seq1 = pF1KB9747.tfa, 1635 bp
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>pF1KB9747 1635
>gi568815581f:61356491_61583513 (Chr17)

1-186  (100001-100186)   100% ->
187-281  (101047-101141)   100% ->
282-401  (109329-109448)   100% ->
402-549  (111020-111167)   100% ->
550-702  (122137-122289)   100% ->
703-791  (123391-123479)   100% ->
792-1021  (123600-123829)   100% ->
1022-1635  (126410-127023)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGCAGGATAAGGGCCTGTCCGAGAGCGAGGAGGCCTTCCGGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGCAGGATAAGGGCCTGTCCGAGAGCGAGGAGGCCTTCCGGGCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCCCAGCGCTCGGAGAGGCCAGCGCAGCCAACGCCCCCGAGCCCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCCCAGCGCTCGGAGAGGCCAGCGCAGCCAACGCCCCCGAGCCCGCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGCAGCGCCGGGCCTCAGCGGAGCCGCGCTAGGCAGCCCCCCGGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGCAGCGCCGGGCCTCAGCGGAGCCGCGCTAGGCAGCCCCCCGGGACCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGGCCGACGTCGTCGCCGCCGCCGCCGCGGAGCAG         ACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100151 GGGGCCGACGTCGTCGCCGCCGCCGCCGCGGAGCAGGTA...CAGACCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGAGAACATCAAGGTGGGGCTGCATGAGAAGGAGCTCTGGAAGAAGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101052 CGAGAACATCAAGGTGGGGCTGCATGAGAAGGAGCTCTGGAAGAAGTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACGAGGCGGGCACCGAGATGATCATCACTAAGGCTGGCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 101102 ACGAGGCGGGCACCGAGATGATCATCACTAAGGCTGGCAGGTC...CAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGGATGTTCCCCAGCTACAAGGTAAAAGTCACAGGCATGAACCCCAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109330 AGGATGTTCCCCAGCTACAAGGTAAAAGTCACAGGCATGAACCCCAAGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAAGTATATCCTGCTGATTGACATTGTCCCTGCCGATGACCATCGCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109380 CAAGTATATCCTGCTGATTGACATTGTCCCTGCCGATGACCATCGCTACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGTTCTGTGACAACAAATG         GATGGTGGCAGGGAAGGCTGAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 109430 AGTTCTGTGACAACAAATGGTA...CAGGATGGTGGCAGGGAAGGCTGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCAGCCATGCCAGGAAGGCTGTATGTCCACCCGGATTCTCCTGCCACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111042 CCAGCCATGCCAGGAAGGCTGTATGTCCACCCGGATTCTCCTGCCACAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGCCCACTGGATGCGGCAGCTGGTCTCCTTCCAGAAGCTGAAGCTGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111092 AGCCCACTGGATGCGGCAGCTGGTCTCCTTCCAGAAGCTGAAGCTGACAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACAACCACCTGGACCCCTTTGGCCAT         ATCATCCTCAACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 111142 ACAACCACCTGGACCCCTTTGGCCATGTA...CAGATCATCCTCAACTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATGCACAAGTACCAGCCGCGGCTCCACATCGTTAAGGCTGATGAGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122152 ATGCACAAGTACCAGCCGCGGCTCCACATCGTTAAGGCTGATGAGAACAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGCTTTCGGCTCCAAAAACACTGCTTTCTGCACCCACGTGTTCCCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122202 TGCTTTCGGCTCCAAAAACACTGCTTTCTGCACCCACGTGTTCCCAGAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCTCCTTCATCTCTGTGACCTCCTACCAGAATCACAAG         ATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 122252 CCTCCTTCATCTCTGTGACCTCCTACCAGAATCACAAGGTA...CAGATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ACCCAGCTGAAAATTGAGAACAACCCTTTTGCCAAGGGATTCCGGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123394 ACCCAGCTGAAAATTGAGAACAACCCTTTTGCCAAGGGATTCCGGGGCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGATGACAGTGACCTGCGTGTGGCCCGACTGCAGAG         CAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 123444 TGATGACAGTGACCTGCGTGTGGCCCGACTGCAGAGGTG...CAGCAAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AATACCCCGTGATTTCCAAAAGCATCATGAGGCAGAGGCTCATCTCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123605 AATACCCCGTGATTTCCAAAAGCATCATGAGGCAGAGGCTCATCTCCCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CAGCTCTCAGCCACACCGGACGTGGGCCCCCTGCTCGGCACCCACCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123655 CAGCTCTCAGCCACACCGGACGTGGGCCCCCTGCTCGGCACCCACCAGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 ACTCCAGCACTACCAGCACGAGAACGGGGCACACTCACAGCTCGCGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123705 ACTCCAGCACTACCAGCACGAGAACGGGGCACACTCACAGCTCGCGGAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CGCAGGACCTGCCCCTCAGCACCTTTCCCACCCAGAGGGACTCAAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123755 CGCAGGACCTGCCCCTCAGCACCTTTCCCACCCAGAGGGACTCAAGCCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TTCTATCACTGCCTGAAAAGACGAG         ACGGTACCCGCCACCT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 123805 TTCTATCACTGCCTGAAAAGACGAGGTA...CAGACGGTACCCGCCACCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GGACTTACCTTGCAAGCGATCCTATCTGGAAGCCCCCTCTTCGGTGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126426 GGACTTACCTTGCAAGCGATCCTATCTGGAAGCCCCCTCTTCGGTGGGGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AGGATCACTATTTCCGTTCCCCCCCTCCCTACGACCAGCAAATGCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126476 AGGATCACTATTTCCGTTCCCCCCCTCCCTACGACCAGCAAATGCTGAGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CCCTCCTACTGCAGTGAGGTGACCCCCAGAGAAGCATGTATGTACTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126526 CCCTCCTACTGCAGTGAGGTGACCCCCAGAGAAGCATGTATGTACTCAGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TTCAGGGCCCGAGATTGCCGGGGTGTCTGGGGTGGACGACCTGCCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126576 TTCAGGGCCCGAGATTGCCGGGGTGTCTGGGGTGGACGACCTGCCCCCAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CTCCGCTGAGCTGTAACATGTGGACTTCAGTGTCGCCGTACACCAGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126626 CTCCGCTGAGCTGTAACATGTGGACTTCAGTGTCGCCGTACACCAGCTAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 AGCGTGCAGACGATGGAGACTGTGCCGTACCAGCCCTTCCCCACGCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126676 AGCGTGCAGACGATGGAGACTGTGCCGTACCAGCCCTTCCCCACGCACTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 CACCGCCACCACCATGATGCCGCGGCTGCCCACCCTCTCCGCTCAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126726 CACCGCCACCACCATGATGCCGCGGCTGCCCACCCTCTCCGCTCAGAGCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 CCCAGCCACCAGGAAATGCCCACTTTAGTGTCTACAATCAGCTCTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126776 CCCAGCCACCAGGAAATGCCCACTTTAGTGTCTACAATCAGCTCTCCCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 TCTCAGGTCCGAGAGCGGGGGCCCAGCGCCTCATTCCCAAGAGAGCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126826 TCTCAGGTCCGAGAGCGGGGGCCCAGCGCCTCATTCCCAAGAGAGCGCGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 CCTCCCCCAAGGGTGTGAGAGGAAGCCACCCTCGCCACATCTAAATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126876 CCTCCCCCAAGGGTGTGAGAGGAAGCCACCCTCGCCACATCTAAATGCTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 CCAATGAGTTTCTCTACTCTCAAACCTTCTCCTTGTCCCGAGAATCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126926 CCAATGAGTTTCTCTACTCTCAAACCTTCTCCTTGTCCCGAGAATCTTCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1588 TTACAGTACCATTCAGGAATGGGGACTGTGGAGAACTGGACTGACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126976 TTACAGTACCATTCAGGAATGGGGACTGTGGAGAACTGGACTGACGGA