seq1 = pF1KB9693.tfa, 756 bp
seq2 = pF1KB9693/gi568815579r_1754528.tfa (gi568815579r:1754528_1963497), 208970 bp

>pF1KB9693 756
>gi568815579r:1754528_1963497 (Chr19)

(complement)

1-457  (100001-100457)   100% ->
458-756  (108738-109036)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGCGGCCGTGGCGTGCGTGGATTACTTCGCCGCCGACGTGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGCGGCCGTGGCGTGCGTGGATTACTTCGCCGCCGACGTGCTCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCATCTCTTCGGGCGCCGTGGTGCACCGCGGGCGGCCCGGCCCCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCATCTCTTCGGGCGCCGTGGTGCACCGCGGGCGGCCCGGCCCCGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGCGGGCCCCGCCGCCGGCCTGGATGTGCGCGCGGCGCGCCGCGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGCGGGCCCCGCCGCCGGCCTGGATGTGCGCGCGGCGCGCCGCGAGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCTCACCCGGGACCCCGGGGCCACCCCCGCCGCCCCCCGCCGCTTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCTCACCCGGGACCCCGGGGCCACCCCCGCCGCCCCCCGCCGCTTCTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCGGGCCCCGGCGCCGCCGCGGCGCCCCACCTGCTGGCCGCCAGCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCGGGCCCCGGCGCCGCCGCGGCGCCCCACCTGCTGGCCGCCAGCATCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGCCGACCTGCGCGGCGGACCCGGAGCCGCCCCGGGGGGCGCCTCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGCCGACCTGCGCGGCGGACCCGGAGCCGCCCCGGGGGGCGCCTCGCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCTCCTCCTCCTCAGCCGCCTCGTCCCCGTCCTCGGGCCGCGCCCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCTCCTCCTCCTCAGCCGCCTCGTCCCCGTCCTCGGGCCGCGCCCCCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGCCGCGCCCTCCGCCGCCGCCAAGAGCCACCGCTGTCCCTTCCCGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGCCGCGCCCTCCGCCGCCGCCAAGAGCCACCGCTGTCCCTTCCCGGACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCGCCAAAGCCTACTACAAGTCCTCGCACCTAAAGTCGCACCTGCGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCGCCAAAGCCTACTACAAGTCCTCGCACCTAAAGTCGCACCTGCGGACG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CACACAG         GGGAACGCCCTTTTGCTTGTGACTGGCAGGGCTG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CACACAGGTG...CAGGGGAACGCCCTTTTGCTTGTGACTGGCAGGGCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CGACAAGAAGTTCGCCCGCTCCGACGAGCTGGCCCGCCACCACCGGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108772 CGACAAGAAGTTCGCCCGCTCCGACGAGCTGGCCCGCCACCACCGGACGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACACGGGCGAGAAGCGCTTCTCCTGCCCTCTGTGCTCCAAGCGCTTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108822 ACACGGGCGAGAAGCGCTTCTCCTGCCCTCTGTGCTCCAAGCGCTTCACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CGCAGTGACCACCTGGCCAAGCACGCCCGCCGCCACCCCGGCTTCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108872 CGCAGTGACCACCTGGCCAAGCACGCCCGCCGCCACCCCGGCTTCCACCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GGACCTGCTCCGGCGCCCTGGTGCCCGCAGTACCTCCCCCAGCGACTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108922 GGACCTGCTCCGGCGCCCTGGTGCCCGCAGTACCTCCCCCAGCGACTCGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGCCCTGCAGCCTGGCCGGGAGCCCTGCGCCCAGCCCCGCGCCCAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108972 TGCCCTGCAGCCTGGCCGGGAGCCCTGCGCCCAGCCCCGCGCCCAGCCCA

    750     .    :    .
    742 GCCCCCGCAGGCCTG
        |||||||||||||||
 109022 GCCCCCGCAGGCCTG