seq1 = pF1KB9751.tfa, 1818 bp
seq2 = pF1KB9751/gi568815587r_6899865.tfa (gi568815587r:6899865_7102835), 202971 bp

>pF1KB9751 1818
>gi568815587r:6899865_7102835 (Chr11)

(complement)

1-127  (100001-100127)   100% ->
128-1818  (101281-102971)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGTAACATTTGAAGATGTGACTATTATTTTTACATGGGAGGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGTAACATTTGAAGATGTGACTATTATTTTTACATGGGAGGAGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAATTCCTGGATTCTTCTCAAAAAAGACTCTACAGGGAGGTCATGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAATTCCTGGATTCTTCTCAAAAAAGACTCTACAGGGAGGTCATGTGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAACTACACAAATGTCATGTCAGTAG         AAAACTGGAATGAG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100101 AGAACTACACAAATGTCATGTCAGTAGGTA...TAGAAAACTGGAATGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGCTACAAATCCCAAGAAGAAAAATTCAGATACTTAGAATATGAAAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101295 AGCTACAAATCCCAAGAAGAAAAATTCAGATACTTAGAATATGAAAATTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTCCTACTGGCAAGGCTGGTGGAATGCTGGCGCCCAGATGTATGAGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101345 TTCCTACTGGCAAGGCTGGTGGAATGCTGGCGCCCAGATGTATGAGAATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGAACTATGGGGAAACTGTTCAAGGGACAGATTCCAAAGACCTCACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101395 AGAACTATGGGGAAACTGTTCAAGGGACAGATTCCAAAGACCTCACACAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAAGATCGTTCCCAGTGTCAGGAATGGTTAATACTCTCCACACAAGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101445 CAAGATCGTTCCCAGTGTCAGGAATGGTTAATACTCTCCACACAAGTACC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGGGTATGGGAACTATGAACTGACTTTTGAAAGCAAAAGTCTCAGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101495 AGGGTATGGGAACTATGAACTGACTTTTGAAAGCAAAAGTCTCAGGAACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TAAAATATAAAAATTTTATGCCTTGGCAGTCCTTAGAAACAAAAACCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101545 TAAAATATAAAAATTTTATGCCTTGGCAGTCCTTAGAAACAAAAACCACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CAAGACTATGGTAGAGAAATCTACATGAGTGGTTCACATGGTTTTCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101595 CAAGACTATGGTAGAGAAATCTACATGAGTGGTTCACATGGTTTTCAAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGGCAGATACCGTCTTGGCATATCCAGGAAAAACCTCTCCATGGAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101645 GGGCAGATACCGTCTTGGCATATCCAGGAAAAACCTCTCCATGGAAAAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AACAGAAGCTCATAGTTCAGCATTCTTATATCCCAGTGGAGGAAGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101695 AACAGAAGCTCATAGTTCAGCATTCTTATATCCCAGTGGAGGAAGCCCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CCACAGTATGTTGGGGTGATATGTCAAGAAGACCTACTGAGAGATTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101745 CCACAGTATGTTGGGGTGATATGTCAAGAAGACCTACTGAGAGATTCAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GGAAGAAAAGTACTGTGGATGTAATAAATGTAAAGGAATTTATTATTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101795 GGAAGAAAAGTACTGTGGATGTAATAAATGTAAAGGAATTTATTATTGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ACTCACGGTGTGTTTTCCACAAGAGAAATCAACCTGGAGAAAACCTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101845 ACTCACGGTGTGTTTTCCACAAGAGAAATCAACCTGGAGAAAACCTCTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CAATGCTCCATCTGTAAAGCATGCTTCTCTCAGAGATCAGACTTGTATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101895 CAATGCTCCATCTGTAAAGCATGCTTCTCTCAGAGATCAGACTTGTATAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 ACATCCAAGAAACCACATAGGTAAGAAGCTGTACGGATGTGATGAAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101945 ACATCCAAGAAACCACATAGGTAAGAAGCTGTACGGATGTGATGAAGTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 ACGGTAACTTTCATCAGAGCTCCGGAGTTCACTTTCATCAGAGAGTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101995 