seq1 = pF1KB9694.tfa, 756 bp
seq2 = pF1KB9694/gi568815588f_117443268.tfa (gi568815588f:117443268_117648229), 204962 bp

>pF1KB9694 756
>gi568815588f:117443268_117648229 (Chr10)

1-406  (100001-100406)   100% ->
407-591  (102365-102549)   100% ->
592-756  (104798-104962)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCCAGCCGGCGCCCAAGCGCTGCTTCACCATCGAGTCGCTGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCCAGCCGGCGCCCAAGCGCTGCTTCACCATCGAGTCGCTGGTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGGACAGTCCCCTGCCCGCCTCGCGCTCCGAGGACCCCATCCGTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAGGACAGTCCCCTGCCCGCCTCGCGCTCCGAGGACCCCATCCGTCCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGCACTCAGCTACGCTAACTCCAGCCCCATAAATCCGTTCCTCAACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGCACTCAGCTACGCTAACTCCAGCCCCATAAATCCGTTCCTCAACGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCCACTCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGTAGGGGCGTCTACTCCAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCCACTCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGTAGGGGCGTCTACTCCAACCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGACTTGGTGTTCGCCGAGGCGGTCTCGCACCCGCCCAACCCCGCCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGACTTGGTGTTCGCCGAGGCGGTCTCGCACCCGCCCAACCCCGCCGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAGTGCACCCGGTGCCGCCGCCGCACGCCCTGGCCGCCCACCCCCTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CAGTGCACCCGGTGCCGCCGCCGCACGCCCTGGCCGCCCACCCCCTACCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCCTCGCACTCGCCACACCCCCTATTCGCCTCGCAGCAGCGGGATCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCCTCGCACTCGCCACACCCCCTATTCGCCTCGCAGCAGCGGGATCCGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACCTTCTACCCCTGGCTCATCCACCGCTACCGATATCTGGGTCATCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CACCTTCTACCCCTGGCTCATCCACCGCTACCGATATCTGGGTCATCGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCCAAG         GGAACGACACTAGCCCCGAGAGTTTCCTTTTGCAC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCCAAGGTA...CAGGGAACGACACTAGCCCCGAGAGTTTCCTTTTGCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AACGCGCTGGCCCGAAAGCCCAAGCGGATCCGAACCGCCTTCTCCCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102400 AACGCGCTGGCCCGAAAGCCCAAGCGGATCCGAACCGCCTTCTCCCCGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CCAGCTTCTAAGGCTGGAACACGCCTTTGAGAAGAATCACTACGTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102450 CCAGCTTCTAAGGCTGGAACACGCCTTTGAGAAGAATCACTACGTGGTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GCGCCGAAAGGAAGCAGCTGGCACACAGCCTCAGCCTCACGGAAACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102500 GCGCCGAAAGGAAGCAGCTGGCACACAGCCTCAGCCTCACGGAAACTCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592          GTAAAAGTATGGTTTCAGAACCGAAGAACAAAGTTCAAAAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102550 GTG...CAGGTAAAAGTATGGTTTCAGAACCGAAGAACAAAGTTCAAAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GCAGAAGCTGGAGGAAGAAGGCTCAGATTCGCAACAAAAGAAAAAAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104839 GCAGAAGCTGGAGGAAGAAGGCTCAGATTCGCAACAAAAGAAAAAAGGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CGCACCATATTAACCGGTGGAGAATCGCCACCAAGCAGGCGAGTCCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104889 CGCACCATATTAACCGGTGGAGAATCGCCACCAAGCAGGCGAGTCCGGAG

    750     .    :    .    :
    733 GAAATAGACGTGACCTCAGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||
 104939 GAAATAGACGTGACCTCAGATGAT