seq1 = pF1KB9719.tfa, 1206 bp
seq2 = pF1KB9719/gi568815589r_136097328.tfa (gi568815589r:136097328_136303039), 205712 bp

>pF1KB9719 1206
>gi568815589r:136097328_136303039 (Chr9)

(complement)

1-94  (100001-100094)   100% ->
95-266  (102287-102458)   100% ->
267-469  (103160-103362)   100% ->
470-621  (103981-104132)   100% ->
622-790  (104220-104388)   100% ->
791-1206  (105297-105712)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGCGCGCGGGGAGCTGGGCCCGGCCCGGGAGTCGGCGGGAGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGCGCGCGGGGAGCTGGGCCCGGCCCGGGAGTCGGCGGGAGGCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCTGCTAGCACTGCTGGCGCGGAGGGCGGACCTGCGCCGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100051 CCTGCTGCTAGCACTGCTGGCGCGGAGGGCGGACCTGCGCCGAGGTG...

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     95    AGATCCCGCTGTGCGCTGGCTGTGACCAGCACATCCTGGACCGCTTC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102284 CAGAGATCCCGCTGTGCGCTGGCTGTGACCAGCACATCCTGGACCGCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCCTCAAGGCTCTGGACCGCCACTGGCACAGCAAGTGTCTCAAGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102334 ATCCTCAAGGCTCTGGACCGCCACTGGCACAGCAAGTGTCTCAAGTGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGACTGCCACACGCCACTGGCCGAGCGCTGCTTCAGCCGAGGGGAGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102384 CGACTGCCACACGCCACTGGCCGAGCGCTGCTTCAGCCGAGGGGAGAGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTTACTGCAAGGACGACTTTTTCAA         GCGCTTCGGGACCAAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102434 TTTACTGCAAGGACGACTTTTTCAAGTG...CAGGCGCTTCGGGACCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGCGCCGCGTGCCAGCTGGGCATCCCGCCCACGCAGGTGGTGCGCCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103176 TGCGCCGCGTGCCAGCTGGGCATCCCGCCCACGCAGGTGGTGCGCCGCGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCAGGACTTCGTGTACCACCTGCACTGCTTTGCCTGCGTCGTGTGCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103226 CCAGGACTTCGTGTACCACCTGCACTGCTTTGCCTGCGTCGTGTGCAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGCAGCTGGCCACGGGCGACGAGTTCTACCTCATGGAGGACAGCCGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103276 GGCAGCTGGCCACGGGCGACGAGTTCTACCTCATGGAGGACAGCCGGCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTGTGCAAGGCGGACTACGAAACCGCCAAGCAGCGAG         AGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 103326 GTGTGCAAGGCGGACTACGAAACCGCCAAGCAGCGAGGTC...CAGAGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CGAGGCCACGGCCAAGCGGCCGCGCACGACCATCACCGCCAAGCAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103985 CGAGGCCACGGCCAAGCGGCCGCGCACGACCATCACCGCCAAGCAGCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGACGCTGAAGAGCGCTTACAACACCTCGCCCAAGCCGGCGCGCCACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104035 AGACGCTGAAGAGCGCTTACAACACCTCGCCCAAGCCGGCGCGCCACGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CGCGAGCAGCTCTCGTCCGAGACGGGCCTGGACATGCGCGTGGTGCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 104085 CGCGAGCAGCTCTCGTCCGAGACGGGCCTGGACATGCGCGTGGTGCAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    622        GTTTGGTTCCAGAACCGCCGGGCCAAGGAGAAGAGGCTGAAGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104135 C...CAGGTTTGGTTCCAGAACCGCCGGGCCAAGGAGAAGAGGCTGAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGGACGCCGGCCGGCAGCGCTGGGGGCAGTATTTCCGCAACATGAAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104263 AGGACGCCGGCCGGCAGCGCTGGGGGCAGTATTTCCGCAACATGAAGCGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TCCCGCGGCGGCTCCAAGTCGGACAAGGACAGCGTTCAGGAGGGGCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104313 TCCCGCGGCGGCTCCAAGTCGGACAAGGACAGCGTTCAGGAGGGGCAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CAGCGACGCTGAGGTCTCCTTCCCCG         ATGAGCCTTCCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 104363 CAGCGACGCTGAGGTCTCCTTCCCCGGTA...CAGATGAGCCTTCCTTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CGGAAATGGGCCCGGCCAATGGCCTCTACGGGAGCTTGGGGGAACCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105312 CGGAAATGGGCCCGGCCAATGGCCTCTACGGGAGCTTGGGGGAACCCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CAGGCCTTGGGCCGGCCCTCGGGAGCCCTGGGCAACTTCTCCCTGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105362 CAGGCCTTGGGCCGGCCCTCGGGAGCCCTGGGCAACTTCTCCCTGGAGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TGGAGGCCTGGCAGGCCCAGAGCAGTACCGAGAGCTGCGTCCCGGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105412 TGGAGGCCTGGCAGGCCCAGAGCAGTACCGAGAGCTGCGTCCCGGCAGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CCTACGGTGTCCCCCCATCCCCCGCCGCCCCGCAGAGCCTCCCTGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105462 CCTACGGTGTCCCCCCATCCCCCGCCGCCCCGCAGAGCCTCCCTGGCCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CAGCCCCTCCTCTCCAGCCTGGTGTACCCAGACACCAGCTTGGGCCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105512 CAGCCCCTCCTCTCCAGCCTGGTGTACCCAGACACCAGCTTGGGCCTTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GCCCTCGGGAGCCCCCGGCGGGCCCCCACCCATGAGGGTGCTGGCAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105562 GCCCTCGGGAGCCCCCGGCGGGCCCCCACCCATGAGGGTGCTGGCAGGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 ACGGACCCAGTTCTGACCTATCCACGGGGAGCAGCGGGGGTTACCCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105612 ACGGACCCAGTTCTGACCTATCCACGGGGAGCAGCGGGGGTTACCCCGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 TTCCCTGCCAGCCCCGCCTCCTGGCTGGATGAGGTAGACCACGCTCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105662 TTCCCTGCCAGCCCCGCCTCCTGGCTGGATGAGGTAGACCACGCTCAGTT

   1250 
   1206 C
        |
 105712 C