ACGGTAACTTTCATCAGAGCTCCGGAGTTCACTTTCATCAGAGAGTTCAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 ATAGGGGAGGTACCTTATAGCTGTAATGCATGTGGTAAGAGCTTCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102045 ATAGGGGAGGTACCTTATAGCTGTAATGCATGTGGTAAGAGCTTCAGCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GATCTCTAGTCTTCACAATCATCAAAGAGTCCACACAGAAGAGAAATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102095 GATCTCTAGTCTTCACAATCATCAAAGAGTCCACACAGAAGAGAAATTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 ATAAAATTGAGTGTGATAAAGACCTCAGTAGAAATTCATTACTTCACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102145 ATAAAATTGAGTGTGATAAAGACCTCAGTAGAAATTCATTACTTCACATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CACCAGAGACTTCACATAGGAGAGAAGCCTTTTAAATGTAATCAGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102195 CACCAGAGACTTCACATAGGAGAGAAGCCTTTTAAATGTAATCAGTGTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 TAAGAGTTTTAATCGGAGTTCAGTACTTCATGTTCATCAGAGAGTCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102245 TAAGAGTTTTAATCGGAGTTCAGTACTTCATGTTCATCAGAGAGTCCACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 CAGGAGAAAAACCATATAAGTGTGATGAGTGTGGTAAGGGTTTCAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102295 CAGGAGAAAAACCATATAAGTGTGATGAGTGTGGTAAGGGTTTCAGCCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 AGCTCAAATCTTCGAATTCATCAGTTAGTACACACAGGAGAGAAGTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102345 AGCTCAAATCTTCGAATTCATCAGTTAGTACACACAGGAGAGAAGTCTTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 TAAATGTGAAGACTGTGGTAAAGGCTTTACCCAGCGCTCAAATCTTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102395 TAAATGTGAAGACTGTGGTAAAGGCTTTACCCAGCGCTCAAATCTTCAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 TTCATCAGAGAGTGCATACAGGAGAGAAACCTTATAAATGTGATGACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102445 TTCATCAGAGAGTGCATACAGGAGAGAAACCTTATAAATGTGATGACTGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 GGAAAGGACTTTAGTCACAGCTCAGATCTTCGCATTCATCAGAGAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102495 GGAAAGGACTTTAGTCACAGCTCAGATCTTCGCATTCATCAGAGAGTCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 TACAGGGGAGAAACCCTATACTTGTCCTGAATGTGGGAAGGGCTTCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102545 TACAGGGGAGAAACCCTATACTTGTCCTGAATGTGGGAAGGGCTTCAGTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 AGAGTTCAAAGCTTCACACTCATCAAAGAGTACATACTGGAGAGAAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102595 AGAGTTCAAAGCTTCACACTCATCAAAGAGTACATACTGGAGAGAAACCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 TACAAATGTGAAGAGTGTGGCAAGGGATTCAGTCAGCGTTCACATCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102645 TACAAATGTGAAGAGTGTGGCAAGGGATTCAGTCAGCGTTCACATCTTCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 CATTCATCAGAGAGTCCATACAGGAGAAAAGCCCTATAAATGTCATGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102695 CATTCATCAGAGAGTCCATACAGGAGAAAAGCCCTATAAATGTCATGATT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 GTGGAAAGGGTTTTAGTCACAGTTCTAATCTTCACATTCATCAGAGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102745 GTGGAAAGGGTTTTAGTCACAGTTCTAATCTTCACATTCATCAGAGGGTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 CATACAGGAGAGAAGCCTTATCAATGTGCTAAGTGTGGTAAAGGTTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102795 CATACAGGAGAGAAGCCTTATCAATGTGCTAAGTGTGGTAAAGGTTTCAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 TCATAGCTCAGCTCTTCGAATTCATCAAAGAGTCCATGCAGGAGAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102845 TCATAGCTCAGCTCTTCGAATTCATCAAAGAGTCCATGCAGGAGAGAAAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1742 CTTACAAATGCCGTGAATATTATAAGGGATTTGATCATAATTCACATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102895 CTTACAAATGCCGTGAATATTATAAGGGATTTGATCATAATTCACATCTT

   1800     .    :    .    :    .
   1792 CACAATAATCATAGAAGAGGAAACTTA
        |||||||||||||||||||||||||||
 102945 CACAATAATCATAGAAGAGGAAACTTA