seq1 = pF1KB9746.tfa, 1626 bp
seq2 = pF1KB9746/gi568815579f_34843221.tfa (gi568815579f:34843221_35044835), 201615 bp

>pF1KB9746 1626
>gi568815579f:34843221_35044835 (Chr19)

12-1626  (100001-101615)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     12 AGATTTGCAGTTGGAAGATGATACAATCGGCTGTAAAGAAATGCCCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 AGATTTGCAGTTGGAAGATGATACAATCGGCTGTAAAGAAATGCCCACCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     62 CTGAAAACTGTCCATCTTTTGCTCTACATCAGAAAATAAGTAGACAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGAAAACTGTCCATCTTTTGCTCTACATCAGAAAATAAGTAGACAGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    112 CCACGTGAATGTCGGGAATATGGAAAGACCCTTTGTCAAGACTCAAAGCC
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCACGTGAATGTCAGGAATATGGAAAGACCCTTTGTCAAGACTCAAAGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    162 TGTTCAACATGAAAGAATACATAGTAGTGAAAAACCCAACAGATGTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGTTCAACATGAAAGAATACATAGTAGTGAAAAACCCAACAGATGTAAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    212 AATGTGGGAAGAACTTTAGTAATGGACATCAACTCACCATACATCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AATGTGGGAAGAACTTTAGTAATGGACATCAACTCACCATACATCAGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    262 TTGCATGTTGGTGAGAAACCCTATAAATATGAAAAATGTGGGAAGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTGCATGTTGGTGAGAAACCCTATAAATATGAAAAATGTGGGAAGGCCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    312 TATCAGTGGCTCAGCCTTTGTTAAGCATGGGAGAATTCACACTGGTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TATCAGTGGCTCAGCCTTTGTTAAGCATGGGAGAATTCACACTGGTGAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    362 AGCCACTCAAATGTAAGCAATGTGGAAAGACTATTAGCGGTAGCTATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 100351 AGCCACTCAAATGTAAGCAATGTGGAAAGACTATTAGTGGTAGCTATCAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    412 CTTACAGTACATAAGAGTATTCATACTGGGAAGAAACCATATGAGTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTTACAGTACATAAGAGTATTCATACTGGGAAGAAACCATATGAGTGCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    462 GGAATGTGGGAAAGCTTTTCTAGTATATGGAAAGCTTACCCGGCATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGAATGTGGGAAAGCTTTTCTAGTATATGGAAAGCTTACCCGGCATCAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    512 GTACTCACACTGGTGAAAAACCCTTTGGGTGTGAGGAGTGTGGGAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTACTCACACTGGTGAAAAACCCTTTGGGTGTGAGGAGTGTGGGAAGGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    562 TTCAGTACCTTTTCATACCTGGTTCAACATCAGCGAATTCATACCAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTCAGTACCTTTTCATACCTGGTTCAACATCAGCGAATTCATACCAGTGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    612 AAAACCTTACGAATGCAAAGAATGTGGGAAGGCCTTTAGCACTAGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAAACCTTACGAATGCAAAGAATGTGGGAAGGCCTTTAGCACTAGCTCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    662 CCCTTGCTAAGCATCAGAGAATTCATACTGGCGAGAAACCCTATGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCCTTGCTAAGCATCAGAGAATTCATACTGGCGAGAAACCCTATGAATGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    712 AAGGAGTGTGGGAAGTCCTTCACTGTGTATGGACAGCTTACTCGACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AAGGAGTGTGGGAAGTCCTTCACTGTGTATGGACAGCTTACTCGACATCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    762 GAGTATTCATACTGGTGAGAAACCTTTTGAATGTAAGGAATGTGGAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAGTATTCATACTGGTGAGAAACCTTTTGAATGTAAGGAATGTGGAAAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    812 CCTTTAGACTTAGTTCCTTCCTTCATGCACATCAGCGAATTCATGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCTTTAGACTTAGTTCCTTCCTTCATGCACATCAGCGAATTCATGCAGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    862 ATAAAGCCCTACGGATGCAAGGAATGCGGGAAAACCTTCAGTCGTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 100851 ATAAAGCCCTACGGATGCAAGGAATGCGGGAGAACCTTCAGTCGTGCCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    912 ATATCTTGTTCAACATGGAAGACTTCACACTGGCGAGAAGCCCTGTGAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 100901 ATATCTTGTTCAACATGGAAGACTTCACACTGGCGAGAAGCCCTATGAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    962 GTAAGGAGTGTGGCAAGGCCTTTAGTACTGGCTCATACCTTGTTCAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GTAAGGAGTGTGGCAAGGCCTTTAGTACTGGCTCATACCTTGTTCAGCAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1012 CAGAGGATCCATACTGGGGAGAAACCCTATGAATGTAAGGAATGTGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CAGAGGATCCATACTGGGGAGAAACCCTATGAATGTAAGGAATGTGGCAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1062 AGCCTTTATTAGTCGCCATCAGCTTACCGTACATCAAAGGGTTCATACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AGCCTTTATTAGTCGCCATCAGCTTACCGTACATCAAAGGGTTCATACTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1112 GAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGGAATGTGGCAAGGCCTTCAGAGTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGGAATGTGGCAAGGCCTTCAGAGTGCAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1162 GTACATCTCACACAGCATCGGAAAATTCATACTGATGTAAAGCCCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GTACATCTCACACAGCATCGGAAAATTCATACTGATGTAAAGCCCTATGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1212 ATGTAAGGAATGTGGAAAGACTTTTAGTCGAGCCTCGTACCTTGTACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ATGTAAGGAATGTGGAAAGACTTTTAGTCGAGCCTCGTACCTTGTACAAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1262 ATAGCAGAATCCATACTGGTAAGAAGCCCTATGAGTGTAAGGAGTGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 ATAGCAGAATCCATACTGGTAAGAAGCCCTATGAGTGTAAGGAGTGTGGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1312 AAGGCCTTCAGTTCTGGCTCATACCTTGTTCAGCATCAAAGAATTCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AAGGCCTTCAGTTCTGGCTCATACCTTGTTCAGCATCAAAGAATTCATAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1362 TGGGGAGAAACCCTATGAATGTAACAAATGTGGGAAAGCCTTTACTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TGGGGAGAAACCCTATGAATGTAACAAATGTGGGAAAGCCTTTACTGTTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1412 ATGGACAACTTATTGGACATCAGAGTGTTCACACTGGTGAGAAACCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 ATGGACAACTTATTGGACATCAGAGTGTTCACACTGGTGAGAAACCTTTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1462 GAATGTAAGGAATGTGGGAAGGCCTTTAGACTTAATTCATTCCTTACTGA
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 GAATGTAAGGAATGCGGGAAGGCCTTTAGACTTAATTCATTCCTTACTGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1512 ACATCAGCGGGTACACACTGGTGAGAAACCCTTTAAATGCAAAAAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 ACATCAGCGGGTACACACTGGTGAGAAACCCTTTAAATGCAAAAAATGTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1562 GGAAGACCTTTAGATACAGTTCAGCCCTTAAAGTGCATCTGAGAAAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GGAAGACCTTTAGATACAGTTCAGCCCTTAAAGTGCATCTGAGAAAACAT

   1600     .    :    .
   1612 ATGAGTGTTATACCC
        |||||||||||||||
 101601 ATGAGTGTTATACCC