seq1 = pF1KB9734.tfa, 1458 bp
seq2 = pF1KB9734/gi568815596r_73191460.tfa (gi568815596r:73191460_73393317), 201858 bp

>pF1KB9734 1458
>gi568815596r:73191460_73393317 (Chr2)

(complement)

1-136  (100001-100136)   100% ->
137-1458  (100537-101858)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTCCACCTTAGCGAGTTTTCCGAACCCGACGCGCTCCTCGTCAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTCCACCTTAGCGAGTTTTCCGAACCCGACGCGCTCCTCGTCAAGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACTGAAGGCTGTTGCGCCGAACCCAGCGCTGAATTGCCCCGGCTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACTGAAGGCTGTTGCGCCGAACCCAGCGCTGAATTGCCCCGGCTGCCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAGGGACGCTCCCGCGGCCACCGGCTACCCTGGAG         CAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100101 CCAGGGACGCTCCCGCGGCCACCGGCTACCCTGGAGGTA...CAGCAGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACTTCTTGAGCTGGGCTTTGAACAGCTGCGGCGCAAGTGGGGACTTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100542 GACTTCTTGAGCTGGGCTTTGAACAGCTGCGGCGCAAGTGGGGACTTAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGACTCCTGCTTCCTGGAGGGGCCTGCGCCCACACCCCCTCCCGGCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100592 CGACTCCTGCTTCCTGGAGGGGCCTGCGCCCACACCCCCTCCCGGCCTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCTACAGCGGTAGCTTCTTCATTCAGGCAGTGCCCGAACACCCGCACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100642 GCTACAGCGGTAGCTTCTTCATTCAGGCAGTGCCCGAACACCCGCACGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCGGAGGCACTCTTCAACCTCATGTCGGGCATCTTAGGCCTGGCACCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100692 CCGGAGGCACTCTTCAACCTCATGTCGGGCATCTTAGGCCTGGCACCCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCCCGGTCCAGAGGCAGCAGCGTCCAGATCCCCGCTGGATGCCCCTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100742 CCCCGGTCCAGAGGCAGCAGCGTCCAGATCCCCGCTGGATGCCCCTTTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTGCGGGGTCCGATGCCTTGCTGCCGGGTCCGCCGGACCTTTACTCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100792 CTGCGGGGTCCGATGCCTTGCTGCCGGGTCCGCCGGACCTTTACTCCCCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GATCTGGGCGCTGCCCCTTTCCCAGAGGCGTTCTGGGAGGCCTCGCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100842 GATCTGGGCGCTGCCCCTTTCCCAGAGGCGTTCTGGGAGGCCTCGCCTTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CGCGGGTGCCCCCTCGCAGTGCCTGTATGAGCCTCAGCTCTCCCCGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100892 CGCGGGTGCCCCCTCGCAGTGCCTGTATGAGCCTCAGCTCTCCCCGCCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACGTCAAGCCCGGCCTCCGGGCGCCTCCCGCCTCGCCAGCGCTGGACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100942 ACGTCAAGCCCGGCCTCCGGGCGCCTCCCGCCTCGCCAGCGCTGGACGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GTCTCTGCCTTCAAGGGTCCCTACGCGCCCTGGGAGCTGCTTTCTGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100992 GTCTCTGCCTTCAAGGGTCCCTACGCGCCCTGGGAGCTGCTTTCTGTGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GGCCCCAGGGAACTGTGGGTCACAGGGAGACTACCAGGCCGCCCCGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101042 GGCCCCAGGGAACTGTGGGTCACAGGGAGACTACCAGGCCGCCCCGGAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CTCGTTTTCCCGTAATAGGGACCAAGATTGAGGACTTGCTGTCCATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101092 CTCGTTTTCCCGTAATAGGGACCAAGATTGAGGACTTGCTGTCCATCAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TGCCCTGCGGAACTGCCGGCCGTCCCAGCCAACAGACTCTATCCCAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101142 TGCCCTGCGGAACTGCCGGCCGTCCCAGCCAACAGACTCTATCCCAGCGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GGCCTATGACGCTTTCCCGCTGGCCCCGGGTGACTTAGGGGAGGGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101192 GGCCTATGACGCTTTCCCGCTGGCCCCGGGTGACTTAGGGGAGGGGGCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AGGGCCTCCCTGGGCTCCTGACCCCTCCTAGTGGGGAGGGAGGGAGTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101242 AGGGCCTCCCTGGGCTCCTGACCCCTCCTAGTGGGGAGGGAGGGAGTAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GGCGACGGCGGAGAGTTTCTGGCCAGTACGCAGCCTCAGCTTTCCCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101292 GGCGACGGCGGAGAGTTTCTGGCCAGTACGCAGCCTCAGCTTTCCCCGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GGGCCTTCGCAGCGCCGCCGCGGCGGACTTCCCTAAACCTCTGGTGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101342 GGGCCTTCGCAGCGCCGCCGCGGCGGACTTCCCTAAACCTCTGGTGGCGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 ACATCCCTGGAAGCAGTGGCGTGGCTGCACCACCCGTGCCGCCGCCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101392 ACATCCCTGGAAGCAGTGGCGTGGCTGCACCACCCGTGCCGCCGCCGCCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CCCACCCCTTTCCCCCAGGCCAAGGCGCGACGCAAGGGGCGCCGCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101442 CCCACCCCTTTCCCCCAGGCCAAGGCGCGACGCAAGGGGCGCCGCGGCGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 CAAATGCAGCACGCGCTGCTTCTGCCCGCGGCCGCACGCCAAGGCCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101492 CAAATGCAGCACGCGCTGCTTCTGCCCGCGGCCGCACGCCAAGGCCTTCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 CTTGCCCGGTGGAGAGTTGTGTGCGGAGCTTTGCGCGCTCCGACGAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101542 CTTGCCCGGTGGAGAGTTGTGTGCGGAGCTTTGCGCGCTCCGACGAGCTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 AATCGCCACCTGCGCATCCACACGGGCCACAAACCCTTCCAGTGCCGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101592 AATCGCCACCTGCGCATCCACACGGGCCACAAACCCTTCCAGTGCCGCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 CTGCCTCCGCAACTTCAGCCGCAGCGACCACCTCACCACGCACGTGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101642 CTGCCTCCGCAACTTCAGCCGCAGCGACCACCTCACCACGCACGTGCGCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 CCCACACCGGCGAGAAGCCTTTTGCTTGCGACGTGTGCGGCCGCCGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101692 CCCACACCGGCGAGAAGCCTTTTGCTTGCGACGTGTGCGGCCGCCGCTTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 GCGCGCAGCGATGAGAAGAAACGGCACAGCAAGGTGCACCTCAAGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101742 GCGCGCAGCGATGAGAAGAAACGGCACAGCAAGGTGCACCTCAAGCAGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 GGCGCGCGCCGAGGAGCGGCTCAAGGGCCTCGGCTTTTACTCGCTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101792 GGCGCGCGCCGAGGAGCGGCTCAAGGGCCTCGGCTTTTACTCGCTGGGCC

   1450     .    :    .
   1442 TCTCCTTCGCTTCTCTC
        |||||||||||||||||
 101842 TCTCCTTCGCTTCTCTC