACGAAGGCGCTGCGCTCCCGCCGCCGGCTGGGGCGACGTCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCCGGCTCGGAGTGGCGCAGACCTGGAGCGCGGAGCCGCGG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100251 GGCCGGCTCGGAGTGGCGCAGACCTGGAGCGCGGAGCCGCGGGTG...CA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    293  GCGGCTGTGAGGACGGCTTCCAGCAGGGAGCTTCCCCTCTGGCGTCACC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101433 GGCGGCTGTGAGGACGGCTTCCAGCAGGGAGCTTCCCCTCTGGCGTCACC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGGAGGCTCCCCCAAGGGGTCTCCGGCGCGCTCCCTGGCCCGGCCCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101483 GGGAGGCTCCCCCAAGGGGTCTCCGGCGCGCTCCCTGGCCCGGCCCGGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCCCTCTGCCCTCGCCGCAGGCCCCGCGGGTGGATCTGCAGGGAGCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101533 CCCCTCTGCCCTCGCCGCAGGCCCCGCGGGTGGATCTGCAGGGAGCCGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CTCTGGAAGCGTTTTCATGAGATAGGCACTGAGATGATCATCACCAAGGC
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101583 CTCTGGAAGCGCTTTCATGAGATAGGCACTGAGATGATCATCACCAAGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CGGCAG         GCGCATGTTTCCAGCAATGAGAGTGAAGATCTCTG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101633 CGGCAGGTA...TAGGCGCATGTTTCCAGCAATGAGAGTGAAGATCTCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GATTAGATCCTCACCAGCAATATTACATTGCCATGGATATTGTACCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103861 GATTAGATCCTCACCAGCAATATTACATTGCCATGGATATTGTACCAGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GACAACAAAAGATACAG         GTATGTTTACCACAGTTCGAAATG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 103911 GACAACAAAAGATACAGGTA...TAGGTATGTTTACCACAGTTCGAAATG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GATGGTGGCAGGTAATGCTGACTCGCCTGTGCCACCCCGTGTGTACATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107337 GATGGTGGCAGGTAATGCTGACTCGCCTGTGCCACCCCGTGTGTACATTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ATCCAGACTCGCCTGCCTCGGGGGAGACTTGGATGAGACAAGTTATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107387 ATCCAGACTCGCCTGCCTCGGGGGAGACTTGGATGAGACAAGTTATCAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TTCGACAAGCTGAAGCTCACCAACAATGAACTGGATGACCAAGGCCAT  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 107437 TTCGACAAGCTGAAGCTCACCAACAATGAACTGGATGACCAAGGCCATGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    772        ATTATTCTTCATTCTATGCACAAATACCAACCGCGAGTGCACG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107487 G...TAGATTATTCTTCATTCTATGCACAAATACCAACCGCGAGTGCACG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TCATCCGTAAAGACTGTGGAGACGATCTTTCTCCCATCAAGCCTGTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116138 TCATCCGTAAAGACTGTGGAGACGATCTTTCTCCCATCAAGCCTGTTCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TCCGGGGAGGGAGTAAAGGCATTCTCCTTTCCAGAAACTGTCTTCACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116188 TCCGGGGAGGGAGTAAAGGCATTCTCCTTTCCAGAAACTGTCTTCACAAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CGTCACTGCCTATCAGAATCAGCAG         ATTACTCGCCTGAAGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 116238 CGTCACTGCCTATCAGAATCAGCAGGTA...CAGATTACTCGCCTGAAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TAGATAGGAATCCATTTGCTAAAGGCTTCCGAGACTCCGGGCGCAACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 119873 TAGATAGGAATCCATTTGCTAAAGGCTTCCGAGACTCCGGGCGCAACAGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1005         AATGGGTTTGGAAGCCTTGGTGGAATCATATGCATTCTGGCG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119923 TG...TAGAATGGGTTTGGAAGCCTTGGTGGAATCATATGCATTCTGGCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 ACCATCACTACGGACTCTGACCTTTGAAGATATCCCTGGAATTCCCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125633 ACCATCACTACGGACTCTGACCTTTGAAGATATCCCTGGAATTCCCAAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 AAG         GCAATGCAAGTTCCTCCACCTTGCTCCAAGGTACTGGG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125683 AAGGTA...TAGGCAATGCAAGTTCCTCCACCTTGCTCCAAGGTACTGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 AATGGCGTTCCTGCCACTCACCCTCACCTTTTGTCTGGCTCCTCTTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126811 AATGGCGTTCCTGCCACTCACCCTCACCTTTTGTCTGGCTCCTCTTGCTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CTCTCCTGCCTTCCATCTGGGGCCCAACACCAGCCAGCTGTGTAGTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126861 CTCTCCTGCCTTCCATCTGGGGCCCAACACCAGCCAGCTGTGTAGTCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CCCCTGCTGACTATTCTGCCTGTGCCCGCTCAGGCCTCACCCTCAACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126911 CCCCTGCTGACTATTCTGCCTGTGCCCGCTCAGGCCTCACCCTCAACCGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TACAGCACATCTTTGGCAGAGACCTACAACAGGCTCACCAACCAGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126961 TACAGCACATCTTTGGCAGAGACCTACAACAGGCTCACCAACCAGGCTGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 TGAGACCTTTGCCCCGCCCAGGACTCCCTCCTATGTGGGCGTGAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127011 TGAGACCTTTGCCCCGCCCAGGACTCCCTCCTATGTGGGCGTGAGCAGCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 GCACCTCCGTGAACATGTCCATGGGTGGCACTGATGGGGACACCTTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127061 GCACCTCCGTGAACATGTCCATGGGTGGCACTGATGGGGACACCTTCAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 TGCCCACAGACCAGCTTATCCATGCAGATTTCGGGAATGTCCCCCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127111 TGCCCACAGACCAGCTTATCCATGCAGATTTCGGGAATGTCCCCCCAGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 CCAGTATATCATGCCATCACCCTCCAGCAATGCCTTCGCCACTAACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127161 CCAGTATATCATGCCATCACCCTCCAGCAATGCCTTCGCCACTAACCAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 CCCATCAGGGTTCCTATAATACTTTTAGATTACACAGCCCCTGTGCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127211 CCCATCAGGGTTCCTATAATACTTTTAGATTACACAGCCCCTGTGCACTA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 TATGGATATAACTTCTCCACATCCCCCAAACTGGCTGCCAGTCCTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127261 TATGGATATAACTTCTCCACATCCCCCAAACTGGCTGCCAGTCCTGAGAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 AATTGTTTCTTCCCAAGGAAGTTTCTTGGGGTCCTCACCGAGTGGGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127311 AATTGTTTCTTCCCAAGGAAGTTTCTTGGGGTCCTCACCGAGTGGGACCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 TGACGGATCGGCAGATGTTGCCCCCTGTGGAAGGAGTGCACCTGCTTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127361 TGACGGATCGGCAGATGTTGCCCCCTGTGGAAGGAGTGCACCTGCTTAGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 AGTGGGGGTCAGCAGAGTTTCTTTGACTCTAGGACCCTAGGAAGCTTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127411 AGTGGGGGTCAGCAGAGTTTCTTTGACTCTAGGACCCTAGGAAGCTTAAC

   1850     .    :    .    :    .    :
   1788 TCTGTCATCATCTCAAGTATCTGCACATATGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127461 TCTGTCATCATCTCAAGTATCTGCACATATGGTC